Блокирование активности рестриктаз при полном или частичном перекрывании их сайтов узнавания метилированием

Рестриктаза Сайт узнавания Прототип Блокирование рестриктазы при полном или частичном перекрывании сайта узнавания метилированием
сопряжённой ДНК-метилазой dam
Gm6ATC
dcm
Cm5CWGG
M.SssI
m5CG
Aat II
5'… GACGT▼C …3'
3'… C▲TGCAG …5'
AatII G(m6A)CGTC      
Abs I
5'… CC▼TCGAGG …3'
3'… GGAGCT▲CC …5'
AbsI        
Acc16 I
5'… TGC▼GCA …3'
3'… ACG▲CGT …5'
MstI        
Acc36 I
5'… ACCTGC(N)4▼ …3'
3'… TGGACG(N)8▲ …5'
BspMI        
Acc65 I
5'… G▼GTACC …3'
3'… CCATG▲G …5'
KpnI     +  
AccB1 I
5'… G▼GYRCC …3'
3'… CCRYG▲G …5'
HgiCI        
AccB7 I
5'… CCANNNN▼NTGG …3'
3'… GGTN▲NNNNACC …5'
PflMI     +  
AccBS I
5'… GAG▼CGG …3'
3'… CTC▲GCC …5'
BsrBI        
Acl I
5'… AA▼CGTT …3'
3'… TTGC▲AA …5'
AclI       +
AclW I
5'… GGATC(N)4▼ …3'
3'… CCTAG(N)5▲ …5'
BinI   +    
Aco I
5'… Y▼GGCCR …3'
3'… RCCGG▲Y …5'
CfrI     +  
Acs I
5'… R▼AATTY …3'
3'… YTTAA▲R …5'
ApoI        
Acu I
5'… CTGAAG(N)16▼ …3'
3'… GACTTC(N)14▲ …5'
Eco57I        
Afe I
5'… AGC▼GCT …3'
3'… TCG▲CGA …5'
Eco47III        
Ags I
5'… TTS▼AA …3'
3'… AA▲STT …5'
AgsI TTSA(m6A)      
Ahl I
5'… A▼CTAGT …3'
3'… TGATC▲A …5'
SpeI        
Ajn I
5'… ▼CCWGG …3'
3'… GGWCC▲ …5'
EcoRII (m5C)CWGG   —  
Ale I
5'… CACNN▼NNGTG …3'
3'… GTGNN▲NNCAC …5'
OliI        
Alu I
5'… AG▼CT …3'
3'… TC▲GA …5'
AluI AG(m5C)T      
AluB I
5'… AG▼CT …3'
3'… TC▲GA …5'
AluI (m6A)GCT      
Ama87 I
5'… C▼YCGRG …3'
3'… GRGCY▲C …5'
AvaI        
Aox I
5'… ▼RG(5mC)Y …3'
3'… Y(5mC)GR▲ …5'
AoxI        
Apa I
5'… GGGCC▼C …3'
3'… C▲CCGGG …5'
ApaI     +  
Ars I
5'… ▼(N)8GACNNNNNNTTYG(N)11▼ …3'
3'… ▲(N)13CTGNNNNNNAARC(N)6▲ …5'
ArsI        
AsiG I
5'… A▼CCGGT …3'
3'… TGGCC▲A …5'
AgeI        
AsiS I
5'… GCGAT▼CGC …3'
3'… CGC▲TAGCG …5'
#Н/Д   —   +
AspA2 I
5'… C▼CTAGG …3'
3'… GGATC▲C …5'
AvrII        
AspLE I
5'… GCG▼C …3'
3'… C▲GCG …5'
HhaI       +
AspS9 I
5'… G▼GNCC …3'
3'… CCNG▲G …5'
Sau96I     +  
AsuC2 I
5'… CC▼SGG …3'
3'… GGS▲CC …5'
CauII        
AsuHP I
5'… GGTGA(N)8▼ …3'
3'… CCACT(N)7▲ …5'
HphI   +    
AsuNH I
5'… G▼CTAGC …3'
3'… CGATC▲G …5'
NheI        
BamH I
5'… G▼GATCC …3'
3'… CCTAG▲G …5'
BamHI GGAT(m4C)C —    
Bar I
5'… ▼(N)7GAAGNNNNNNTAC(N)12▼ …3'
3'… ▲(N)12CTTCNNNNNNATG(N)7▲ …5'
BarI        
Bbv12 I
5'… GWGCW▼C …3'
3'… C▲WCGWG …5'
HgiAI        
Bgl I
5'… GCCNNNN▼NGGC …3'
3'… CGGN▲NNNNCCG …5'
BglI     —  
Bgl II
5'… A▼GATCT …3'
3'… TCTAG▲A …5'
BglII   —    
Bls I Неверный формат сайта узнавания BlsI        
Bme18 I
5'… G▼GWCC …3'
3'… CCWG▲G …5'
AvaII     +  
Bmo I
5'… GG▼GWCCC …3'
3'… CCCWG▲GG …5'
SanDI        
Bmt I
5'… GCTAG▼C …3'
3'… C▲GATCG …5'
NheI        
Bmu I
5'… ACTGGG(N)5▼ …3'
3'… TGACCC(N)4▲ …5'
BfiI        
Bpm I
5'… CTGGAG(N)16▼ …3'
3'… GACCTC(N)14▲ …5'
GsuI        
Bpu10 I
5'… CC▼TNAGC …3'
3'… GGANT▲CG …5'
Bpu10I        
Bpu14 I
5'… TT▼CGAA …3'
3'… AAGC▲TT …5'
AsuII        
Bsa29 I
5'… AT▼CGAT …3'
3'… TAGC▲TA …5'
ClaI   +    
Bsc4 I
5'… CCNNNNN▼NNGG …3'
3'… GGNN▲NNNNNCC …5'
BsiYI        
Bse1 I
5'… ACTGGN▼ …3'
3'… TGAC▲CN …5'
BsrI        
Bse118 I
5'… R▼CCGGY …3'
3'… YGGCC▲R …5'
Cfr10I        
Bse21 I
5'… CC▼TNAGG …3'
3'… GGANT▲CC …5'
SauI        
Bse3D I
5'… GCAATGNN▼ …3'
3'… CGTTAC▲NN …5'
BsrDI        
Bse8 I
5'… GATNN▼NNATC …3'
3'… CTANN▲NNTAG …5'
BsaBI        
BseP I
5'… G▼CGCGC …3'
3'… CGCGC▲G …5'
BsePI        
BseX3 I
5'… C▼GGCCG …3'
3'… GCCGG▲C …5'
XmaIII        
BslF I
5'… GGGAC(N)10▼ …3'
3'… CCCTG(N)14▲ …5'
FinI        
Bso31 I
5'… GGTCTCN▼ …3'
3'… CCAGAG(N)5▲ …5'
Eco31I        
Bsp13 I
5'… T▼CCGGA …3'
3'… AGGCC▲T …5'
BspMII   +    
Bsp1720 I
5'… GC▼TNAGC …3'
3'… CGANT▲CG …5'
EspI        
Bsp19 I
5'… C▼CATGG …3'
3'… GGTAC▲C …5'
NcoI (m4C)CATGG(m5C)CATGG/GGTAC(m5C)      
BspAC I
5'… C▼CGC …3'
3'… GGC▲G …5'
AciI       +
BspFN I
5'… CG▼CG …3'
3'… GC▲GC …5'
FnuDII       +
BssEC I
5'… C▼CNNGG …3'
3'… GGNNC▲C …5'
SecI (m4C)CNNGG      
BssNA I
5'… GTA▼TAC …3'
3'… CAT▲ATG …5'
SnaI        
BssT1 I
5'… C▼CWWGG …3'
3'… GGWWC▲C …5'
StyI        
Bst2B I
5'… C▼TCGTG …3'
3'… GAGCA▲C …5'
BsiI        
Bst2U I
5'… CC▼WGG …3'
3'… GGW▲CC …5'
BstNI     —  
Bst4C I
5'… ACN▼GT …3'
3'… TG▲NCA …5'
Tsp4CI        
Bst6 I
5'… CTCTTCN▼ …3'
3'… GAGAAG(N)4▲ …5'
Ksp632I        
BstAC I
5'… GR▼CGYC …3'
3'… CYGC▲RG …5'
AcyI        
BstAF I
5'… C▼TTAAG …3'
3'… GAATT▲C …5'
AflII        
BstAP I
5'… GCANNNN▼NTGC …3'
3'… CGTN▲NNNNACG …5'
(ApaBI)        
BstAU I
5'… T▼GTACA …3'
3'… ACATG▲T …5'
Bsp1407I        
BstBA I
5'… YAC▼GTR …3'
3'… RTG▲CAY …5'
BsaAI       +
BstC8 I
5'… GCN▼NGC …3'
3'… CGN▲NCG …5'
Cac8I G(m5C)NNGC      
BstDE I
5'… C▼TNAG …3'
3'… GANT▲C …5'
DdeI        
BstDS I
5'… C▼CRYGG …3'
3'… GGYRC▲C …5'
DsaI        
BstEN I
5'… CCTNN▼NNNAGG …3'
3'… GGANNN▲NNTCC …5'
EcoNI     —  
BstF5 I
5'… GGATGNN▼ …3'
3'… CCTAC▲NN …5'
(FokI)        
BstFN I
5'… CG▼CG …3'
3'… GC▲GC …5'
FnuDII       +
BstH2 I
5'… RGCGC▼Y …3'
3'… Y▲CGCGR …5'
HaeII        
BstHH I
5'… GCG▼C …3'
3'… C▲GCG …5'
HhaI       +
BstKT I
5'… GAT▼C …3'
3'… C▲TAG …5'
MboI   +    
BstMA I
5'… GTCTCN▼ …3'
3'… CAGAG(N)5▲ …5'
BsmAI        
BstMB I
5'… ▼GATC …3'
3'… CTAG▲ …5'
MboI   +    
BstMC I
5'… CGRY▼CG …3'
3'… GC▲YRGC …5'
McrI        
BstMW I
5'… GCNNNNN▼NNGC …3'
3'… CGNN▲NNNNNCG …5'
MwoI G(m5C)NNNNNNNGC      
BstNS I
5'… RCATG▼Y …3'
3'… Y▲GTACR …5'
NspI        
BstPA I
5'… GACNN▼NNGTC …3'
3'… CTGNN▲NNCAG …5'
PshAI        
BstSC I
5'… ▼CCNGG …3'
3'… GGNCC▲ …5'
ScrFI     +  
BstSF I
5'… C▼TRYAG …3'
3'… GAYRT▲C …5'
SfeI        
BstSL I
5'… GKGCm▼C …3'
3'… C▲mCGKG …5'
BseSI GKG(m5C)MC   —  
BstSN I
5'… TAC▼GTA …3'
3'… ATG▲CAT …5'
SnaBI        
BstV1 I
5'… GCAGC(N)8▼ …3'
3'… CGTCG(N)12▲ …5'
BbvI        
BstV2 I
5'… GAAGAC(N)2▼ …3'
3'… CTTCTG(N)6▲ …5'
BbvII        
BstX I
5'… CCANNNNN▼NTGG …3'
3'… GGTN▲NNNNNACC …5'
BstXI        
BstX2 I
5'… R▼GATCY …3'
3'… YCTAG▲R …5'
XhoII   —    
Bsu I
5'… GTATCC(N)6▼ …3'
3'… CATAGG(N)5▲ …5'
BciVI        
BsuR I
5'… GG▼CC …3'
3'… CC▲GG …5'
HaeIII        
Btr I
5'… CAC▼GTC …3'
3'… GTG▲CAG …5'
BtrI        
Cci I
5'… T▼CATGA …3'
3'… AGTAC▲T …5'
BspHI        
CciN I
5'… GC▼GGCCGC …3'
3'… CGCCGG▲CG …5'
NotI       +
Dra I
5'… TTT▼AAA …3'
3'… AAA▲TTT …5'
AhaIII        
Dra III
5'… CACNNN▼GTG …3'
3'… GTG▲NNNCAC …5'
DraIII        
Dri I
5'… GACNNN▼NNGTC …3'
3'… CTGNN▲NNNCAG …5'
Eam1105I        
DseD I
5'… GACNNNN▼NNGTC …3'
3'… CTGNN▲NNNNCAG …5'
DrdI        
EcoICR I
5'… GAG▼CTC …3'
3'… CTC▲GAG …5'
SacI        
EcoR I
5'… G▼AATTC …3'
3'… CTTAA▲G …5'
EcoRI GA(m6A)TTC      
EcoR V
5'… GAT▼ATC …3'
3'… CTA▲TAG …5'
EcoRV        
Ege I
5'… GGC▼GCC …3'
3'… CCG▲CGG …5'
NarI        
EmiS6 I
5'… CTCTTC(N)1▼ …3'
3'… GAGAAG(N)4▲ …5'
Ksp632I        
Erh I
5'… C▼CWWGG …3'
3'… GGWWC▲C …5'
StyI        
Fae I
5'… CATG▼ …3'
3'… ▲GTAC …5'
NlaIII C(m6A)TG      
Fai I
5'… YA▼TR …3'
3'… RT▲AY …5'
FaiI        
Fal I
5'… ▼(N)8AAGNNNNNCTT(N)13▼ …3'
3'… ▲(N)13TTCNNNNNGAA(N)8▲ …5'
FalI        
Fat I
5'… ▼CATG …3'
3'… GTAC▲ …5'
NlaIII (m5C)ATG      
Fau I
5'… CCCGC(N)4▼ …3'
3'… GGGCG(N)6▲ …5'
FauI       +
FauND I
5'… CA▼TATG …3'
3'… GTAT▲AC …5'
NdeI        
Fbl I
5'… GT▼mKAC …3'
3'… CAKm▲TG …5'
AccI        
Fok I
5'… GGATG(N)9▼ …3'
3'… CCTAC(N)13▲ …5'
FokI        
FriO I
5'… GRGCY▼C …3'
3'… C▲YCGRG …5'
BanII        
Fsp4H I
5'… GC▼NGC …3'
3'… CGN▲CG …5'
Fnu4HI G(m5C)NGC      
Gla I
5'… R(5mC)▼GY …3'
3'… YG▲(5mC)R …5'
GlaI        
Glu I
5'… G(5mC)▼NG(5mC) …3'
3'… (5mC)GN▲(5mC)G …5'
GluI        
Gsa I
5'… CCCAG▼C …3'
3'… G▲GGTCG …5'
BseYI        
Hae III
5'… GG▼CC …3'
3'… CC▲GG …5'
HaeIII GG(m5C)C      
Hga I
5'… GACGC(N)5▼ …3'
3'… CTGCG(N)10▲ …5'
HgaI       +
Hind II
5'… GTY▼RAC …3'
3'… CAR▲YTG …5'
HindII        
Hind III
5'… A▼AGCTT …3'
3'… TTCGA▲A …5'
HindIII        
Hinf I
5'… G▼ANTC …3'
3'… CTNA▲G …5'
HinfI        
Hpa I
5'… GTT▼AAC …3'
3'… CAA▲TTG …5'
HpaI       +
Hpa II
5'… C▼CGG …3'
3'… GGC▲C …5'
HpaII C(m5C)GG
а так же MspI-метилированием:(m5C)CGG
    +
HpySE526 I
5'… A▼CGT …3'
3'… TGC▲A …5'
MaeII        
HspA I
5'… G▼CGC …3'
3'… CGC▲G …5'
HhaI       +
Kpn I
5'… GGTAC▼C …3'
3'… C▲CATGG …5'
KpnI     —  
Kro I
5'… G▼C(5mC)GGC …3'
3'… CGG(5mC)C▲G …5'
KroI        
KroN I
5'… GCC▼GGC …3'
3'… CGG▲CCG …5'
NaeI       +
Ksp22 I
5'… T▼GATCA …3'
3'… ACTAG▲T …5'
BclI   +    
Kzo9 I
5'… ▼GATC …3'
3'… CTAG▲ …5'
MboI   —   + GAT(m5C)G
Lmn I
5'… GCTCCN▼ …3'
3'… CGAG▲GN …5'
LmnI        
Mab I
5'… A▼CCWGGT …3'
3'… TGGWCC▲A …5'
SexAI     —  
Mal I
5'… G(mA)▼TC …3'
3'… CT▲(mA)G …5'
DpnI        
Mbo II
5'… GAAGA(N)8▼ …3'
3'… CTTCT(N)7▲ …5'
MboII   +    
Mfe I
5'… C▼AATTG …3'
3'… GTTAA▲C …5'
MfeI        
Mhl I
5'… GDGCH▼C …3'
3'… C▲HCGDG …5'
SduI        
Mlu I
5'… A▼CGCGT …3'
3'… TGCGC▲A …5'
MluI        
Mly113 I
5'… GG▼CGCC …3'
3'… CCGC▲GG …5'
NarI        
Mnl I
5'… CCTC(N)7▼ …3'
3'… GGAG(N)6▲ …5'
MnlI       +CCT(m5C)G
Mox20 I
5'… TGG▼CCA …3'
3'… ACC▲GGT …5'
BalI     +  
MroN I
5'… G▼CCGGC …3'
3'… CGGCC▲G …5'
(NaeI)        
MroX I
5'… GAANN▼NNTTC …3'
3'… CTTNN▲NNAAG …5'
XmnI        
Msp I
5'… C▼CGG …3'
3'… GGC▲C …5'
HpaII (m5C)CGG     —
MspA1 I
5'… CmG▼CKG …3'
3'… GKC▲GmC …5'
NspBII        
MspR9 I
5'… CC▼NGG …3'
3'… GGN▲CC …5'
ScrFI     +  
Mte I
5'… G(5mC)G(5mC)▼NG(5mC)G(5mC) …3'
3'… (5mC)G(5mC)GN▲(5mC)G(5mC)G …5'
Mte        
Nru I
5'… TCG▼CGA …3'
3'… AGC▲GCT …5'
NruI   +    
PalA I
5'… GG▼CGCGCC …3'
3'… CCGCGC▲GG …5'
AscI       +
Pce I
5'… AGG▼CCT …3'
3'… TCC▲GGA …5'
StuI        
Pci I
5'… A▼CATGT …3'
3'… TGTAC▲A …5'
BspLU11I (m6A)CATGT      
PciS I
5'… GCTCTTCN▼ …3'
3'… CGAGAAG(N)4▲ …5'
SapI        
Pcs I
5'… (5mC)GNNNNN▼NN(5mC)G …3'
3'… G(5mC)NN▲NNNNNG(5mC) …5'
PcsI        
Pct I
5'… GAATGCN▼ …3'
3'… CTTAC▲GN …5'
BsmI        
Pec I
5'… TTA▼TAA …3'
3'… AAT▲ATT …5'
PsiI        
Pkr I
5'… G(5mC)N▼G(5mC) …3'
3'… (5mC)G▲N(5mC)G …5'
PkrI        
Ple19 I
5'… CGAT▼CG …3'
3'… GC▲TAGC …5'
PvuI   —    
Pps I
5'… GAGTC(N)4▼ …3'
3'… CTCAG(N)5▲ …5'
PleI        
Pse31 I
5'… GGTCTC(N)1▼ …3'
3'… CCAGAG(N)5▲ …5'
Eco31I        
Psi I
5'… TTA▼TAA …3'
3'… AAT▲ATT …5'
PsiI        
Psp124B I
5'… GAGCT▼C …3'
3'… C▲TCGAG …5'
SacI        
Psp6 I
5'… ▼CCWGG …3'
3'… GGWCC▲ …5'
EcoRII   +    
PspC I
5'… CAC▼GTG …3'
3'… GTG▲CAC …5'
PmaCI        
PspE I
5'… G▼GTNACC …3'
3'… CCANTG▲G …5'
BstEII        
PspL I
5'… C▼GTACG …3'
3'… GCATG▲C …5'
SplI        
PspN4 I
5'… GGN▼NCC …3'
3'… CCN▲NGG …5'
NlaIV GGNN(m5C)C      
PspOM I
5'… G▼GGCCC …3'
3'… CCCGG▲G …5'
(ApaI)        
PspPP I
5'… RG▼GWCCY …3'
3'… YCCWG▲GR …5'
PpuMI     +  
PspX I
5'… VC▼TCGAGB …3'
3'… BGAGCT▲CV …5'
PspXI        
Psr I
5'… ▼(N)7GAACNNNNNNTAC(N)12▼ …3'
3'… ▲(N)12CTTGNNNNNNATG(N)7▲ …5'
PsrI        
Pst I
5'… CTGCA▼G …3'
3'… G▲ACGTC …5'
PstI        
PstN I
5'… CAGNNN▼CTG …3'
3'… GTC▲NNNGAC …5'
AlwNI        
Pvu II
5'… CAG▼CTG …3'
3'… GTC▲GAC …5'
PvuII        
Rga I
5'… GCGAT▼CGC …3'
3'… CGC▲TAGCG …5'
SgfI   —    
Rig I
5'… GGCCGG▼CC …3'
3'… CC▲GGCCGG …5'
FseI GG(m5C)CGGCC     +
Rsa I
5'… GT▼AC …3'
3'… CA▲TG …5'
RsaI        
RsaN I
5'… G▼TAC …3'
3'… CAT▲G …5'
RsaI        
Rsr2 I
5'… CG▼GWCCG …3'
3'… GCCWG▲GC …5'
RsrII        
Sal I
5'… G▼TCGAC …3'
3'… CAGCT▲G …5'
SalI        
Sbf I
5'… CCTGCA▼GG …3'
3'… GG▲ACGTCC …5'
Sse8387I        
Set I
5'… ASST▼ …3'
3'… ▲TSSA …5'
SetI        
SfaN I
5'… GCATC(N)5▼ …3'
3'… CGTAG(N)9▲ …5'
SfaNI        
Sfi I
5'… GGCCNNNN▼NGGCC …3'
3'… CCGGN▲NNNNCCGG …5'
SfiI     +GGC(m5C)WGGNNGGCC  
Sfr274 I
5'… C▼TCGAG …3'
3'… GAGCT▲C …5'
XhoI CTCG(m6A)G      
Sfr303 I
5'… CCGC▼GG …3'
3'… GG▲CGCC …5'
SacII        
Sma I
5'… CCC▼GGG …3'
3'… GGG▲CCC …5'
SmaI        
Smi I
5'… ATTT▼AAAT …3'
3'… TAAA▲TTTA …5'
SwaI        
SmiM I
5'… CAYNN▼NNRTG …3'
3'… GTRNN▲NNYAC …5'
MslI        
Sph I
5'… GCATG▼C …3'
3'… C▲GTACG …5'
SphI        
Sse9 I
5'… ▼AATT …3'
3'… TTAA▲ …5'
Tsp509I A(m6A)TT      
Ssp I
5'… AAT▼ATT …3'
3'… TTA▲TAA …5'
SspI A(m6A)TATT      
SspM I
5'… C▼TAG …3'
3'… GAT▲C …5'
BfaI        
Taq I
5'… T▼CGA …3'
3'… AGC▲T …5'
TaqI        
Tru9 I
5'… T▼TAA …3'
3'… AAT▲T …5'
MseI TTA(m6A)      
TseF I
5'… ▼GTSAC …3'
3'… CASTG▲ …5'
Tsp45I        
Tth111 I
5'… GACN▼NNGTC …3'
3'… CTGNN▲NCAG …5'
Tth111I        
Vne I
5'… G▼TGCAC …3'
3'… CACGT▲G …5'
ApaLI        
Vsp I
5'… AT▼TAAT …3'
3'… TAAT▲TA …5'
VspI ATTA(m6A)T      
Xba I
5'… T▼CTAGA …3'
3'… AGATC▲T …5'
XbaI   +    
Xma I
5'… C▼CCGGG …3'
3'… GGGCC▲C …5'
XmaI        
Zra I
5'… GAC▼GTC …3'
3'… CTG▲CAG …5'
(AatII)        
Zrm I
5'… AGT▼ACT …3'
3'… TCA▲TGA …5'
ScaI        
Zsp2 I
5'… ATGCA▼T …3'
3'… T▲ACGTA …5'
NsiI        
+ — блокирование активности; — — отсутствие блокирования по данным исходной таблицы; пустая ячейка — данных нет.
// Код для некролога