Bpm I

Название ферментаBpm I
ПрототипGsuI
Известные аналогиGsuI
АртикулSE-E467
Вариант TurboОтсутствует
Высококонцентрированная версияОтсутствует
Тип рестриктазыТип IIGiФерменты типа IIG объединяют рестриктазную и метилтрансферазную активности в одном полипептиде и часто стимулируются AdoMet или зависят от него., Тип IISiФерменты типа IIS распознают асимметричные последовательности ДНК и разрезают за пределами сайта узнавания на фиксированном расстоянии. Широко используются в Golden Gate сборке.
Сайт узнавания
5'… CTGGAG(N)16▼ …3'
3'… GACCTC(N)14▲ …5'
ИсточникBacillus pumilus
Оптимальный буферSE-буфер W (10 mM Tris-HCl (pH 8.5 при 25°C); 10 mM MgCl2; 100 mM NaCl; 1 mM DTT.)
Оптимальная температура37 °C
Температура инактивации65 °C
Активность в буферах
BGOWYROSE
25507510050100
Определение единицы активностиЗа единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК фага лямбда за 1 час при 37°С в 50 мкл реакционной смеси.
Субстрат для определения активностиДНК фага лямбда
Условия хранения10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 50 mM KCl; 0.1 mM EDTA; 7 mM 2-меркаптоэтанол; 200 ug/ml BSA, 50% глицерин; Хранить при -20°С.
ЛигированиеПосле гидролиза 2-кратным избытком фермента около 95% фрагментов ДНК сшиваются ДНК-лигазой и 95% из них могут быть повторно расщеплены.
Неспецифический гидролизКартина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 2 ед фермента в течение 16 часов при 37°С.
Чувствительность к метилированиюБлокируется при перекрывании dcm-метилированием (CmCWGG) 5'- C (5mC)TGG AG(N) 16 -3' 3'- G GA(5mC)C TC(N) 14 -5'
С ферментом поставляется10 Х SE-буфер W, BSA
ПримечанияДля достижения 100% активности BSA следует добавлять в реакционную смесь до концентрации 100 мкг/мл BSA при длительной инкубации использовать не рекомендуется.
Литература
  1. Неопубликованные данные Дегтярев С.Х., Морган Р Неопубликованные данные (1992).
// Код для некролога