Акишев А.Г., Нетесова Н.А., Абдурашитов М.А., Дегтярев С.Х. Изучение метилирования сайтов RCGY в регуляторной области гена FAM19A4 в препаратах ДНК клеточных линий человека методом GLAD-ПЦР анализа // Эпигенетическая ДНК диагностика, DOI: 10.26213/SE.2021.97.62.001 (2021)
Акишев А.Г., Нетесова Н.А., Абдурашитов М.А., Дегтярев С.Х. Определение полиморфизма 5mC/T в повторе AluSx (CHR16: 75033884) в препаратах ДНК из крови человека методами GlaI- и FatI-ПЦР анализа // Эпигенетическая ДНК диагностика, DOI: 10.26213/SE.2021.11.76.001 (2021)
Акишев А.Г., Нетесова Н.А., Абдурашитов М.А., Вихлянов И.В., Никитин М.К., Карпов А.Б., Дегтярев С.Х. Оценка риска возникновения рака молочной железы и рака желудка путем определения вариантов полиморфизма 5mC/T в интроне гена KIF26B в положении хр1: 245618129 // Эпигенетическая ДНК диагностика, DOI: 10.26213/SE.2019.78.40307 (2021)
Акишев А.Г., Нетесова Н.А., Абдурашитов М.А., Дегтярев С.Х. Определение полиморфизма 5mC/T в позиции Chr1: 245618129 в препаратах ДНК из крови человека методами GlaI- и FatI-ПЦР анализа // Эпигенетическая ДНК диагностика, DOI: 10.26213/SE.2019.69.42836 (2021)
Акишев А.Г., Нетесова Н.А., Абдурашитов М.А., Дегтярев С.Х. Выщепление рестриктазой амплифицируемого фрагмента ДНК как способ исключения ошибочных результатов ПЦР в реальном времени c TaqMan зондом // ДНК-узнающие ферменты, DOI: 10.26213/SE.2021.45.29.001 (2021)
Б. С. Малышев, Н. А. Нетесова, Н. А. Сметанникова, М. А. Абдурашитов, А. Г. Акишев, Е. В. Дубинин, А. З. Азанов, И. В. Вихлянов, М. К. Никитин, А. Б. Карпов, С. Х. Дегтярев GlaD-ПЦР-анализ сайтов метилирования ДНК в регуляторных областях генов-онкосупрессоров при раке желудка//Acta Naturae, 2020, том 12, № 3(46): 124-133
А.Г. Акишев, Н.А. Нетесова, М.А. Абдурашитов, И.В. Вихлянов, М.К. Никитин, А.Б. Карпов, С.Х. Дегтярев GlaI-ПЦР анализ метилирования сайта ACGC в хp11: 65647266 в препаратах ДНК клеток крови в норме и на ранних стадиях рака молочной железы // Эпигенетическая ДНК диагностика, DOI: 10.26213/SE.2019.66.12.001 (2019)
Абдурашитов М.А., Томилов В.Н., Гончар Д.А., Снежкина А.В., Краснов Г.С., Кудрявцева А.В., Дегтярев С.Х. (2019) Сравнительный анализ метилирования сайтов RCGY в геномах клеточных линий L-68, Raji и U-937 Эпигененическая ДНК диагностика, том 2019(1), DOI: 10.26213/SE.2019.76.40116
Smetannikova NA, Evdokimov AA, Netesova NA, Abdurashitov MA, Akishev AG, Dubinin EV, Pozdnyakov PI, Vihlyanov IV, Nikitin MK, Topolnitsky EB, Karpov AB, Kolomiets SA, Degtyarev SK Application of GLAD-PCR Assay for Study on DNA Methylation in Regulatory Regions of Some Tumor-Suppressor Genes in Lung Cancer// Zhongguo Fei Ai Za Zhi. 2019 Sep 20;22(9):551-561
В.А. Чернухин, Д.А. Гончар, М.А. Абдурашитов, Т.Н. Наякшина, В.С. Дедков, Н.А. Михненкова, Е.Н. Ломаковская, С.Н.Дементьев1, С.Х. Дегтярев НОВАЯ ЭНДОНУКЛЕАЗА РЕСТРИКЦИИ LmnI УЗНАЕТ И РАСЩЕПЛЯЕТ НЕПАЛИНДРОМНУЮ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ ДНК 5`-GCTCC(1/-1)-3` // ДНК-узнающие ферменты, DOI: 10.26213/SE.2019.99.27373, (2019)
Viktor Tomilov, Murat Abdurashitov, Danila Gonchar, Anastasiya Snezhkina, George Krasnov, Anna Kudryavtseva and Sergey Degtyarev Comparative analysis of RCGY sites methylation in the genomes of Raji and U-937 malignant and normal lung fibroblast cell lines // Cancer Epigenetics and Biomarkers, Osaka, Japan, Октябрь 2017
Fomenkov A, Vincze T, Degtyarev SK, Roberts RJ. Complete Genome Sequence and Methylome Analysis of Acinetobacter calcoaceticus 65.//Genome Announc. 2017 Mar 23;5(12). pii: e00060-17. doi: 10.1128/genomeA.00060-17.(2017)
A.G. Akishev et al. GLAD-PCR assay of selected R(5mC)GY sites in URB1 and CEPBD genes in human genome // Res J Pharm Biol Chem Sci, 8(1): pp.465-475, 2017
Абдурашитов М.А., Дегтярев С.X. Применение сайт-специфических ДНК-эндонуклеаз в полногеномном анализе ДНК человека // Генетика, Том 53, № 1, Стр. 3-11 (2017)
Evdokimov et al. GLAD-PCR Assay of DNA Methylation Markers Associated with Colorectal Cancer // Biol Med (Aligarh) , 8:7(2016).
VA Chernukhin, DA Gonchar, MA Abdurashitov, EV Kileva, OA Belichenko, VS Dedkov, NA Mikhnenkova, SKh Degtyarev Comparative analysis of biochemical properties of site specific methyl-directed DNA endonucleases BisI, BlsI and EcoBLI recognizing 5`-G(5mC)NGC-3`/3`-CGN(5mC)G-5` // Research Journal of Pharmaceutical, Biological and Chemical Sciences, RJPBCS, vol 7(2), p.p. 388-394 (2016)
А.А.Евдокимов, Н.А.Нетесова, Н.А.Сметанникова, М.А.Абдурашитов, А.Г.Акишев, Е.С.Давидович, В.В. Кузнецов, Ю.Д.Ермолаев, А.Б.Карпов, А.Э.Сазонов, Р.М.Тахауов, С.Х.Дегтярев Применение метода GLAD-ПЦР анализа для выявления сайтов метилирования в регуляторных областях генов-онкосупрессоров ELMO1 и ESR1 при колоректальном раке// Вопросы онкологии, №1, стр. 116-120 (2016)
EV Dubinin, AG Akishev, MA Abdurashitov, SB Oleynikova, VL Sitko, and S Kh Degtyarev Real time GlaI-PCR assay of regulation regions of human genes HDAC4, RARB and URB1 // Research Journal of Pharmaceutical, Biological and Chemical Sciences, vol 7(2), p.p. 667-676 (2016).
Чернухин В.А., Гончар Д.А., Абдурашитов М.А., Беличенко О.А., Дедков В.С., Михненкова Н.А., Ломаковская Е.Н., Удальева С.Г., Дегтярёв С.Х. Клонирование и характеристика новой сайт-специфической метилзависимой эндонуклеазы ElmI, узнающей и расщепляющей С5-метилированную последовательность ДНК 5`-G(5mC)^NG(5mC)-3` // Acta Naturae, Том 8, № 1, Стр. 127-136 (2016)
Murat A . Abdurashitov , Valery A . Chernukhin , Danila A . Gonchar , Vladimir S . Dedkov, Natalia A . Mikhnenkova, and Sergey Kh . Degtyarev Dimethyl Sulfoxide Changes the Recognition Site Preference of Methyl- directed Site-specific DNA Endonuclease GlaI.// Research Journal of Pharmaceutical, Biological and Chemical Sciences, № 7(1),с. 1733-1739 (2016)
Xu SY, Klein P, Degtyarev SKh, Roberts RJ. Expression and purification of the modification-dependent restriction enzyme BisI and its homologous enzymes.// Sci Rep. 2016 Jun 29;6:28579. doi: 10.1038/srep28579.(2016)
Abdurashitov M.A., Tomilov V.N., Gonchar D.A., Kuznetsov V.V., Degtyarev S.Kh. Mapping of R(5mC)GY Sites in the Genome of Human Malignant Cell Line Raji // Biol Med (Aligarh) Volume 7, Issue 4, BM-135-15 (2015).
Dedkov V.S., Gonchar D.A., Abdurashitov M.A., Udalyeva S.G., Urumceva L.A., Chernukhin V.A., Mutylo G.V., Degtyarev S.Kh. Cloning and Study of New DNA Methyltransferase M.FatI Modifying Cytosine in a Recognition Site CATG. // Research Journal of Pharmaceutical, Biological and Chemical Sciences, vol 6 (6), P. 1341-1348.(2015)
Xu SY, Boitano M, Clark TA, Vincze T, Fomenkov A, Kumar S, Too PH, Gonchar D, Degtyarev SK, Roberts RJ. Complete Genome Sequence Analysis of Bacillus subtilis T30.//Genome Announc. 2015 May 7;3(3). pii: e00395-15. doi: 10.1128/genomeA.00395-15. PMID:25953183
Dedkov, V.S., Gonchar, D.A., Abdurashitov, M.A., Udalyeva, S.G., Urumceva, L.A., Chernukhin, V.A., Shiryaeva, E.N., Degtyarev, S.Kh. Cloning and study of new DNA methyltransferase M.AluBI modifying adenine in a recognition site AGCT.// Biotecnol. Apl. 32: 3211-3216 (2015).
Ситько В.Л., Куксова А.Н., Евдокимова И.И., Нетесова Н.А., Дегтярев С.Х. Разработка простого метода получения высокоочищенной ДНК, связанной с клетками крови // Вопросы гематологии, онкологии и иммунопатологии в педиатрии. – 2014. – Т. 13. – № 4. – С. 50–55.
Верхозина Е.В., Верхозина В.А., Гончар Д.А., Дедков В.С., Дегтярев С.Х., Чернухин В.А. Разработка и апробация физико-химических методов в экологических исследованиях // Вода: химия и экология, № 10(76) ,с. 119-122 (2014)
Кузнецов В.В., Абдурашитов М.А., Акишев А.Г., Дегтярев С.Х. Способ определения нуклеотидной последовательности Pu(5mC)GPy в заданном положении протяженной ДНК// Патент на изобретение RU 2525710 С1 (2014).
Abdurashitov A Murat, Gonchar A Danila, Chernukhin A Valery, Tomilov N Victor, Tomilova E Julia, Schostak G Natalia, Zatsepina G Olga, Zelentsova S Elena, Evgen’ev B Michael, Degtyarev Kh Sergey Medium-sized tandem repeats represent an abundant component of the Drosophila virilis genome // BMC Genomics.2013, 14:771
Землянская Е. В., Дегтярев С. Х. Субстратная специфичность и свойства метилзависимых сайт-специфических ДНК-эндонуклеаз.// Молекулярная биология, том 47, № 6, с. 900–913(2013)
Дедков В.С., Гончар Д.А., Чернухин В.А., Абдурашитов М.А., Ломаковская Е.Н., Шинкаренко Н.М., Дегтярёв С.Х. Клонирование системы рестрикции-модификации BpuN4I из Bacillus pumilus N4// Вестник биотехнологии и физико-химической биологии имени Ю. А. Овчинникова, т. 9, № 3, с. 40-47 (2013)
Абдурашитов М.А., Куксова А.Н., Акишев А.Г., Землянская Е.В., Дегтярев С.Х. MteI-ПЦР-анализ-новый метод определения статуса метилирования GC-богатых регуляторных участков генов-онкосупрессоров человека. // Вестник биотехнологии и физико-химической биологии имени Ю. А. Овчинникова, Т. 9 , № 3 ,с. 15-23 (2013)
Чернухин В.А., Гончар Д.А., Томилова Ю.Э., Болтенгаген А.А., Голикова Л.Н., Дегтярев С. Х. Метилзависимая сайт-специфическая ДНК-эндонуклеаза BlsI узнает и расщепляет последовательность ДНК 5` -RYNRY- 3` при наличии в ней не менее двух 5-метилцитозинов.// Вестник биотехнологии и физико-химической биологии имени Ю. А. Овчинникова, Т. 9 , № 2 ,с. 30-38 (2013)
Чернухин В.А., Михненкова Н.А., Ломаковская Е.Н., Шинкаренко Н.М., Дедков В.С., Дегтярёв С.Х. Новая сайт-специфическая эндонуклеаза рестрикции BpuN4I узнает и расщепляет последовательность ДНК 5`-G^GNNCC- 3`. // Вестник биотехнологии и физико-химической биологии имени Ю. А. Овчинникова, Т. 9 , № 2 ,с. 5-8 (2013)
Чернухин В.А., Гончар Д.А., Килева Е.В., Соколова В.А., Голикова Л.Н., Дедков В.С., Михненкова Н.А., Дегтярёв С.Х. Новая метилзависимая сайт-специфическая ДНК-эндонуклеаза MteI расщепляет девятинуклеотидную последовательность 5`-G(5mC)G(5mC)NG(5mC)GC-3`/3`-CG(5mC)GN(5mC)G(5mC)G-5`. // Вестник биотехнологии и физико-химической биологии имени Ю. А. Овчинникова, Т. 8 , № 1 ,с. 16-26 (2012)
Дедков В.С. Новая ДНК-метилтрансфераза M.BstC8I образует 5`-G(m5C)NNGC-3`. Изучение чувствительности эндонуклез рестрикции к M.BstС8I–метилированию. // Молекул. генетика, микробиол. и вирусол. № 1. с.35-40 (2012).
Дедков В.С., Михненкова Н.А., Джанобилова З.К., Тарасова М.В. ДНК-метилтрансфераза M.BssECI образует 5`-m4CCNNGG-3`. Чувствительность эндонуклеаз рестрикции к новому метилированию.// Биотехнология, № 2, с. 32-42 (2012)
Тарасова М.В., Кузнецов В.В., Нетесова Н.А., Гончар Д.А., Дегтярев С.Х. Клонирование и анализ биохимических и кинетических свойств ДНК-метилтрансферазы M1.BPACI.// Вестник Московского университета. Серия 16: Биология. № 2. С. 38-40 (2011)
Чернухин В.А., Наякшина Т.Н, Гончар Д.А., Томилова Ю.Э., Тарасова М.В., Дедков В.С., Михненкова Н.А., Дегтярёв С.Х. Новая сайт-специфическая метилзависимая ДНК эндонуклеаза PkrI узнаёт и расщепляет метилированную последовательность 5`-GCN^GC-3`/3`-CG^NCG-5`, содержащую не менее 3-х 5-метилцитозинов. // Вестник биотехнологии и физико-химической биологии имени Ю. А. Овчинникова, Т. 7 , № 3 ,с. 35-42 (2011)
А.Г. Акишев, Д.А. Гончар, М.А. Абдурашитов, С.Х. Дегтярев Эпигенетическое типирование малигнантных клеточных линий человека с помощью BlsI- и GlaI ПЦР анализа. // Вестник биотехнологии и физико-химической биологии имени Ю. А. Овчинникова, Т. 7 , № 3 ,с. 5-16 (2011)
Томилова Ю.Э., Чернухин В.А., Дегтярев С.Х. Сайт-специфическая ДНК-эндонуклеаза FaiI узнает вырожденную четырехнуклеотидную последовательность 5`-YA^TR-3`.// Вестник биотехнологии и физико-химической биологии имени Ю. А. Овчинникова, Т. 7 , № 2 ,с. 11-16 (2011)
Чернухин В.А., Килева Е.В., Томилова Ю.Э., Болтенгаген А.А., Дедков В.С., Михненкова Н.А., Гончар Д.А., Голикова Л.Н., Дегтярев С.Х. Новая метил-зависимая сайт-специфическая эндонуклеаза KroI узнает и расщепляет последовательность ДНК 5`-G^C(5mC)GGC-3`. // Вестник биотехнологии и физико-химической биологии имени Ю. А. Овчинникова, Т. 7 , № 1 ,с. 14-20 (2011)
Тарасова М.В., Кузнецов В.В., Нетёсова Н.А., Гончар Д.А., Дегтярёв С.Х. Рекомбинантная ДНК-метилтрансфераза M1.BspACI из Bacillus psychrodurans AC: получение и свойства // Биохимия, 2010, т. 75, вып. 12, с. 1712-1719.
Томилова Ю.Э., Кузнецов В.В., Абдурашитов М.А., Нетесова Н.А., Дегтярев С.Х. Рекомбинантная ДНК-метилтрансфераза M1.Bst19I из Bacillus stearothermophilus 19: получение, свойства и сравнительный анализ аминокислотной последовательности.// Молекулярная биология, т. 44, №4, с.688-698 (2010).
Гончар Д.А., Акишев А.Г., Дегтярев С.Х. BlsI- и GlaI- ПЦР анализ – новый метод исследования метилированных участков ДНК. // Вестник биотехнологии и физико-химической биологии имени Ю. А. Овчинникова, Т. 6 , № 1 ,с. 5-12 (2010)
Чернухин В.А., Кузнецов В.В., Гончар Д.А., Каширина Ю.Г., Нетесова Н.А., Дегтярев С.Х. Субстратная специфичность и биохимические свойства ДНК-метилтрансферазы M3.BstF5I из системы рестрикции-модификации BstF5I.// Биохимия, т. 75, вып.1 (2010) с.78-87.
Д.А. Гончар, А.Г. Акишев, С.Х. Дегтярев Способ определения гиперметилированных CpG островков в области генов-супрессоров опухолевого роста в ДНК человека. // Патент на изобретение RU 2413773 С1 (2009)
Тарасова М.В., Джанобилова З.К., Томилова Ю.Э., Дедков В.С., Чернухин В.А., Дегтярев С.Х. Новая сайт-специфическая эндонуклеаза BspACI из BACILLUS PSYCHRODURANS AC узнает последовательность 5`-C^CGC-3`/3`-GGC^G-5`. // Вестник биотехнологии и физико-химической биологии имени Ю.А.Овчинникова, Т5, №1, С. 16-24 (2009).
Дедков В.С. Определение специфичности ДНК-метилтрансферазы M.AspS9I в клеточном лизате при помощи блокирования эндонуклеаз рестрикции // Биотехнология, № 4, С.30-39 (2009)
Дедков В.С. Определение специфичности ДНК-метилтрансферазы M.Bsc4I в клеточном лизате при помощи блокирования эндонуклеаз рестрикции и компьютерного моделирования . // Молекул. генетика, микробиол. и вирусол., № 3, С. 3-8 (2009).
Абдурашитов М.А., Чернухин В.А., Гончар Д.А., Дегтярев С.Х. GlaI digestion of mouse γ-satellite DNA: study of primary structure and ACGT sites methylation // BMC Genomics 2009, 10:322.
Чернухин В.А., Seggewiss J., Каширина Ю.Г., Гончар Д.А., Дегтярев С.Х. Рекомбинантная ДНК-метилтрансфераза M2.BstSEI из никазно-метилазной системы NM.BstSEI: получение и свойства. // Молекулярная биология, т.43, № 1, 10-18 (2009).
Murat A Abdurashitov, Victor N Tomilov, Valery A Chernukhin, Sergey Kh. Degtyarev A physical map of human Alu repeats cleavage by restriction endonucleases // BMC Genomics 2008, 9:305
Tarasova G. V., Nayakshina T. N., Degtyarev S. Kh. Substrate specificity of new methyl-directed DNA endonuclease GlaI . // BMC Molecular Biology 2008, 9:7
Дедков В.С., Михненкова Н.А., Килева Е.В., Тарасова Г.В., Гончар Д.А., Акишев А.Г., Чернухин В.А., Шкиря С.С., Дегтярев С.Х. Новая эндонуклеаза рестрикции GsaI, неошизомер фермента BseY I, узнает последовательность ДНК 5’-CCCAGC(-1/-5)-3’. // Вестник биотехнологии и физико-химической биологии имени Ю.А.Овчинникова, Т4, №1, С. 19-24 (2008).
Чернухин В.А., Чмуж Е.В., Томилова Ю.Э., Наякшина Т.Н., Гончар Д.А., Дедков В.С., Дегтярев С.Х. Новая сайт-специфическая эндонуклеаза GluI узнает метилированную последовательность ДНК 5’-G(5mC)^NG(5mC)-3’/3’-(5mC)GN^(5mC)G-5’.// Вестник биотехнологии и физико-химической биологии имени Ю.А.Овчинникова, Т3, №2, С. 13-17 (2007).
Чернухин В.А., Болтенгаген А.А., Тарасова Г.В., Дедков В.С., Дегтярев С.Х. Новая эндонуклеаза рестрикции AluBI из Arthrobacter luteus B- изошизомер AluI, нечувствительный к присутствию 5-метилцитозина в сайте узнавания AGCT.// Вестник биотехнологии и физико-химической биологии имени Ю.А.Овчинникова, Т3, №1, С. 21-27 (2007).
Чернухин В.А., Томилова Ю.Э., Чмуж Е.В., Соколова О.О., Дедков В.С., Дегтярев С.Х. Сайт-специфическая эндонуклеаза BlsI узнает последовательность ДНК 5’-G(5mC)N^GC-3’ и расщепляет ее с образованием 3’-выступающих концов.// Вестник биотехнологии и физико-химической биологии имени Ю.А.Овчинникова, Т3, №1, С. 28-33 (2007).
Абдурашитов М.А., Томилов В.Н., Чернухин В.А., Гончар Д.А., Дегтярев С.Х. Рестрикционный анализ ДНК человека – новые возможности в ДНК-диагностике // Медицинская генетика, Т.6, № 8, с 29-36 (2007)
Гончар Д.А., Абдурашитов М.А., Охапкина С.С., Шагин Д.А., Килева Е.В., Дегтярев С.Х. Система рестрикции-модификации Sse9I: организация генов и сравнительный анализ структуры белков . // Молекулярная биология, т.41, №3, с. 491-498 (2007)
В.А. Чернухин, М.А. Абдурашитов, В.Н. Томилов, Д.А. Гончар, С.Х. Дегтярев Сравнительный рестрикционный анализ хромосомной ДНК мыши in vitro и in silico // Вестник биотехнологии и физико-химической биологии имени Ю. А. Овчинникова, 2007, 3, №4, с. 19-27.
Чмуж Е.В., Каширина Ю.Г., Томилова Ю.Э., Чернухин В.А., Охапкина С.С., Гончар Д.А., Дедков В.С., Абдурашитов М.А., Дегтярев С.Х. Клонирование генов, сравнительный анализ структуры белков системы рестрикции-модификации Fsp4HI и биохимическая характеристика рекомбинантной ДНК-метилтрансферазы M.Fsp4HI. // Молекулярная биология, т.41, №1, с. 43-50 (2007)
Чернухин В.А., Абдурашитов М.А., Томилов В.Н., Гончар Д.А., Дегтярев С.Х. Сравнительный рестрикционный анализ хромосомной ДНК крысы in vitro и in silico // Вестник биотехнологии и физико-химической биологии имени Ю.А.Овчинникова, Т. 2 №3. – С. 39-46 (2006)
Абдурашитов М.А., Томилов В.Н., Чернухин В.А., Гончар Д.А., Дегтярев С.Х. Метод рестрикционного анализа геномов млекопитающих in silico // Вестник биотехнологии и физико-химической биологии имени Ю.А.Овчинникова, Т. 2 №3. – С. 29-38 (2006)
Чернухин В.А., Каширина Ю.Э., Томилова Ю.Э., Гончар Д.А., Дедков В.С., Михненкова Н.А., Дегтярев С.Х. Новая сайт-специфическая эндонуклеаза AbsI из Arthrobacter species 7М06 узнает октануклеотидную палиндромную последовательность ДНК 5’-CC^TCGAGG-3’.// Вестник биотехнологии и физико-химической биологии имени Ю.А.Овчинникова,Т2, №2, С.29-34 (2006).
Томилова Ю.Э., Чернухин В.А., Дегтярев С.Х. Зависимость активности сайт-специфической эндонуклеазы GlaI от количества и положения метилированных цитозинов в узнаваемой последовательности 5′-GCGC-3′. // Вестник биотехнологии и физико-химической биологии имени Ю.А.Овчинникова, т.2, №1 (2006) с. 30-39.
Томилова Ю.Э., Абдурашитов М.А., Голикова Л.Н., Нетесова Н.А., Дегтярев С.Х. Клонирование, установление первичной структуры и сравнительный анализ ДНК-метилтрансфераз из систем рестрикции-модификации SfaNI и Bst19I.// Молекулярная биология, т. 38, № 6, c. 997-1004 (2004).
Дедков В.С. Определение содержания G + C в ДНК бактерий при помощи эндонуклеаз рестрикции. // Биотехнология, №4, 77-82 (2004).
Дедков В.С., Михненкова Н.А., Власенко Л.П., Томилова Ю.Э., Каширина Ю.Г., Гончар Д.А., Дегтярев С.Х. Эндонуклеаза рестрикции AjnI из Acinetobacter johnsonii R2, изошизомер EcoRII, узнает 5′- ↓CCWGG-3′, но не блокируется dcm-метилированием.// Биотехнология, №3, С. 19-24 (2004).
Акишев А.Г., Речкунова Н.И., Томилова Ю.Э., Лебедева Н.А., Лаврик О.И., Дегтярев С.Х. Термостабильная ДНК-полимераза из Thermus thermophilus B35: получение и изучение свойств модифицированной формы фермента, обладающей повышенным сродством к ddNTP.// Биохимия, т. 68, №12 (2003).
Дедков В.С., Синичкина С.А., Абдурашитов М.А., Попиченко Д.В., Дегтярев С.Х. Эндонуклеазы рестрикции FalI и FalII из Flavobacterium aquatile узнают 5′-(8/13)AAGN5CTT(13/8)-3′.// Биотехнология, №6, С. 24-29 (2003).
Чернухин В.А., Голикова Л.Н., Гончар Д.А., Абдурашитов М.А., Каширина Ю.Г., Нетесова Н.А., Дегтярев С.Х. ДНК-Метилтрансферазы M.BstF5I-2 и M.BstF5I-4 системы рестрикции-модификации BstF5I из Bacillus stearothermophilus F5.// Биохимия, т. 68, №9 (2003).
Абдурашитов М.А., Охапкина С.С., Нетесова Н.А., Голикова Л.Н., Гончар Д. А., Дегтярев С.Х. Уникальная система рестрикции-модификации FauI: клонирование и сравнительный анализ структуры белков.// Молекулярная биология, т. 37, № 4, с. 619-624 (2003).
Дедков В.С., Наякшина Т.Н., Попиченко Д.В., Дегтярев С.Х. Эндонуклеаза рестрикции BmtI из Bacillus megaterium S2 расщепляет ДНК по 5′-GCTAG^C-3′.// Биотехнология, №1, С. 11-15 (2003).
Речкунова Н.И., Охапкина С.С., Анарбаев Р.О., Лохова И.А., Дегтярев С.Х., Лаврик О.И. Термостабильная ДНК полимераза из Thermus thermophilus B35: Влияние ионов двухвалентных металлов на взаимодействие с дезоксинуклеозидтрифосфатами.// Биохимия, т.65, №5 (2000).
Абдурашитов М.А., Нетесова Н.А., Голикова Л.Н., Гуторов В.В., Белавин П.А., Дегтярев С.Х. Вторая ДНК-метилтрансфераза из системы рестрикции-модификации BstF5I гомологична С-концевым доменам метилаз FokI и StsI. // Молекулярная биология, т.34, №1, 87-94 (2000).
Дедков В.С., Бондарь Т.С., Шевченко А.В., Дегтярев С.Х. Новая редкощепящая эндонуклеаза рестрикции SmiI из Streptococcus milleri узнает 5′-ATTT^AAAT-3′. // Молекулярная биология и вирусология, №1, 23-27 (2000).
Акишев А.Г., Речкунова Н.И., Лебедева Н.А., Лаврик О.И., Дегтярев С.Х. Термостабильная ДНК-полимераза из Thermus Thermophilus B35: клонирование, определение первичной структуры и экспрессия гена. // Биохимия, т.64, вып.11, 1536-1543 (1999).
Абдурашитов М.А., Беличенко О.А., Лебедева Н.А., Дегтярев С.Х. Psi I, новая эндонуклеаза рестрикции узнающая последовательность ДНК 5′-TTA^TAA-3′. // Биохимия, т 64, № 4, 481 – 482 (1999).
Dedkov V.S., Degtyarev S. Kh. Actinobacillus and Streptococcus: producers of isoschizomers of the restriction endonucleases R.Hph I, R.Sau I, R.Nhe I, R.Mbo I and R.Swa I. // Biol. Chem., Vol. 379, 573-574, (1998).
Degtyarev S. Kh., Netesova N.A., Chizhikov V.E., Abdurashitov M.A. Cloning and characterization of the gene encoding M.Fau I DNA methyltransferase. // Biol. Chem., Vol. 379, 567-568 (1998).
Речкунова Н.И., Акишев А.Г., Лебедева Н.А., Ходырева С.Н., Дегтярев С.Х., Лаврик О.И Термостабильная ДНК-полимераза из Thermus Thermophilus B35: выделение и характеризация некоторых свойств. // Биохимия, т.63, вып.11, 1490-1495 (1998).
Захаренко А.Л., Ходырева С.Н., Речкунова Н.И., Сафронов И.В., Пышный Д.В., Дегтярев С.Х., Лаврик О.И. Аффинная модификация ДНК-полимеразы из Thermus thermophilus и ДНК-матрицы с помощью фотореакционноспособных производных dCTP. // Биохимия, т. 63, вып. 8, 1090-1096 (1998).
Гончар Д.А., Дедков В.С., Верхозина В.А., Куснер Ю.С., Шевченко А.В., Дегтярев С.Х. Эндонуклеаза рестрикции Sse9I из штамма Sporosarcina sp. 9D, узнающая последовательность ДНК 5′-AATT-3′. // Прикладная биохимия и микробиология, т.34, №2, 139-141 (1998).
Abdurashitov M.A., Belichenko O.A., Shevchenko A.V., Dedkov V.S., Degtyarev S. Kh. BstAP I, an ApaB I isoschizomer, cleaves DNA at 5′-GCANNNN^NTGC-3′. // Nucleic Acids Research, Vol. 25, No 12., 2301-2302(1997).
Абдурашитов М.А., Килева Е.В., Мякишева Т.В., Дедков В.С., Шевченко А.В., Дегтярев С.Х. AccBS I: новая эндонуклеаза рестрикции из Acinetobacter calcoaceticus BS. // Прикладная биохимия и микробиология, т. 33, № 5, 496-498 (1997).
Degtyarev S. Kh., Netesova N.A., Abdurashitov M.A., Shevchenko A.V. Primary structure and strand specificity of BstF5 I – 1 DNA methyltransferase which recognizes 5′-GGATG-3′ // Gene, 187, 217-219 (1997).
Дегтярев С.Х., Репин В.Е., Речкунова Н.И., Шевченко А.В., Абдурашитов М.А. Штамм бактерий Bacillus badius – продуцент эндонуклеазы рестрикции, узнающей и расщепляющей последовательность нуклеотидов 5′-(A/T)CCGG(A/T)-3′ // Патент Российской Федерации RU2053299 (1996).
Abdurashitov M.A., Kileva E.V., Shinkarenko N.M., Shevchenko A.V., Dedkov V.S., Degtyarev S. Kh. BstF5 I, an unusual isoschizomer of Fok I. // Gene, 172, 4951 (1996).
Репин В.Е., Дегтярев С.Х., Речкунова Н.И. Штамм бактерий Acinetobacter calcoaceticus 65 – продуцент эндонуклеазы рестрикции, узнающей и расщепляющей последовательность 5′-GGTACC-3′. // Патент Российской Федерации RU2034922(1995)
Abdurashitov M.A., Belichenko O.A., Shevchenko A.V., Degtyarev S. Kh. Sim I, a new restriction endonuclease that recognizes non-palindromic sequence 5′-GGGTC-3′ (-3/0). // Nucleic Acids Research, Vol. 23, No 14., 2571-2572 (1995).
Dedkov V.S., Rechkunova N.I., Prihod’ko E.A., Kileva E.V., Kusner Y.S., Verchozina V.A., Degtyarev S.Kh. CciNI, an isoschisomer of NotI from Curtobacterium citreum recognizes 5′-GC^GGCCGC-3′. // Gene, No. 157, 99-100 (1995).
Degtyarev S. Kh., Prikhod’ko E.A., Rechkunova N.I., Prikhod’ko G.G., Krasnykh V.N. Biochemical characterization of Vsp I methyltransferase. // Gene, 157, 65-66 (1995).
Degtyarev S. Kh., Prikhod’ko E.A., Rechkunova N.I., Gorbunov. Yu. A. Interaction of Vsp I and Tru9 I restriction endonuclease with synthetic oligonucleotides. // Biochimica et Biophysica Acta, 1172, 89-94 (1993).
Degtyarev S.Kh., Rechkunova N.I., Zernov Yu.P., Dedkov V.S., Chizikov V.E., Van Calligan M., Williams R., Murray E. Bsp24I, a new unusual restriction endonuclease. // Gene, No.131, 93-95 (1993).
Degtyarev S. Kh., Prikhod’ko E.A., Prikhod’ko G.G., Krasnykh V.N. Vsp I methylase belongs to m6A-gamma class of adenine methylases. // Nucleic Acids Research, Vol. 21, No 8., 2015 (1993).
Degtyarev S. Kh., Kolyhalov A.A., Rechkunova N.I., Abdurashitov M.A. Acs I, a new restriction endonuclease from Arthrobacter citreus 310 recognizing 5′-Pu^AATTPy-3′. // Nucleic Acids Research, Vol. 20, No.14 (1992)
Degtyarev S. Kh., Abdurashitov M.A., Kolyhalov A.A., Rechkunova N.I. Acl I, a new restriction endonuclease from Acinetobacter calcoaceticus recognizing 5′-AA^CGTT -3′. // Nucleic Acids Research, Vol. 20, No. 14, 37-87 (1992)
Дедков В. С., Дегтярев С.Х. Определение эндонуклеаз рестрикции в колониях микроорганизмов Streptomyces и Nocardia. // Прикладная биохимия и микробиология т. 28, №. 2, 309- 313 (1992).
Репин В.Е., Дегтярев С.Х. Сравнение экспресс-методов анализа микроорганизмов на наличие активности сайт-специфических эндонуклеаз рестрикции. // Прикладная биохимия и микробиология. т.28, вып.1, 152-155 (1992).
Жилкина О.А., Репин В.Е., Дегтярев С.Х. Влияние некоторых параметров культивирования на выход эндонуклеазы рестрикции SfaNI.// Прикладная биохимия и микробиология. т.27, вып.4, 486-490 (1991).
Дедков В.С., Репин В.Е., Речкунова Н.И., Дегтярев С.Х., Верхозина В.А., Виноградова Т.П. Выявление штаммов-продуцентов эндонуклеаз рестрикции среди водных микроорганизмов озера Байкал. // Известия СО АН СССР, Серия биологических наук, вып.1, 35-37 (1990).
Репин В.Е., Дегтярев С.Х., Речкунова Н.И., Жук Е.В. Способ получения биомассы Vibrio species, обогащенной эндонуклеазой рестрикции Vsp I. // Авторское свидетельство SU1559704 (1989).
Дедков В.С., Приходько Г.Г., Пучкова Л.И., Серов Г.Д, Речкунова Н.И., Дегтярев С.Х. Ssr I – эндонуклеаза рестрикции второго класса из Staphylococcus saphrophyticus. // Молекулярная Генетика, Микробиология и Вирусология, № 11, 24-25 (1989).
Дегтярев С.Х., Речкунова Н.И., Гринев А.А., Дедков В.С. Выявление и определение субстратной специфичности эндонуклеаз рестрикции Bme18I и Kzo9I. // Известия СО АН СССР, Серия биологических наук, вып.3, 25-26 (1989).
Приходько Г.Г., Петров Н.А., Репин В.Е., Дегтярев С.Х. Установление субстратной специфичности эндонуклеазы рестрикции Bsu15I. // Известия СО АН СССР, Серия биологических наук, вып.2, 108-109 (1989).
Репин В.Е., Польшина С.В., Божко Н.А., Дегтярев С.Х. Культивирование Bacillus species 21 – продуцента эндонуклеазы рестрикции Bse21I. // Извести СО АН СССР, Серия биологических наук, вып.1, 108-111 (1989).
Приходько Г.Г., Петров Н.А., Чижиков В.Е., Дегтярев С.Х. Модифицированный способ определения места расщепления ДНК эндонуклеазами рестрикции. // Биотехнология, т.4, №5, 618-620 (1988).
Акулинин Г.Е., Гетко Г.А., Репин В.Е., Дегтярев С.Х. Новая эндонуклеаза рестрикции из почвенного штамма Bacillus megaterium 12 // Известия СО АН СССР, Серия биологических наук, № 14, вып. 2, 105-107 (1988).
Репин В.Е., Приходько Е.А., Дегтярев С.Х. Поиск штаммов-продуцентов эндонуклеаз рестрикции среди почвенных микроорганизмов // Известия СО АН СССР, Серия биологических наук, вып. 2, 109-113 (1988).
Дегтярев С.Х., Речкунова Н.И. Определение чистоты препаратов эндонуклеаз рестрикции. // Известия СО АН СССР, Серия биологических наук, № 14, вып. 2, 102-105 (1988).
Белавин П.А., Дедков В.С., Дегтярев С.Х. Метод определения эндонуклеаз рестрикции в колониях бактерий. // Прикладная биохимия и микробиология, т. 24, вып. 1, 121-124 (1988).
Акулинин Г.Е., Репин В.Е., Дегтярев С.Х. Способ получения эндонуклеазы рестрикции Rsa I из Rhodopseudomonas sphaeroides // Авторское свидетельство SU1431328 (1986).
Репин В.Е., Дегтярев С.Х., Карпышев Н.Н., Чижиков В.Е. Фрагмент нуклеиновой кислоты для тестирования крупнощепящих рестриктаз SfiI и NotI и рекомбинантная плазмидная ДНК pDKR 85 для тестирования крупнощепящих рестриктаз SfiI и NotI. // Авторское свидетельство SU 1433020 (1986).
Дегтярев С.Х., Речкунова Н.И., Нетесова Н.А., Малыгин Э.Г., Михайлов В.В., Рассказов В.А. Штамм Vibrio nereis – продуцент рестриктазы VneI, узнающей и расщепляющей последовательность 5′-GTGCAC-3′. // Авторское свидетельство SU 1413954 (1986).
Будкер В.Г., Дегтярев С.Х., Соколов А.В. Расщепление ДНК, адсорбированной на поверхности фосфолипидных мембран, рестриктазами типа II. // Биохимия, т. 51, вып. 9, 1496 – 1498 (1986).
Gonchar D.A., Wolf Yu. I., Degtyarev S. Kh. Cloning and characterization of Sse9I DNA Methyltransferase recognizing 5′-AATT-3′. // Nucleic Acids Research, Vol. 24, No 14., 2790-2792 (1996).
Дегтярев С.Х., Репин В.Е., Божко Н.А., Щелкунов С.Н. Способ получения рестриктазы Hga I // Авторское свидетельство SU1389292 (1985).