FauND I

Название фермента FauND I
Прототип NdeI
Известные аналоги NdeI
Артикул SE-E009
Вариант Turbo Доступен
Высококонцентрированная версия Отсутствует
Тип рестриктазы Тип IIPiФерменты типа IIP — классические рестриктазы типа II с палиндромными сайтами узнавания и симметричными сайтами разрезания.
Сайт узнавания
5'… CATATG …3'
3'… GTATAC …5'
Источник Из штамма E.coli несущего клонированный ген FauND I из Flavobacterium aquatili ND
Оптимальный буфер SE-буфер Y (33 mM Tris-ацетат (pH 7.9 при 25°C); 10 mM магний-ацетат; 66 mM калий-ацетат; 1 mM DTT.)
Оптимальная температура 37 °C
Температура инактивации 65 °C
Активность в буферах
BGOWYROSE
50751050100100
Определение единицы активности За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК фага лямбда за 1 час при 37°С в 50 мкл реакционной смеси.
Субстрат для определения активности ДНК фага лямбда
Условия хранения 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 50 mM KCl; 0,1 mM EDTA; 200 ug/ml BSA; 1mM DTT; 50% глицерин; Хранить при -20°С.
Лигирование После гидролиза 10-кратным избытком фермента 80% фрагментов ДНК сшиваются ДНК-лигазой и могут быть повторно расщеплены. В присутствии 10% PEG сшивка более эффективна.
Неспецифический гидролиз Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 10 ед фермента в течение 16 часов при 37°С.
Чувствительность к метилированию не проверялось
С ферментом поставляется 10 Х SE-буфер Y, BSA (кроме E009T и E010T). Для фасовок Turbo (E009T и E010T) прикладывается только буфер ROSE.
Примечания Фермент чувствителен к примесям в некоторых ДНК. Например, ДНК очищенная по стандартному минипрепаративному протоколу гидролизуется плохо. Для достижения 100% активности BSA следует добавлять в реакционную смесь до концентрации 100 мкг/мл. BSA при длительной инкубации использовать не рекомендуется.
Литература
  1. Неопубликованные данные Шевченко A.В., Беличенко O.A., Мякишева T.В., Дедков В.С., Абдурашитов M.A., Дегтярев С.Х Неопубликованные данные (1995).
// Код для некролога