SibEnzyme REBase

База данных эндонуклеаз рестрикции и метилзависимых ДНК эндонуклеаз производства SibEnzyme

Gla I

Название фермента Gla I
Прототип GlaI
Артикул SE-E493
Вариант Turbo Отсутствует
Высококонцентрированная версия Отсутствует
Тип рестриктазы Тип IIMiФерменты типа IIM требуют модифицированный, обычно метилированный, сайт узнавания для разрезания., Тип IIPiФерменты типа IIP — классические рестриктазы типа II с палиндромными сайтами узнавания и симметричными сайтами разрезания.
Сайт узнавания
5'… R(5mC)GY …3'
3'… YG(5mC)R …5'
Источник Из штамма E.coli, несущего клонированный ген Gla I из Glacial ice bacterium Gl29
Оптимальный буфер SE-буфер Y (33 mM Tris-ацетат (pH 7.9 при 25°C); 10 mM магний-ацетат; 66 mM калий-ацетат; 1 mM DTT.)
Оптимальная температура 30 °C
Температура инактивации 65 °C
Активность в буферах
BGOWYROSE
75752525100100
Определение единицы активности За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для полного гидролиза 1 мкг плазмиды pHspAI2/GsaI по единственному сайту 5`-G(5mC)G(5mC)-3`/3`-(5mC)G(5mC)G-5` за 1 час при 30°С в 50 мкл реакционной смеси. При этом происходит исчезновение исходной линейной формы плазмиды pHspAI2/GsaI и образование двух основных (3,419 и 699 п.н.) фрагментов ДНК (см. рисунок ниже, дор. 3-5). Появление дополнительных продуктов гидролиза (см. рисунок ниже, дор. 6) является результатом последующего расщепления ДНК по сайтам 5`-GCGC-3`/3`-CGCG-5`, имеющим три и два 5-метилцитозина. Определение активности GlaI В каждом случае проводилась инкубация фермента с 1 мкг ДНК pHspAI2/GsaI в 50 мкл реакционной смеси (см. Единица активности). После инкубации аликвота реакционной смеси 15 мкл наносилась на гель. Дорожки: 2 - Контрольная ДНК pHspAI2/GsaI, 3 - 0.5 мкл GlaI (разб. 1/100), 4 - 1 мкл GlaI (разб. 1/100), 5 - 2 мкл GlaI (разб. 1/100), 6 - 1 мкл неразбавленного фермента GlaI, 1 и 7- 1 Kb SE ДНК-маркеры. Продукты разделены в 1%-ном агарозном геле в буфере TAE. Продукты разделены в 1%-ном агарозном геле в буфере TAE. В присутствии 20% DMSO активность фермента значительно возрастает по всем сайтам без потери специфичности
Субстрат для определения активности Субстрат pHspAI2/GsaI представляет собой ДНК плазмиды pHspAI2, [modal_dna seq="phspai2.txt" title="Быстрый просмотр"] линеаризованной эндонуклеазой рестрикции GsaI. Плазмида pHspAI2 содержит фрагмент геномной ДНК бактериального штамма Haemophilus species A1, включающий ген ДНК-метилтрансферазы M.HspAI, и единственный канонический сайт узнавания GlaI 5`-G(5mC)G(5mC)-3`/3`-(5mC)G(5mC)G-5` [2].
Условия хранения 10 mM Tris-HCl (pH 7.6); 250 mM NaCl; 0.1 mM EDTA; 7 mM 2-меркаптоэтанол; 0,1% Triton X-100, 50 мкг/мл BSA, 50% глицерин. Хранить при -20°С.
Лигирование
Неспецифический гидролиз Не наблюдается неспецифического гидролиза при инкубации 100 ед фермента Gla I с 1 мкг ДНК фага лямбда в течение 16 часов при 30°С в 50 мкл реакционной смеси.
Чувствительность к метилированию Фермент расщепляет только С5-метилированную ДНК. Не расщепляет ДНК, содержащую N4-метилцитозин [1].
С ферментом поставляется 10 Х SE-буфер Y, плазмида pHspAI2/GsaI.
Примечания
Литература
  1. Сторонняя публикация Qiaomin Wu, Yang Yu, Mengqi Chen, Jinyan Long, Xiaolan Yang A label-free fluorescence sensing strategy based on GlaI-assisted EXPAR for rapid and accurate quantification of human methyltranferase activity // Talanta, 269, 125456 (2024)
  2. Сторонняя публикация Xu, G., Yang, H., Qiu, J. et al. Sequence terminus dependent PCR for site-specific mutation and modification detection. // Nature Communications 14, 1169 (2023)
  3. Сторонняя публикация Zhou S, Sun H, Huo D, Wang X, Qi N, Peng L, Yang M, Lu P, Hou C. A novel methyl-dependent DNA endonuclease GlaI coupling with double cascaded strand displacement amplification and CRISPR/Cas12a for ultra-sensitive detection of DNA methylation. // Analytica Chimica Acta, Volume 1212, 15 June 2022
  4. Сторонняя публикация Dong N, Wang W, Qin Y, Wang Y, Shan H. Sensitive lateral flow assay for bisulfite-free DNA methylation detection based on the restriction endonuclease GlaI and rolling circle amplification // Analytica Chimica Acta, Volume 1227, 22 September 2022
  5. Сторонняя публикация Petrova, D. V., Naumenko, M. B., Khantakova, D. V., Grin, I. R. & Zharkov, D. O. Relative Efficiency of Recognition of 5-Methylcytosine and 5-Hydroxymethylcytosine by Methyl-Dependent DNA Endonuclease GlaI // Russian Journal of Bioorganic Chemistry T. 45, № 6, стр. 625-629. (2019)
  6. Сторонняя публикация Susan M Mitchell, Keith N Rand, Zheng-Zhou Xu, Thu Ho, Glenn S Brown, Jason P Ross, Peter L Molloy Helper-Dependent Chain Reaction (HDCR) for Selective Amplification of Methylated DNA Sequences // Methods Mol Biol (2018)
  7. Сторонняя публикация Yueying Sun, Yuanyuan Sun, Weimin Tian, Chenghui Liu, * Kejian Gao and Zhengping L A novel restriction endonuclease GlaI for rapid and highly sensitive detection of DNA methylation coupled with isothermal exponential amplification reaction // Chemical Science, 9, pp.1344-1351 (2018)
  8. Сторонняя публикация Keith N. Rand, Graeme P. Young, Thu Ho and Peter L. Molloy Sensitive and selective amplification of methylated DNA sequences using helper-dependent chain reaction in combination with a methylationdependent restriction enzymes. // Nucleic Acids Research, pp. 1-10 (2012).
  9. Сторонняя публикация F. Syeda, R.L. Fagan, M. Wean, G.V. Awakumov, J.R. Walker, S. Xue, S. Dhe-Paganon, & C. Brenner The RFTS Domain is a DNA-competitive Inhibitor of Dnmt1 // , JBC, v. 286, pp. 15344-15351 (2011).
  10. Сторонняя публикация Kravets AP, Mousseau TA, Litvinchuk AV, Ostermiller Sh, Vengen GS, Grodzinski DM Changes in wheat DNA methylation pattern after chronic seed gamma-irradiation. // Tsitol Genet. 2010 Sep-Oct;44(5):18-22. Russian.
  11. Д.А. Гончар, А.Г. Акишев, С.Х. Дегтярев. Способ определения гиперметилированных CpG островков в области генов-супрессоров опухолевого роста в ДНК человека. // Патент на изобретение RU 2413773 С1 (2009).
  12. В.А. Чернухин, Т.Н. Наякшина, Н.В. Мезенцева, Ю.Э. Томилова, С.Х. Дегтярев, В.С. Дедков Штамм бактерий Glacial ice bacterium I - продуцент эндонуклеазы рестрикции Gla I // Патент на изобретение RU 2287012 С1 (2005).

Gla I

Название фермента Gla I
Прототип GlaI
Артикул SE-E493
Вариант Turbo Отсутствует
Высококонцентрированная версия Отсутствует
Тип рестриктазы Тип IIMiФерменты типа IIM требуют модифицированный, обычно метилированный, сайт узнавания для разрезания., Тип IIPiФерменты типа IIP — классические рестриктазы типа II с палиндромными сайтами узнавания и симметричными сайтами разрезания.
Сайт узнавания
5'… R(5mC)GY …3'
3'… YG(5mC)R …5'
Источник Из штамма E.coli, несущего клонированный ген Gla I из Glacial ice bacterium Gl29
Оптимальный буфер SE-буфер Y (33 mM Tris-ацетат (pH 7.9 при 25°C); 10 mM магний-ацетат; 66 mM калий-ацетат; 1 mM DTT.)
Оптимальная температура 30 °C
Температура инактивации 65 °C
Активность в буферах
BGOWYROSE
75752525100100
Определение единицы активности За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для полного гидролиза 1 мкг плазмиды pHspAI2/GsaI по единственному сайту 5`-G(5mC)G(5mC)-3`/3`-(5mC)G(5mC)G-5` за 1 час при 30°С в 50 мкл реакционной смеси. При этом происходит исчезновение исходной линейной формы плазмиды pHspAI2/GsaI и образование двух основных (3,419 и 699 п.н.) фрагментов ДНК (см. рисунок ниже, дор. 3-5). Появление дополнительных продуктов гидролиза (см. рисунок ниже, дор. 6) является результатом последующего расщепления ДНК по сайтам 5`-GCGC-3`/3`-CGCG-5`, имеющим три и два 5-метилцитозина. Определение активности GlaI В каждом случае проводилась инкубация фермента с 1 мкг ДНК pHspAI2/GsaI в 50 мкл реакционной смеси (см. Единица активности). После инкубации аликвота реакционной смеси 15 мкл наносилась на гель. Дорожки: 2 - Контрольная ДНК pHspAI2/GsaI, 3 - 0.5 мкл GlaI (разб. 1/100), 4 - 1 мкл GlaI (разб. 1/100), 5 - 2 мкл GlaI (разб. 1/100), 6 - 1 мкл неразбавленного фермента GlaI, 1 и 7- 1 Kb SE ДНК-маркеры. Продукты разделены в 1%-ном агарозном геле в буфере TAE. Продукты разделены в 1%-ном агарозном геле в буфере TAE. В присутствии 20% DMSO активность фермента значительно возрастает по всем сайтам без потери специфичности
Субстрат для определения активности Субстрат pHspAI2/GsaI представляет собой ДНК плазмиды pHspAI2, [modal_dna seq="phspai2.txt" title="Быстрый просмотр"] линеаризованной эндонуклеазой рестрикции GsaI. Плазмида pHspAI2 содержит фрагмент геномной ДНК бактериального штамма Haemophilus species A1, включающий ген ДНК-метилтрансферазы M.HspAI, и единственный канонический сайт узнавания GlaI 5`-G(5mC)G(5mC)-3`/3`-(5mC)G(5mC)G-5` [2].
Условия хранения 10 mM Tris-HCl (pH 7.6); 250 mM NaCl; 0.1 mM EDTA; 7 mM 2-меркаптоэтанол; 0,1% Triton X-100, 50 мкг/мл BSA, 50% глицерин. Хранить при -20°С.
Лигирование
Неспецифический гидролиз Не наблюдается неспецифического гидролиза при инкубации 100 ед фермента Gla I с 1 мкг ДНК фага лямбда в течение 16 часов при 30°С в 50 мкл реакционной смеси.
Чувствительность к метилированию Фермент расщепляет только С5-метилированную ДНК. Не расщепляет ДНК, содержащую N4-метилцитозин [1].
С ферментом поставляется 10 Х SE-буфер Y, плазмида pHspAI2/GsaI.
Примечания
Литература
  1. Сторонняя публикация Qiaomin Wu, Yang Yu, Mengqi Chen, Jinyan Long, Xiaolan Yang A label-free fluorescence sensing strategy based on GlaI-assisted EXPAR for rapid and accurate quantification of human methyltranferase activity // Talanta, 269, 125456 (2024)
  2. Сторонняя публикация Xu, G., Yang, H., Qiu, J. et al. Sequence terminus dependent PCR for site-specific mutation and modification detection. // Nature Communications 14, 1169 (2023)
  3. Сторонняя публикация Zhou S, Sun H, Huo D, Wang X, Qi N, Peng L, Yang M, Lu P, Hou C. A novel methyl-dependent DNA endonuclease GlaI coupling with double cascaded strand displacement amplification and CRISPR/Cas12a for ultra-sensitive detection of DNA methylation. // Analytica Chimica Acta, Volume 1212, 15 June 2022
  4. Сторонняя публикация Dong N, Wang W, Qin Y, Wang Y, Shan H. Sensitive lateral flow assay for bisulfite-free DNA methylation detection based on the restriction endonuclease GlaI and rolling circle amplification // Analytica Chimica Acta, Volume 1227, 22 September 2022
  5. Сторонняя публикация Petrova, D. V., Naumenko, M. B., Khantakova, D. V., Grin, I. R. & Zharkov, D. O. Relative Efficiency of Recognition of 5-Methylcytosine and 5-Hydroxymethylcytosine by Methyl-Dependent DNA Endonuclease GlaI // Russian Journal of Bioorganic Chemistry T. 45, № 6, стр. 625-629. (2019)
  6. Сторонняя публикация Susan M Mitchell, Keith N Rand, Zheng-Zhou Xu, Thu Ho, Glenn S Brown, Jason P Ross, Peter L Molloy Helper-Dependent Chain Reaction (HDCR) for Selective Amplification of Methylated DNA Sequences // Methods Mol Biol (2018)
  7. Сторонняя публикация Yueying Sun, Yuanyuan Sun, Weimin Tian, Chenghui Liu, * Kejian Gao and Zhengping L A novel restriction endonuclease GlaI for rapid and highly sensitive detection of DNA methylation coupled with isothermal exponential amplification reaction // Chemical Science, 9, pp.1344-1351 (2018)
  8. Сторонняя публикация Keith N. Rand, Graeme P. Young, Thu Ho and Peter L. Molloy Sensitive and selective amplification of methylated DNA sequences using helper-dependent chain reaction in combination with a methylationdependent restriction enzymes. // Nucleic Acids Research, pp. 1-10 (2012).
  9. Сторонняя публикация F. Syeda, R.L. Fagan, M. Wean, G.V. Awakumov, J.R. Walker, S. Xue, S. Dhe-Paganon, & C. Brenner The RFTS Domain is a DNA-competitive Inhibitor of Dnmt1 // , JBC, v. 286, pp. 15344-15351 (2011).
  10. Сторонняя публикация Kravets AP, Mousseau TA, Litvinchuk AV, Ostermiller Sh, Vengen GS, Grodzinski DM Changes in wheat DNA methylation pattern after chronic seed gamma-irradiation. // Tsitol Genet. 2010 Sep-Oct;44(5):18-22. Russian.
  11. Д.А. Гончар, А.Г. Акишев, С.Х. Дегтярев. Способ определения гиперметилированных CpG островков в области генов-супрессоров опухолевого роста в ДНК человека. // Патент на изобретение RU 2413773 С1 (2009).
  12. В.А. Чернухин, Т.Н. Наякшина, Н.В. Мезенцева, Ю.Э. Томилова, С.Х. Дегтярев, В.С. Дедков Штамм бактерий Glacial ice bacterium I - продуцент эндонуклеазы рестрикции Gla I // Патент на изобретение RU 2287012 С1 (2005).

Изошизомеры и неошизомеры

SE-ферментСайт узнаванияИзвестные аналогиТипСайт узнавания
5'… GACGTC …3'
3'… CTGCAG …5'
Неошизомер
5'… GACGTC …3'
3'… CTGCAG …5'
5'… TGCGCA …3'
3'… ACGCGT …5'
AviII
FspI
MstI
NsbI
Изошизомер
5'… TGCGCA …3'
3'… ACGCGT …5'
5'… ACCTGC(N)4 …3'
3'… TGGACG(N)8 …5'
BfuAI
BspMI
BveI
Изошизомер
5'… ACCTGC(N)4 …3'
3'… TGGACG(N)8 …5'
5'… GGTACC …3'
3'… CCATGG …5'
Asp718I
Изошизомер
5'… GGTACC …3'
3'… CCATGG …5'
Неошизомер
5'… GGTACC …3'
3'… CCATGG …5'
5'… GGYRCC …3'
3'… CCRYGG …5'
BanI
BshNI
BspT107I
HgiCI
Изошизомер
5'… GGYRCC …3'
3'… CCRYGG …5'
5'… CCANNNNNTGG …3'
3'… GGTNNNNNACC …5'
PflBI
PflMI
Van91I
Изошизомер
5'… CCANNNNNTGG …3'
3'… GGTNNNNNACC …5'
5'… GAGCGG …3'
3'… CTCGCC …5'
BsrBI
MbiI
Изошизомер
5'… GAGCGG …3'
3'… CTCGCC …5'
5'… AACGTT …3'
3'… TTGCAA …5'
Psp1406I
Изошизомер
5'… AACGTT …3'
3'… TTGCAA …5'
5'… GGATC(N)4 …3'
3'… CCTAG(N)5 …5'
AlwI
BinI
BspPI
Изошизомер
5'… GGATC(N)4 …3'
3'… CCTAG(N)5 …5'
5'… YGGCCR …3'
3'… RCCGGY …5'
CfrI
EaeI
Изошизомер
5'… YGGCCR …3'
3'… RCCGGY …5'
5'… RAATTY …3'
3'… YTTAAR …5'
ApoI
XapI
Изошизомер
5'… RAATTY …3'
3'… YTTAAR …5'
5'… CTGAAG(N)16 …3'
3'… GACTTC(N)14 …5'
Eco57I
Изошизомер
5'… CTGAAG(N)16 …3'
3'… GACTTC(N)14 …5'
5'… AGCGCT …3'
3'… TCGCGA …5'
Aor51HI
Eco47III
FunI
Изошизомер
5'… AGCGCT …3'
3'… TCGCGA …5'
5'… ACTAGT …3'
3'… TGATCA …5'
BcuI
SpeI
Изошизомер
5'… ACTAGT …3'
3'… TGATCA …5'
5'… CCWGG …3'
3'… GGWCC …5'
EcoRII
PspGI
Изошизомер
5'… CCWGG …3'
3'… GGWCC …5'
BptI
BseBI
BstNI
BstOI
MvaI
Неошизомер
5'… CCWGG …3'
3'… GGWCC …5'
5'… CYCGRG …3'
3'… GRGCYC …5'
AvaI
BsiHKCI
BsoBI
Eco88I
NspIII
Изошизомер
5'… CYCGRG …3'
3'… GRGCYC …5'
5'… GGGCCC …3'
3'… CCCGGG …5'
Bsp120I
Неошизомер
5'… GGGCCC …3'
3'… CCCGGG …5'
5'… ACCGGT …3'
3'… TGGCCA …5'
AgeI
BshTI
CspAI
PinAI
Изошизомер
5'… ACCGGT …3'
3'… TGGCCA …5'
5'… GCGATCGC …3'
3'… CGCTAGCG …5'
SgfI
Изошизомер
5'… GCGATCGC …3'
3'… CGCTAGCG …5'
5'… CCTAGG …3'
3'… GGATCC …5'
AvrII
BlnI
XmaJI
Изошизомер
5'… CCTAGG …3'
3'… GGATCC …5'
5'… GCGC …3'
3'… CGCG …5'
CfoI
HhaI
Изошизомер
5'… GCGC …3'
3'… CGCG …5'
Hin6I
HinP1I
Неошизомер
5'… GCGC …3'
3'… CGCG …5'
5'… GGNCC …3'
3'… CCNGG …5'
AsuI
Cfr13I
PspPI
Sau96I
Изошизомер
5'… GGNCC …3'
3'… CCNGG …5'
5'… CCSGG …3'
3'… GGSCC …5'
BcnI
CauII
NciI
Изошизомер
5'… CCSGG …3'
3'… GGSCC …5'
5'… GGTGA(N)8 …3'
3'… CCACT(N)7 …5'
HphI
Изошизомер
5'… GGTGA(N)8 …3'
3'… CCACT(N)7 …5'
5'… GCTAGC …3'
3'… CGATCG …5'
NheI
Изошизомер
5'… GCTAGC …3'
3'… CGATCG …5'
Неошизомер
5'… GCTAGC …3'
3'… CGATCG …5'
5'… GWGCWC …3'
3'… CWCGWG …5'
Alw21I
BsiHKAI
HgiAI
Изошизомер
5'… GWGCWC …3'
3'… CWCGWG …5'
5'… GGWCC …3'
3'… CCWGG …5'
AvaII
Eco47I
SinI
VpaK11BI
Изошизомер
5'… GGWCC …3'
3'… CCWGG …5'
5'… ACTGGG(N)5 …3'
3'… TGACCC(N)4 …5'
BfiI
BmrI
Изошизомер
5'… ACTGGG(N)5 …3'
3'… TGACCC(N)4 …5'
5'… CTGGAG(N)16 …3'
3'… GACCTC(N)14 …5'
GsuI
Изошизомер
5'… CTGGAG(N)16 …3'
3'… GACCTC(N)14 …5'
5'… TTCGAA …3'
3'… AAGCTT …5'
AsuII
Bsp119I
BspT104I
BstBI
Csp45I
NspV
SfuI
Изошизомер
5'… TTCGAA …3'
3'… AAGCTT …5'
5'… ATCGAT …3'
3'… TAGCTA …5'
BanIII
BseCI
BspDI
BspXI
Bsu15I
BsuTUI
ClaI
ZhoI
Изошизомер
5'… ATCGAT …3'
3'… TAGCTA …5'
5'… CCNNNNNNNGG …3'
3'… GGNNNNNNNCC …5'
BseLI
BsiYI
BslI
Изошизомер
5'… CCNNNNNNNGG …3'
3'… GGNNNNNNNCC …5'
5'… ACTGGN …3'
3'… TGACCN …5'
BseNI
BsrI
BsrSI
Изошизомер
5'… ACTGGN …3'
3'… TGACCN …5'
5'… GCAATGNN …3'
3'… CGTTACNN …5'
BseMI
BsrDI
Изошизомер
5'… GCAATGNN …3'
3'… CGTTACNN …5'
5'… GATNNNNATC …3'
3'… CTANNNNTAG …5'
BsaBI
BseJI
MamI
Изошизомер
5'… GATNNNNATC …3'
3'… CTANNNNTAG …5'
5'… CCTNAGG …3'
3'… GGANTCC …5'
AxyI
Bsu36I
Eco81I
SauI
Изошизомер
5'… CCTNAGG …3'
3'… GGANTCC …5'
5'… RCCGGY …3'
3'… YGGCCR …5'
BsrFI
BssAI
Cfr10I
Изошизомер
5'… RCCGGY …3'
3'… YGGCCR …5'
5'… GCGCGC …3'
3'… CGCGCG …5'
BssHII
PauI
Изошизомер
5'… GCGCGC …3'
3'… CGCGCG …5'
5'… CGGCCG …3'
3'… GCCGGC …5'
BstZI
EagI
EclXI
Eco52I
XmaIII
Изошизомер
5'… CGGCCG …3'
3'… GCCGGC …5'
5'… GGGAC(N)10 …3'
3'… CCCTG(N)14 …5'
BsmFI
FaqI
Изошизомер
5'… GGGAC(N)10 …3'
3'… CCCTG(N)14 …5'
5'… GGTCTCN …3'
3'… CCAGAG(N)5 …5'
BsaI
BspTNI
Eco31I
Изошизомер
5'… GGTCTCN …3'
3'… CCAGAG(N)5 …5'
5'… TCCGGA …3'
3'… AGGCCT …5'
AccIII
Aor13HI
BlfI
BseAI
BspEI
BspMII
Kpn2I
MroI
Изошизомер
5'… TCCGGA …3'
3'… AGGCCT …5'
5'… CCATGG …3'
3'… GGTACC …5'
NcoI
Изошизомер
5'… CCATGG …3'
3'… GGTACC …5'
5'… GCTNAGC …3'
3'… CGANTCG …5'
BlpI
Bpu1102I
CelII
EspI
Изошизомер
5'… GCTNAGC …3'
3'… CGANTCG …5'
5'… CCGC …3'
3'… GGCG …5'
AciI
SsiI
Изошизомер
5'… CCGC …3'
3'… GGCG …5'
5'… CCNNGG …3'
3'… GGNNCC …5'
BsaJI
BseDI
SecI
Изошизомер
5'… CCNNGG …3'
3'… GGNNCC …5'
5'… GTATAC …3'
3'… CATATG …5'
Bst1107I
BstZ17I
Изошизомер
5'… GTATAC …3'
3'… CATATG …5'
5'… CCWWGG …3'
3'… GGWWCC …5'
Eco130I
EcoT14I
StyI
Изошизомер
5'… CCWWGG …3'
3'… GGWWCC …5'
5'… CTCGTG …3'
3'… GAGCAC …5'
BauI
BsiI
BssSI
Изошизомер
5'… CTCGTG …3'
3'… GAGCAC …5'
5'… ACNGT …3'
3'… TGNCA …5'
HpyCH4III
TaaI
Tsp4CI
Изошизомер
5'… ACNGT …3'
3'… TGNCA …5'
5'… CTCTTCN …3'
3'… GAGAAG(N)4 …5'
Eam1104I
EarI
Ksp632I
Изошизомер
5'… CTCTTCN …3'
3'… GAGAAG(N)4 …5'
5'… GRCGYC …3'
3'… CYGCRG …5'
AcyI
BsaHI
Hin1I
Hsp92I
Изошизомер
5'… GRCGYC …3'
3'… CYGCRG …5'
5'… CTTAAG …3'
3'… GAATTC …5'
AflII
BfrI
BspTI
Bst98I
MspCI
Изошизомер
5'… CTTAAG …3'
3'… GAATTC …5'
5'… GCANNNNNTGC …3'
3'… CGTNNNNNACG …5'
ApaBI
Неошизомер
5'… GCANNNNNTGC …3'
3'… CGTNNNNNACG …5'
5'… TGTACA …3'
3'… ACATGT …5'
Bsp1407I
BsrGI
SspBI
Изошизомер
5'… TGTACA …3'
3'… ACATGT …5'
5'… YACGTR …3'
3'… RTGCAY …5'
BsaAI
Изошизомер
5'… YACGTR …3'
3'… RTGCAY …5'
5'… GCNNGC …3'
3'… CGNNCG …5'
Cac8I
Изошизомер
5'… GCNNGC …3'
3'… CGNNCG …5'
5'… CTNAG …3'
3'… GANTC …5'
DdeI
HpyF3I
Изошизомер
5'… CTNAG …3'
3'… GANTC …5'
5'… CCRYGG …3'
3'… GGYRCC …5'
BtgI
DsaI
Изошизомер
5'… CCRYGG …3'
3'… GGYRCC …5'
5'… CCTNNNNNAGG …3'
3'… GGANNNNNTCC …5'
EcoNI
XagI
Изошизомер
5'… CCTNNNNNAGG …3'
3'… GGANNNNNTCC …5'
5'… GGATGNN …3'
3'… CCTACNN …5'
BseGI
Изошизомер
5'… GGATGNN …3'
3'… CCTACNN …5'
Неошизомер
5'… GGATG(N)9 …3'
3'… CCTAC(N)13 …5'
5'… CGCG …3'
3'… GCGC …5'
AccII
Bsh1236I
BstUI
FnuDII
MvnI
Изошизомер
5'… CGCG …3'
3'… GCGC …5'
5'… RGCGCY …3'
3'… YCGCGR …5'
Bsp143II
HaeII
Изошизомер
5'… RGCGCY …3'
3'… YCGCGR …5'
5'… GATC …3'
3'… CTAG …5'
BfuCI
Bsp143I
DpnII
MboI
NdeII
Sau3AI
Неошизомер
5'… GATC …3'
3'… CTAG …5'
5'… G(mA)TC …3'
3'… CT(mA)G …5'
DpnI
Изошизомер
5'… G(mA)TC …3'
3'… CT(mA)G …5'
5'… GTCTCN …3'
3'… CAGAG(N)5 …5'
Alw26I
BsmAI
Изошизомер
5'… GTCTCN …3'
3'… CAGAG(N)5 …5'
5'… CGRYCG …3'
3'… GCYRGC …5'
Bsh1285I
BsiEI
McrI
Изошизомер
5'… CGRYCG …3'
3'… GCYRGC …5'
5'… GCNNNNNNNGC …3'
3'… CGNNNNNNNCG …5'
HpyF10VI
MwoI
Изошизомер
5'… GCNNNNNNNGC …3'
3'… CGNNNNNNNCG …5'
5'… RCATGY …3'
3'… YGTACR …5'
NspI
XceI
Изошизомер
5'… RCATGY …3'
3'… YGTACR …5'
5'… GACNNNNGTC …3'
3'… CTGNNNNCAG …5'
BoxI
PshAI
Изошизомер
5'… GACNNNNGTC …3'
3'… CTGNNNNCAG …5'
5'… CCNGG …3'
3'… GGNCC …5'
BssKI
StyD4I
Изошизомер
5'… CCNGG …3'
3'… GGNCC …5'
Bme1390I
ScrFI
Неошизомер
5'… CCNGG …3'
3'… GGNCC …5'
5'… CTRYAG …3'
3'… GAYRTC …5'
BfmI
BpcI
SfcI
SfeI
Изошизомер
5'… CTRYAG …3'
3'… GAYRTC …5'
5'… TACGTA …3'
3'… ATGCAT …5'
Eco105I
SnaBI
Изошизомер
5'… TACGTA …3'
3'… ATGCAT …5'
5'… GCAGC(N)8 …3'
3'… CGTCG(N)12 …5'
BbvI
BseXI
Изошизомер
5'… GCAGC(N)8 …3'
3'… CGTCG(N)12 …5'
5'… GAAGAC(N)2 …3'
3'… CTTCTG(N)6 …5'
BbsI
BbvII
BpiI
BpuAI
Изошизомер
5'… GAAGAC(N)2 …3'
3'… CTTCTG(N)6 …5'
5'… RGATCY …3'
3'… YCTAGR …5'
BstYI
MflI
PsuI
XhoII
Изошизомер
5'… RGATCY …3'
3'… YCTAGR …5'
5'… GTATCC(N)6 …3'
3'… CATAGG(N)5 …5'
BciVI
Изошизомер
5'… GTATCC(N)6 …3'
3'… CATAGG(N)5 …5'
5'… GGCC …3'
3'… CCGG …5'
BshFI
BspANI
PhoI
Изошизомер
5'… GGCC …3'
3'… CCGG …5'
5'… CACGTC …3'
3'… GTGCAG …5'
BmgBI
Изошизомер
5'… CACGTC …3'
3'… GTGCAG …5'
5'… GCGGCCGC …3'
3'… CGCCGGCG …5'
NotI
Изошизомер
5'… GCGGCCGC …3'
3'… CGCCGGCG …5'
5'… TTTAAA …3'
3'… AAATTT …5'
AhaIII
Изошизомер
5'… TTTAAA …3'
3'… AAATTT …5'
5'… CACNNNGTG …3'
3'… GTGNNNCAC …5'
AdeI
Изошизомер
5'… CACNNNGTG …3'
3'… GTGNNNCAC …5'
5'… GACNNNNNGTC …3'
3'… CTGNNNNNCAG …5'
AhdI
AspEI
Eam1105I
EclHKI
Изошизомер
5'… GACNNNNNGTC …3'
3'… CTGNNNNNCAG …5'
5'… GACNNNNNNGTC …3'
3'… CTGNNNNNNCAG …5'
AasI
DrdI
Изошизомер
5'… GACNNNNNNGTC …3'
3'… CTGNNNNNNCAG …5'
5'… GAGCTC …3'
3'… CTCGAG …5'
Ecl136II
Изошизомер
5'… GAGCTC …3'
3'… CTCGAG …5'
SacI
SstI
Неошизомер
5'… GAGCTC …3'
3'… CTCGAG …5'
5'… GAATTC …3'
3'… CTTAAG …5'
FunII
Изошизомер
5'… GAATTC …3'
3'… CTTAAG …5'
5'… GATATC …3'
3'… CTATAG …5'
Eco32I
Изошизомер
5'… GATATC …3'
3'… CTATAG …5'
5'… GGCGCC …3'
3'… CCGCGG …5'
EheI
SfoI
Изошизомер
5'… GGCGCC …3'
3'… CCGCGG …5'
BbeI
Неошизомер
5'… GGCGCC …3'
3'… CCGCGG …5'
KasI
Неошизомер
5'… GGCGCC …3'
3'… CCGCGG …5'
Неошизомер
5'… GGCGCC …3'
3'… CCGCGG …5'
5'… CATG …3'
3'… GTAC …5'
Hin1II
Hsp92II
NlaIII
Изошизомер
5'… CATG …3'
3'… GTAC …5'
CviAII
Неошизомер
5'… CATG …3'
3'… GTAC …5'
Неошизомер
5'… CATG …3'
3'… GTAC …5'
5'… CCCGC(N)4 …3'
3'… GGGCG(N)6 …5'
SmuI
Изошизомер
5'… CCCGC(N)4 …3'
3'… GGGCG(N)6 …5'
5'… CATATG …3'
3'… GTATAC …5'
NdeI
Изошизомер
5'… CATATG …3'
3'… GTATAC …5'
5'… GTmKAC …3'
3'… CAKmTG …5'
AccI
XmiI
Изошизомер
5'… GTmKAC …3'
3'… CAKmTG …5'
5'… GGATGNN …3'
3'… CCTACNN …5'
Неошизомер
5'… GGATG(N)9 …3'
3'… CCTAC(N)13 …5'
BseGI
Неошизомер
5'… GGATGNN …3'
3'… CCTACNN …5'
5'… GRGCYC …3'
3'… CYCGRG …5'
BanII
Eco24I
EcoT38I
HgiJII
Изошизомер
5'… GRGCYC …3'
3'… CYCGRG …5'
5'… GCNGC …3'
3'… CGNCG …5'
Fnu4HI
ItaI
SatI
Изошизомер
5'… GCNGC …3'
3'… CGNCG …5'
5'… GACGC(N)5 …3'
3'… CTGCG(N)10 …5'
CseI
Изошизомер
5'… GACGC(N)5 …3'
3'… CTGCG(N)10 …5'
5'… GTYRAC …3'
3'… CARYTG …5'
HincII
Изошизомер
5'… GTYRAC …3'
3'… CARYTG …5'
5'… GTTAAC …3'
3'… CAATTG …5'
KspAI
Изошизомер
5'… GTTAAC …3'
3'… CAATTG …5'
5'… CCGG …3'
3'… GGCC …5'
BsiSI
HapII
Изошизомер
5'… CCGG …3'
3'… GGCC …5'
5'… ACGT …3'
3'… TGCA …5'
MaeII
Изошизомер
5'… ACGT …3'
3'… TGCA …5'
5'… TGATCA …3'
3'… ACTAGT …5'
BclI
FbaI
Изошизомер
5'… TGATCA …3'
3'… ACTAGT …5'
5'… ACCWGGT …3'
3'… TGGWCCA …5'
SexAI
Изошизомер
5'… ACCWGGT …3'
3'… TGGWCCA …5'
5'… CAATTG …3'
3'… GTTAAC …5'
MunI
Изошизомер
5'… CAATTG …3'
3'… GTTAAC …5'
5'… GDGCHC …3'
3'… CHCGDG …5'
Bsp1286I
SduI
Изошизомер
5'… GDGCHC …3'
3'… CHCGDG …5'
5'… TGGCCA …3'
3'… ACCGGT …5'
BalI
MlsI
MluNI
MscI
Msp20I
Изошизомер
5'… TGGCCA …3'
3'… ACCGGT …5'
5'… GCCGGC …3'
3'… CGGCCG …5'
NgoMIV
Изошизомер
5'… GCCGGC …3'
3'… CGGCCG …5'
NaeI
Неошизомер
5'… GCCGGC …3'
3'… CGGCCG …5'
PdiI
Неошизомер
5'… GCCGGC …3'
3'… CGGCCG …5'
5'… GAANNNNTTC …3'
3'… CTTNNNNAAG …5'
Asp700I
PdmI
XmnI
Изошизомер
5'… GAANNNNTTC …3'
3'… CTTNNNNAAG …5'
5'… CmGCKG …3'
3'… GKCGmC …5'
NspBII
Изошизомер
5'… CmGCKG …3'
3'… GKCGmC …5'
5'… TCGCGA …3'
3'… AGCGCT …5'
Bsp68I
Изошизомер
5'… TCGCGA …3'
3'… AGCGCT …5'
5'… GGCGCGCC …3'
3'… CCGCGCGG …5'
AscI
AsoI
SgsI
Изошизомер
5'… GGCGCGCC …3'
3'… CCGCGCGG …5'
5'… AGGCCT …3'
3'… TCCGGA …5'
AatI
Eco147I
SseBI
StuI
Изошизомер
5'… AGGCCT …3'
3'… TCCGGA …5'
5'… ACATGT …3'
3'… TGTACA …5'
BspLU11I
PscI
Изошизомер
5'… ACATGT …3'
3'… TGTACA …5'
5'… GCTCTTCN …3'
3'… CGAGAAG(N)4 …5'
LguI
SapI
Изошизомер
5'… GCTCTTCN …3'
3'… CGAGAAG(N)4 …5'
5'… GAATGCN …3'
3'… CTTACGN …5'
BsaMI
BsmI
Mva1269I
Изошизомер
5'… GAATGCN …3'
3'… CTTACGN …5'
5'… CGATCG …3'
3'… GCTAGC …5'
MvrI
PvuI
Изошизомер
5'… CGATCG …3'
3'… GCTAGC …5'
5'… GAGTC(N)4 …3'
3'… CTCAG(N)5 …5'
PleI
Изошизомер
5'… GAGTC(N)4 …3'
3'… CTCAG(N)5 …5'
MlyI
Неошизомер
5'… GAGTC(N)5 …3'
3'… CTCAG(N)5 …5'
SchI
Неошизомер
5'… GAGTC(N)5 …3'
3'… CTCAG(N)5 …5'
5'… GGTCTC(N)1 …3'
3'… CCAGAG(N)5 …5'
Eco31I
Изошизомер
5'… GGTCTC(N)1 …3'
3'… CCAGAG(N)5 …5'
5'… CACGTG …3'
3'… GTGCAC …5'
AcvI
BbrPI
Eco72I
PmaCI
PmlI
Изошизомер
5'… CACGTG …3'
3'… GTGCAC …5'
5'… GGTNACC …3'
3'… CCANTGG …5'
BstEII
BstPI
Eco91I
EcoO65I
Изошизомер
5'… GGTNACC …3'
3'… CCANTGG …5'
5'… CGTACG …3'
3'… GCATGC …5'
BsiWI
Pfl23II
SplI
SunI
Изошизомер
5'… CGTACG …3'
3'… GCATGC …5'
5'… GGNNCC …3'
3'… CCNNGG …5'
BspLI
NlaIV
Изошизомер
5'… GGNNCC …3'
3'… CCNNGG …5'
5'… RGGWCCY …3'
3'… YCCWGGR …5'
PpuMI
PpuXI
Psp5II
Изошизомер
5'… RGGWCCY …3'
3'… YCCWGGR …5'
5'… CTGCAG …3'
3'… GACGTC …5'
BspMAI
Изошизомер
5'… CTGCAG …3'
3'… GACGTC …5'
5'… CAGNNNCTG …3'
3'… GTCNNNGAC …5'
AlwNI
Изошизомер
5'… CAGNNNCTG …3'
3'… GTCNNNGAC …5'
5'… GGCCGGCC …3'
3'… CCGGCCGG …5'
FseI
Изошизомер
5'… GGCCGGCC …3'
3'… CCGGCCGG …5'
5'… GTAC …3'
3'… CATG …5'
AfaI
Изошизомер
5'… GTAC …3'
3'… CATG …5'
Csp6I
Неошизомер
5'… GTAC …3'
3'… CATG …5'
5'… CGGWCCG …3'
3'… GCCWGGC …5'
CpoI
CspI
RsrII
Изошизомер
5'… CGGWCCG …3'
3'… GCCWGGC …5'
5'… CCTGCAGG …3'
3'… GGACGTCC …5'
SdaI
Sse8387I
Изошизомер
5'… CCTGCAGG …3'
3'… GGACGTCC …5'
5'… GCATC(N)5 …3'
3'… CGTAG(N)9 …5'
LweI
Изошизомер
5'… GCATC(N)5 …3'
3'… CGTAG(N)9 …5'
5'… CTCGAG …3'
3'… GAGCTC …5'
BssHI
PaeR7I
SlaI
StrI
TliI
XhoI
Изошизомер
5'… CTCGAG …3'
3'… GAGCTC …5'
5'… CCGCGG …3'
3'… GGCGCC …5'
Cfr42I
KspI
SacII
SgrBI
SstII
Изошизомер
5'… CCGCGG …3'
3'… GGCGCC …5'
5'… CCCGGG …3'
3'… GGGCCC …5'
Cfr9I
XmaCI
Неошизомер
5'… CCCGGG …3'
3'… GGGCCC …5'
5'… ATTTAAAT …3'
3'… TAAATTTA …5'
SwaI
Изошизомер
5'… ATTTAAAT …3'
3'… TAAATTTA …5'
5'… CAYNNNNRTG …3'
3'… GTRNNNNYAC …5'
MslI
Изошизомер
5'… CAYNNNNRTG …3'
3'… GTRNNNNYAC …5'
5'… GCATGC …3'
3'… CGTACG …5'
BbuI
PaeI
SpaHI
Изошизомер
5'… GCATGC …3'
3'… CGTACG …5'
5'… AATT …3'
3'… TTAA …5'
TasI
Tsp509I
TspEI
Изошизомер
5'… AATT …3'
3'… TTAA …5'
5'… CTAG …3'
3'… GATC …5'
MaeI
Изошизомер
5'… CTAG …3'
3'… GATC …5'
5'… TTAA …3'
3'… AATT …5'
MseI
Tru1I
Изошизомер
5'… TTAA …3'
3'… AATT …5'
5'… GTSAC …3'
3'… CASTG …5'
Tsp45I
Изошизомер
5'… GTSAC …3'
3'… CASTG …5'
5'… GACNNNGTC …3'
3'… CTGNNNCAG …5'
AspI
PflFI
PsyI
TelI
Изошизомер
5'… GACNNNGTC …3'
3'… CTGNNNCAG …5'
5'… GTGCAC …3'
3'… CACGTG …5'
Alw44I
ApaLI
Изошизомер
5'… GTGCAC …3'
3'… CACGTG …5'
5'… ATTAAT …3'
3'… TAATTA …5'
AseI
PshBI
Изошизомер
5'… ATTAAT …3'
3'… TAATTA …5'
5'… AGTACT …3'
3'… TCATGA …5'
AssI
ScaI
Изошизомер
5'… AGTACT …3'
3'… TCATGA …5'
5'… ATGCAT …3'
3'… TACGTA …5'
EcoT22I
Mph1103I
NsiI
Изошизомер
5'… ATGCAT …3'
3'… TACGTA …5'
BfrBI
Неошизомер
5'… ATGCAT …3'
3'… TACGTA …5'
// Код для некролога