Описание
Сайт узнавания и позиция гидролиза:
YATR | YA↑TR |
RTAY | RT↓AY |
Источник: Flavobacterium aquatile B15
Определение единицы активности:
За единицу активности принимается количество фермента необходимое для гидролиза 1 pmol олигонуклеотидного дуплекса указанной структуры за 1 час при 50°С в 20 μl реакционной смеси
Субстрат для определения активности:
Олигонуклеотидный дуплекс
5`-CGAGTTCA^TAGCTGGGCCCAAC-3`
3`-GCTCAAGT^ATCGACCCGGGTTG-5`
Оптимальный буфер: SE-буфер B
Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной:
B | G | O | W | Y | ROSE |
100 | 50 | 10 | 25 | 25 | 100 |
Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 100 mM KCl; 0,1 mM EDTA; 200 ug/ml BSA; 7 mM 2-меркаптоэтанол; 50% глицерин; Хранить при -20°С.
Лигирование:
После гидролиза 3-кратным избытком фермента около 90% фрагментов ДНК pUC19 сшиваются ДНК-лигазой и могут быть повторно расщеплены.
Неспецифический гидролиз:
Чувствительность к метилированию: не проверялось
С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер B.
Примечание:
Литература:
Томилова Ю.Э., Чернухин В.А., Дегтярев С.Х. Сайт-специфическая ДНК-эндонуклеаза FaiI узнает вырожденную четырёхнуклеотидную последовательность 5′-YA^TR-3′ // Вестник биотехнологии и физико-химической биологии имени Ю. А. Овчинникова. – 2011. – Т. 7 – № 2 – С. 11-16