Субстратная специфичность новой рестриктазы SetI
// Биотехнология и биоинженерия: материалы конференции (2006)
Set I
| Название фермента | Set I | ||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Прототип | SetI | ||||||||||||
| Артикул | SE-E537 | ||||||||||||
| Вариант Turbo | Отсутствует | ||||||||||||
| Высококонцентрированная версия | Доступна | ||||||||||||
| Тип рестриктазы | Тип IIPiФерменты типа IIP — классические рестриктазы типа II с палиндромными сайтами узнавания и симметричными сайтами разрезания. | ||||||||||||
| Сайт узнавания | 5'… ASST▼ …3' 3'… ▲TSSA …5' |
||||||||||||
| Источник | Из штамма E.coli несущего клонированный ген SetI из Streptomyces werraensis 37 | ||||||||||||
| Оптимальный буфер | SE-буфер Y (33 mM Tris-ацетат (pH 7.9 при 25°C); 10 mM магний-ацетат; 66 mM калий-ацетат; 1 mM DTT.) | ||||||||||||
| Оптимальная температура | 55 °C | ||||||||||||
| Температура инактивации | 80 °C | ||||||||||||
| Активность в буферах |
|
||||||||||||
| Определение единицы активности | За единицу активности принимается количество фермента необходимое для гидролиза 1 pmol олигонуклеотидного дуплекса указанной структуры за 1 час при 55°С в 20 μl реакционной смеси | ||||||||||||
| Субстрат для определения активности | Олигонуклеотидный дуплекс 5`-CGAGTTTAT AGCT GGGCCCAAC-3` 3`-GCTCAAATA TCGA CCCGGGTTG-5` |
||||||||||||
| Условия хранения | 10 mM Tris-HCl (pH 7.6); 100 mM NaCl; 0.1 mM EDTA; 1 mM DTT; 50% глицерин; Хранить при -20°С. | ||||||||||||
| Лигирование | После гидролиза 5-кратным избытком фермента около 50% фрагментов pBR322 ДНК сшиваются Т4 ДНК-лигазой и могут быть повторно расщеплены. | ||||||||||||
| Неспецифический гидролиз | |||||||||||||
| Чувствительность к метилированию | не проверялось | ||||||||||||
| С ферментом поставляется | 10 Х SE-буфер Y. | ||||||||||||
| Примечания | Внимание! SetI расщепляет канонический сайт и ряд других сайтов с меньшей активностью. При длительной инкубации фермент может гидролизовать ДНК до коротких олигонуклеотидов. | ||||||||||||
| Литература |