Description
Сайт узнавания и позиция гидролиза:
| ATTAAT | AT↑TAAT |
| TAATTA | TAAT↓TA |
Источник: Из штамма E.coli несущего клонированный ген VspI из Vibrio species 343
Определение единицы активности:
За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК фага лямбда за 1 час при 37°С в 50 мкл реакционной смеси.
Субстрат для определения активности:
ДНК фага лямбда
Оптимальный буфер: SE-буфер W
Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной:
| B | G | O | W | Y | ROSE |
| 10 | 50 | 100 | 25 | 50 |
Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.6); 50 mM NaCl; 0.1 mM EDTA; 200 μg/ml BSA; 1 mM DTT; 50% глицерин; Хранить при -20°С.
Лигирование:
После гидролиза 10-кратным избытком фермента 70% фрагментов ДНК сшиваются ДНК лигазой и 90% из них могут быть повторно расщеплены. В присутствии 10% ПЭГ сшивка более эффективна.
Неспецифический гидролиз:
Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 10 ед фермента в течение 16 часов при 37°С
Чувствительность к метилированию: Блокируется метилированием ATTAmAT.
С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер W.
Для фасовок Turbo прикладывается 10 X SE-буфер ROSE.
Примечание:
Литература:
Дегтярев С.Х., Репин В.E., Речкунова Н.И., Чижиков В.E., Малыгин E.Г., Михайлов В.В., Рассказов В.A. Биоорг. Хим. 13: 420-421 (1987).
Degtyarev S. Kh., Prikhod`ko E.A., Rechkunova N.I., Gorbunov. Yu. A. Interaction of Vsp I and Tru9 I restriction endonuclease with synthetic oligonucleotides. // Biochimica et Biophysica Acta, 1172, 89-94 (1993).
В.А. Чернухин, М.А. Абдурашитов, В.Н. Томилов, Д.А. Гончар, С.Х. Дегтярев Сравнительный рестрикционный анализ хромосомной ДНК крысы in vitro и in silico // Вестник биотехнологии и физико-химической биологии имени Ю. А. Овчинникова, 2006, т. 2, №3, с. 39-46
