BslF I

Название ферментаBslF I
ПрототипFinI
Известные аналогиBsmFI, FaqI
АртикулSE-E479
Вариант TurboОтсутствует
Высококонцентрированная версияОтсутствует
Тип рестриктазыТип IISiФерменты типа IIS распознают асимметричные последовательности ДНК и разрезают за пределами сайта узнавания на фиксированном расстоянии. Широко используются в Golden Gate сборке.
Сайт узнавания
5'… GGGAC(N)10▼ …3'
3'… CCCTG(N)14▲ …5'
ИсточникBacillus stearothermophilus Fl
Оптимальный буферSE-буфер Y + BSA
Оптимальная температура37 °C
Температура инактивации80 °C
Активность в буферах
BGOWYROSE
2525102510050
Определение единицы активностиЗа единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК фага лямбда за 1 час при 37°С в 50 мкл реакционной смеси.
Субстрат для определения активностиДНК фага лямбда
Условия хранения10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 250 mM NaCl; 0.1 mM EDTA; 7 mM 2-меркаптоэтанол; 50% глицерин; Хранить при -20°С.
ЛигированиеПосле гидролиза 3-кратным избытком фермента более 90% фрагментов ДНК сшиваются ДНК-лигазой и 95% из них могут быть повторно расщеплены.
Неспецифический гидролизКартина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 1 ед фермента в течение 16 часов при 37°С.
Чувствительность к метилированиюне проверялось
С ферментом поставляется10 Х SE-буфер Y, BSA
ПримечанияВысокая концентрация фермента в реакционной смеси приводит к появлению звездчатой активности. Для достижения 100% активности BSA следует добавлять в реакционную смесь до концентрации 100 мкг/мл BSA при длительной инкубации использовать не рекомендуется. В присутствии SAM фермент проявляет ДНК-метилтрансферазную активность, максимальную при 48°С. При наличии в в реакционной смеси 10мМ MgCl 2 рестриктазная и метилтрансферазная активности проявляются одновременно и ДНК гидролизуется специфически и полностью. При отсутствии MgCl 2 ДНК только метилируется и впоследствии устойчива к гидролизу BslFI. Фермент также расщепляет ДНК в положении 11/15 от сайта узнавания. BSA при длительной инкубации использовать не рекомендуется.
Литература
  1. Неопубликованные данные Надеев А.Н., Каширина Ю.Г., Наякшина Т.Н., Дедков В.С., Мезенцева Н.В., Томилова Ю.Э., Дегтярев С.Х Неопубликованные данные (2004).
// Код для некролога