Описание
Сайт узнавания и позиция гидролиза:
GCGC | G↑CGC |
CGCG | CGC↓G |
Источник: Из штамма E.coli несущего клонированный ген HspAI из Haemophilus species A1
Определение единицы активности:
За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК фага лямбда за 1 час при 37°С в 50 мкл реакционной смеси.
Субстрат для определения активности:
ДНК фага лямбда
Оптимальный буфер: SE-буфер Y
Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной:
B | G | O | W | Y | ROSE |
50 | 50 | 25 | 25 | 100 | 100 |
Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 50 mM NaCl; 0.1 mM EDTA; 200 μg/ml BSA; 7 mM 2-меркаптоэтанол; 50% глицерин. Хранить при -20°С.
Лигирование:
После гидролиза 20-кратным избытком фермента более 90% фрагментов ДНК сшиваются ДНК-лигазой и могут быть повторно расщеплены.
Неспецифический гидролиз:
Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 20 ед фермента в течение 16 часов при 37°С.
Чувствительность к метилированию: Блокируется CG метилированием
5`-G(5mC)GC-3`/3`-CG(5mC)G-5`
Гидролизует полуметилированный по первому цитозину сайт
5`-G(5mC)GC-3`/3`-CGCG-5`
Не блокируется при метилировании
5`-GCG(5mC)-3`/3`-(5mC)GCG-5` и 5`-GCG(5mC)-3`/3`-CGCG-5`
С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер Y.
Для фасовок Turbo прикладывается 10 X SE-буфер ROSE.
Примечание:
Литература:
Речкунова Н.И., Приходько E.A., Шевченко A.В., Дегтярев С.Х. Неопубликованные данные(1994).
В.А. Чернухин, М.А. Абдурашитов, В.Н. Томилов, Д.А. Гончар, С.Х. Дегтярев Сравнительный рестрикционный анализ хромосомной ДНК мыши in vitro и in silico // Вестник биотехнологии и физико-химической биологии имени Ю. А. Овчинникова, 2007, 3, №4, с. 19-27.
В.А. Чернухин, М.А. Абдурашитов, В.Н. Томилов, Д.А. Гончар, С.Х. Дегтярев Сравнительный рестрикционный анализ хромосомной ДНК крысы in vitro и in silico // Вестник биотехнологии и физико-химической биологии имени Ю. А. Овчинникова, 2006, т. 2, №3, с. 39-46