Description
Сайт узнавания и позиция гидролиза:
CTGGAG(N)16 | CTGGAG(N)16↑ |
GACCTC(N)14 | GACCTC(N)14↓ |
Источник: Bacillus pumilus
Определение единицы активности:
За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК фага лямбда за 1 час при 37°С в 50 мкл реакционной смеси.
Субстрат для определения активности:
ДНК фага лямбда
Оптимальный буфер: SE-буфер W
Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной:
B | G | O | W | Y | ROSE |
25 | 50 | 75 | 100 | 50 | 100 |
Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 50 mM KCl; 0.1 mM EDTA; 7 mM 2-меркаптоэтанол; 200 ug/ml BSA, 50% глицерин; Хранить при -20°С.
Лигирование:
После гидролиза 2-кратным избытком фермента около 95% фрагментов ДНК сшиваются ДНК-лигазой и 95% из них могут быть повторно расщеплены.
Неспецифический гидролиз:
Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 2 ед фермента в течение 16 часов при 37°С.
Чувствительность к метилированию: Блокируется при перекрывании dcm-метилированием (CmCWGG):
5′- C(5mC)TGGAG(N)16-3′
3′- GGA(5mC)CTC(N)14-5′
С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер W, BSA
Примечание:
Для достижения 100% активности BSA следует добавлять в реакционную смесь до концентрации 100 мкг/мл
BSA при длительной инкубации использовать не рекомендуется.
Литература:
Дегтярев С.Х., Морган Р.Неопубликованные данные (1992).