SibEnzyme REBase

restriction enzymes database

Quick navigation
Enzyme Prototype Recognition site Supply options
A back to alphabet
Aat II AatII
5'… GACGTC …3'
3'… CTGCAG …5'
>>>
Abs I AbsI
5'… CCTCGAGG …3'
3'… GGAGCTCC …5'
>>>
Acc16 I MstI
5'… TGCGCA …3'
3'… ACGCGT …5'
>>>
Acc36 I BspMI
5'… ACCTGC(N)4 …3'
3'… TGGACG(N)8 …5'
>>>
Acc65 I KpnI
5'… GGTACC …3'
3'… CCATGG …5'
>>>
AccB1 I HgiCI
5'… GGYRCC …3'
3'… CCRYGG …5'
>>>
AccB7 I PflMI
5'… CCANNNNNTGG …3'
3'… GGTNNNNNACC …5'
>>>
AccBS I BsrBI
5'… GAGCGG …3'
3'… CTCGCC …5'
>>>
Acl I AclI
5'… AACGTT …3'
3'… TTGCAA …5'
>>>
AclW I BinI
5'… GGATC(N)4 …3'
3'… CCTAG(N)5 …5'
>>>
Aco I CfrI
5'… YGGCCR …3'
3'… RCCGGY …5'
>>>
Acs I ApoI
5'… RAATTY …3'
3'… YTTAAR …5'
>>>
Acu I Eco57I
5'… CTGAAG(N)16 …3'
3'… GACTTC(N)14 …5'
>>>
Afe I Eco47III
5'… AGCGCT …3'
3'… TCGCGA …5'
>>>
Ags I AgsI
5'… TTSAA …3'
3'… AASTT …5'
>>>
Ahl I SpeI
5'… ACTAGT …3'
3'… TGATCA …5'
>>>
Ajn I EcoRII
5'… CCWGG …3'
3'… GGWCC …5'
>>>
Ale I OliI
5'… CACNNNNGTG …3'
3'… GTGNNNNCAC …5'
>>>
Alu I AluI
5'… AGCT …3'
3'… TCGA …5'
>>>
AluB I AluI
5'… AGCT …3'
3'… TCGA …5'
>>>
Ama87 I AvaI
5'… CYCGRG …3'
3'… GRGCYC …5'
>>>
Aox I AoxI
5'… RG(5mC)Y …3'
3'… Y(5mC)GR …5'
>>>
Apa I ApaI
5'… GGGCCC …3'
3'… CCCGGG …5'
>>>
Ars I ArsI
5'… (N)8GACNNNNNNTTYG(N)11 …3'
3'… (N)13CTGNNNNNNAARC(N)6 …5'
>>>
AsiG I AgeI
5'… ACCGGT …3'
3'… TGGCCA …5'
>>>
AsiS I #Н/Д
5'… GCGATCGC …3'
3'… CGCTAGCG …5'
>>>
AspA2 I AvrII
5'… CCTAGG …3'
3'… GGATCC …5'
>>>
AspLE I HhaI
5'… GCGC …3'
3'… CGCG …5'
>>>
AspS9 I Sau96I
5'… GGNCC …3'
3'… CCNGG …5'
>>>
AsuC2 I CauII
5'… CCSGG …3'
3'… GGSCC …5'
>>>
AsuHP I HphI
5'… GGTGA(N)8 …3'
3'… CCACT(N)7 …5'
>>>
AsuNH I NheI
5'… GCTAGC …3'
3'… CGATCG …5'
>>>
B back to alphabet
BamH I BamHI
5'… GGATCC …3'
3'… CCTAGG …5'
>>>
Bar I BarI
5'… (N)7GAAGNNNNNNTAC(N)12 …3'
3'… (N)12CTTCNNNNNNATG(N)7 …5'
>>>
Bbv12 I HgiAI
5'… GWGCWC …3'
3'… CWCGWG …5'
>>>
Bgl I BglI
5'… GCCNNNNNGGC …3'
3'… CGGNNNNNCCG …5'
>>>
Bgl II BglII
5'… AGATCT …3'
3'… TCTAGA …5'
>>>
Bls I BlsI Неверный формат сайта узнавания >>>
Bme18 I AvaII
5'… GGWCC …3'
3'… CCWGG …5'
>>>
Bmo I SanDI
5'… GGGWCCC …3'
3'… CCCWGGG …5'
>>>
Bmt I NheI
5'… GCTAGC …3'
3'… CGATCG …5'
>>>
Bmu I BfiI
5'… ACTGGG(N)5 …3'
3'… TGACCC(N)4 …5'
>>>
Bpm I GsuI
5'… CTGGAG(N)16 …3'
3'… GACCTC(N)14 …5'
>>>
Bpu10 I Bpu10I
5'… CCTNAGC …3'
3'… GGANTCG …5'
>>>
Bpu14 I AsuII
5'… TTCGAA …3'
3'… AAGCTT …5'
>>>
Bsa29 I ClaI
5'… ATCGAT …3'
3'… TAGCTA …5'
>>>
Bsc4 I BsiYI
5'… CCNNNNNNNGG …3'
3'… GGNNNNNNNCC …5'
>>>
Bse1 I BsrI
5'… ACTGGN …3'
3'… TGACCN …5'
>>>
Bse118 I Cfr10I
5'… RCCGGY …3'
3'… YGGCCR …5'
>>>
Bse21 I SauI
5'… CCTNAGG …3'
3'… GGANTCC …5'
>>>
Bse3D I BsrDI
5'… GCAATGNN …3'
3'… CGTTACNN …5'
>>>
Bse8 I BsaBI
5'… GATNNNNATC …3'
3'… CTANNNNTAG …5'
>>>
BseP I BsePI
5'… GCGCGC …3'
3'… CGCGCG …5'
>>>
BseX3 I XmaIII
5'… CGGCCG …3'
3'… GCCGGC …5'
>>>
BslF I FinI
5'… GGGAC(N)10 …3'
3'… CCCTG(N)14 …5'
>>>
Bso31 I Eco31I
5'… GGTCTCN …3'
3'… CCAGAG(N)5 …5'
>>>
Bsp13 I BspMII
5'… TCCGGA …3'
3'… AGGCCT …5'
>>>
Bsp1720 I EspI
5'… GCTNAGC …3'
3'… CGANTCG …5'
>>>
Bsp19 I NcoI
5'… CCATGG …3'
3'… GGTACC …5'
>>>
BspAC I AciI
5'… CCGC …3'
3'… GGCG …5'
>>>
BspFN I FnuDII
5'… CGCG …3'
3'… GCGC …5'
>>>
BssEC I SecI
5'… CCNNGG …3'
3'… GGNNCC …5'
>>>
BssNA I SnaI
5'… GTATAC …3'
3'… CATATG …5'
>>>
BssT1 I StyI
5'… CCWWGG …3'
3'… GGWWCC …5'
>>>
Bst2B I BsiI
5'… CTCGTG …3'
3'… GAGCAC …5'
>>>
Bst2U I BstNI
5'… CCWGG …3'
3'… GGWCC …5'
>>>
Bst4C I Tsp4CI
5'… ACNGT …3'
3'… TGNCA …5'
>>>
Bst6 I Ksp632I
5'… CTCTTCN …3'
3'… GAGAAG(N)4 …5'
>>>
BstAC I AcyI
5'… GRCGYC …3'
3'… CYGCRG …5'
>>>
BstAF I AflII
5'… CTTAAG …3'
3'… GAATTC …5'
>>>
BstAP I (ApaBI)
5'… GCANNNNNTGC …3'
3'… CGTNNNNNACG …5'
>>>
BstAU I Bsp1407I
5'… TGTACA …3'
3'… ACATGT …5'
>>>
BstBA I BsaAI
5'… YACGTR …3'
3'… RTGCAY …5'
>>>
BstC8 I Cac8I
5'… GCNNGC …3'
3'… CGNNCG …5'
>>>
BstDE I DdeI
5'… CTNAG …3'
3'… GANTC …5'
>>>
BstDS I DsaI
5'… CCRYGG …3'
3'… GGYRCC …5'
>>>
BstEN I EcoNI
5'… CCTNNNNNAGG …3'
3'… GGANNNNNTCC …5'
>>>
BstF5 I (FokI)
5'… GGATGNN …3'
3'… CCTACNN …5'
>>>
BstFN I FnuDII
5'… CGCG …3'
3'… GCGC …5'
>>>
BstH2 I HaeII
5'… RGCGCY …3'
3'… YCGCGR …5'
>>>
BstHH I HhaI
5'… GCGC …3'
3'… CGCG …5'
>>>
BstKT I MboI
5'… GATC …3'
3'… CTAG …5'
>>>
BstMA I BsmAI
5'… GTCTCN …3'
3'… CAGAG(N)5 …5'
>>>
BstMB I MboI
5'… GATC …3'
3'… CTAG …5'
>>>
BstMC I McrI
5'… CGRYCG …3'
3'… GCYRGC …5'
>>>
BstMW I MwoI
5'… GCNNNNNNNGC …3'
3'… CGNNNNNNNCG …5'
>>>
BstNS I NspI
5'… RCATGY …3'
3'… YGTACR …5'
>>>
BstPA I PshAI
5'… GACNNNNGTC …3'
3'… CTGNNNNCAG …5'
>>>
BstSC I ScrFI
5'… CCNGG …3'
3'… GGNCC …5'
>>>
BstSF I SfeI
5'… CTRYAG …3'
3'… GAYRTC …5'
>>>
BstSL I BseSI
5'… GKGCmC …3'
3'… CmCGKG …5'
>>>
BstSN I SnaBI
5'… TACGTA …3'
3'… ATGCAT …5'
>>>
BstV1 I BbvI
5'… GCAGC(N)8 …3'
3'… CGTCG(N)12 …5'
>>>
BstV2 I BbvII
5'… GAAGAC(N)2 …3'
3'… CTTCTG(N)6 …5'
>>>
BstX I BstXI
5'… CCANNNNNNTGG …3'
3'… GGTNNNNNNACC …5'
>>>
BstX2 I XhoII
5'… RGATCY …3'
3'… YCTAGR …5'
>>>
Bsu I BciVI
5'… GTATCC(N)6 …3'
3'… CATAGG(N)5 …5'
>>>
BsuR I HaeIII
5'… GGCC …3'
3'… CCGG …5'
>>>
Btr I BtrI
5'… CACGTC …3'
3'… GTGCAG …5'
>>>
C back to alphabet
Cci I BspHI
5'… TCATGA …3'
3'… AGTACT …5'
>>>
CciN I NotI
5'… GCGGCCGC …3'
3'… CGCCGGCG …5'
>>>
D back to alphabet
Dra I AhaIII
5'… TTTAAA …3'
3'… AAATTT …5'
>>>
Dra III DraIII
5'… CACNNNGTG …3'
3'… GTGNNNCAC …5'
>>>
Dri I Eam1105I
5'… GACNNNNNGTC …3'
3'… CTGNNNNNCAG …5'
>>>
DseD I DrdI
5'… GACNNNNNNGTC …3'
3'… CTGNNNNNNCAG …5'
>>>
E back to alphabet
EcoICR I SacI
5'… GAGCTC …3'
3'… CTCGAG …5'
>>>
EcoR I EcoRI
5'… GAATTC …3'
3'… CTTAAG …5'
>>>
EcoR V EcoRV
5'… GATATC …3'
3'… CTATAG …5'
>>>
Ege I NarI
5'… GGCGCC …3'
3'… CCGCGG …5'
>>>
Emi I Ksp632I
5'… CTCTTC(N)1 …3'
3'… GAGAAG(N)4 …5'
>>>
Erh I StyI
5'… CCWWGG …3'
3'… GGWWCC …5'
>>>
F back to alphabet
Fae I NlaIII
5'… CATG …3'
3'… GTAC …5'
>>>
Fai I FaiI
5'… YATR …3'
3'… RTAY …5'
>>>
Fal I FalI
5'… (N)8AAGNNNNNCTT(N)13 …3'
3'… (N)13TTCNNNNNGAA(N)8 …5'
>>>
Fat I NlaIII
5'… CATG …3'
3'… GTAC …5'
>>>
Fau I FauI
5'… CCCGC(N)4 …3'
3'… GGGCG(N)6 …5'
>>>
FauND I NdeI
5'… CATATG …3'
3'… GTATAC …5'
>>>
Fbl I AccI
5'… GTmKAC …3'
3'… CAKmTG …5'
>>>
Fok I FokI
5'… GGATG(N)9 …3'
3'… CCTAC(N)13 …5'
>>>
FriO I BanII
5'… GRGCYC …3'
3'… CYCGRG …5'
>>>
Fsp4H I Fnu4HI
5'… GCNGC …3'
3'… CGNCG …5'
>>>
G back to alphabet
Gla I GlaI
5'… R(5mC)GY …3'
3'… YG(5mC)R …5'
>>>
Glu I GluI
5'… G(5mC)NG(5mC) …3'
3'… (5mC)GN(5mC)G …5'
>>>
Gsa I BseYI
5'… CCCAGC …3'
3'… GGGTCG …5'
>>>
H back to alphabet
Hae III HaeIII
5'… GGCC …3'
3'… CCGG …5'
>>>
Hga I HgaI
5'… GACGC(N)5 …3'
3'… CTGCG(N)10 …5'
>>>
Hind II HindII
5'… GTYRAC …3'
3'… CARYTG …5'
>>>
Hind III HindIII
5'… AAGCTT …3'
3'… TTCGAA …5'
>>>
Hinf I HinfI
5'… GANTC …3'
3'… CTNAG …5'
>>>
Hpa I HpaI
5'… GTTAAC …3'
3'… CAATTG …5'
>>>
Hpa II HpaII
5'… CCGG …3'
3'… GGCC …5'
>>>
HpySE526 I MaeII
5'… ACGT …3'
3'… TGCA …5'
>>>
HspA I HhaI
5'… GCGC …3'
3'… CGCG …5'
>>>
K back to alphabet
Kpn I KpnI
5'… GGTACC …3'
3'… CCATGG …5'
>>>
Kro I KroI
5'… GC(5mC)GGC …3'
3'… CGG(5mC)CG …5'
>>>
KroN I NaeI
5'… GCCGGC …3'
3'… CGGCCG …5'
>>>
Ksp22 I BclI
5'… TGATCA …3'
3'… ACTAGT …5'
>>>
Kzo9 I MboI
5'… GATC …3'
3'… CTAG …5'
>>>
L back to alphabet
Lmn I LmnI
5'… GCTCCN …3'
3'… CGAGGN …5'
>>>
M back to alphabet
Mab I SexAI
5'… ACCWGGT …3'
3'… TGGWCCA …5'
>>>
Mal I DpnI
5'… G(mA)TC …3'
3'… CT(mA)G …5'
>>>
Mbo II MboII
5'… GAAGA(N)8 …3'
3'… CTTCT(N)7 …5'
>>>
Mfe I MfeI
5'… CAATTG …3'
3'… GTTAAC …5'
>>>
Mhl I SduI
5'… GDGCHC …3'
3'… CHCGDG …5'
>>>
Mlu I MluI
5'… ACGCGT …3'
3'… TGCGCA …5'
>>>
Mly113 I NarI
5'… GGCGCC …3'
3'… CCGCGG …5'
>>>
Mnl I MnlI
5'… CCTC(N)7 …3'
3'… GGAG(N)6 …5'
>>>
Mox20 I BalI
5'… TGGCCA …3'
3'… ACCGGT …5'
>>>
MroN I (NaeI)
5'… GCCGGC …3'
3'… CGGCCG …5'
>>>
MroX I XmnI
5'… GAANNNNTTC …3'
3'… CTTNNNNAAG …5'
>>>
Msp I HpaII
5'… CCGG …3'
3'… GGCC …5'
>>>
MspA1 I NspBII
5'… CmGCKG …3'
3'… GKCGmC …5'
>>>
MspR9 I ScrFI
5'… CCNGG …3'
3'… GGNCC …5'
>>>
Mte I Mte
5'… G(5mC)G(5mC)NG(5mC)G(5mC) …3'
3'… (5mC)G(5mC)GN(5mC)G(5mC)G …5'
>>>
N back to alphabet
Nru I NruI
5'… TCGCGA …3'
3'… AGCGCT …5'
>>>
P back to alphabet
PalA I AscI
5'… GGCGCGCC …3'
3'… CCGCGCGG …5'
>>>
Pce I StuI
5'… AGGCCT …3'
3'… TCCGGA …5'
>>>
Pci I BspLU11I
5'… ACATGT …3'
3'… TGTACA …5'
>>>
PciS I SapI
5'… GCTCTTCN …3'
3'… CGAGAAG(N)4 …5'
>>>
Pcs I PcsI
5'… (5mC)GNNNNNNN(5mC)G …3'
3'… G(5mC)NNNNNNNG(5mC) …5'
>>>
Pct I BsmI
5'… GAATGCN …3'
3'… CTTACGN …5'
>>>
Pec I PsiI
5'… TTATAA …3'
3'… AATATT …5'
>>>
Pkr I PkrI
5'… G(5mC)NG(5mC) …3'
3'… (5mC)GN(5mC)G …5'
>>>
Ple19 I PvuI
5'… CGATCG …3'
3'… GCTAGC …5'
>>>
Pps I PleI
5'… GAGTC(N)4 …3'
3'… CTCAG(N)5 …5'
>>>
Pse31 I Eco31I
5'… GGTCTC(N)1 …3'
3'… CCAGAG(N)5 …5'
>>>
Psi I PsiI
5'… TTATAA …3'
3'… AATATT …5'
>>>
Psp124B I SacI
5'… GAGCTC …3'
3'… CTCGAG …5'
>>>
Psp6 I EcoRII
5'… CCWGG …3'
3'… GGWCC …5'
>>>
PspC I PmaCI
5'… CACGTG …3'
3'… GTGCAC …5'
>>>
PspE I BstEII
5'… GGTNACC …3'
3'… CCANTGG …5'
>>>
PspL I SplI
5'… CGTACG …3'
3'… GCATGC …5'
>>>
PspN4 I NlaIV
5'… GGNNCC …3'
3'… CCNNGG …5'
>>>
PspOM I (ApaI)
5'… GGGCCC …3'
3'… CCCGGG …5'
>>>
PspPP I PpuMI
5'… RGGWCCY …3'
3'… YCCWGGR …5'
>>>
PspX I PspXI
5'… VCTCGAGB …3'
3'… BGAGCTCV …5'
>>>
Psr I PsrI
5'… (N)7GAACNNNNNNTAC(N)12 …3'
3'… (N)12CTTGNNNNNNATG(N)7 …5'
>>>
Pst I PstI
5'… CTGCAG …3'
3'… GACGTC …5'
>>>
PstN I AlwNI
5'… CAGNNNCTG …3'
3'… GTCNNNGAC …5'
>>>
Pvu II PvuII
5'… CAGCTG …3'
3'… GTCGAC …5'
>>>
R back to alphabet
Rga I SgfI
5'… GCGATCGC …3'
3'… CGCTAGCG …5'
>>>
Rig I FseI
5'… GGCCGGCC …3'
3'… CCGGCCGG …5'
>>>
Rsa I RsaI
5'… GTAC …3'
3'… CATG …5'
>>>
RsaN I RsaI
5'… GTAC …3'
3'… CATG …5'
>>>
Rsr2 I RsrII
5'… CGGWCCG …3'
3'… GCCWGGC …5'
>>>
S back to alphabet
Sal I SalI
5'… GTCGAC …3'
3'… CAGCTG …5'
>>>
Sbf I Sse8387I
5'… CCTGCAGG …3'
3'… GGACGTCC …5'
>>>
Set I SetI
5'… ASST …3'
3'… TSSA …5'
>>>
SfaN I SfaNI
5'… GCATC(N)5 …3'
3'… CGTAG(N)9 …5'
>>>
Sfi I SfiI
5'… GGCCNNNNNGGCC …3'
3'… CCGGNNNNNCCGG …5'
>>>
Sfr274 I XhoI
5'… CTCGAG …3'
3'… GAGCTC …5'
>>>
Sfr303 I SacII
5'… CCGCGG …3'
3'… GGCGCC …5'
>>>
Sma I SmaI
5'… CCCGGG …3'
3'… GGGCCC …5'
>>>
Smi I SwaI
5'… ATTTAAAT …3'
3'… TAAATTTA …5'
>>>
SmiM I MslI
5'… CAYNNNNRTG …3'
3'… GTRNNNNYAC …5'
>>>
Sph I SphI
5'… GCATGC …3'
3'… CGTACG …5'
>>>
Sse9 I Tsp509I
5'… AATT …3'
3'… TTAA …5'
>>>
Ssp I SspI
5'… AATATT …3'
3'… TTATAA …5'
>>>
SspM I BfaI
5'… CTAG …3'
3'… GATC …5'
>>>
T back to alphabet
Taq I TaqI
5'… TCGA …3'
3'… AGCT …5'
>>>
Tru9 I MseI
5'… TTAA …3'
3'… AATT …5'
>>>
TseF I Tsp45I
5'… GTSAC …3'
3'… CASTG …5'
>>>
Tth111 I Tth111I
5'… GACNNNGTC …3'
3'… CTGNNNCAG …5'
>>>
V back to alphabet
Vne I ApaLI
5'… GTGCAC …3'
3'… CACGTG …5'
>>>
Vsp I VspI
5'… ATTAAT …3'
3'… TAATTA …5'
>>>
X back to alphabet
Xba I XbaI
5'… TCTAGA …3'
3'… AGATCT …5'
>>>
Xma I XmaI
5'… CCCGGG …3'
3'… GGGCCC …5'
>>>
Z back to alphabet
Zra I (AatII)
5'… GACGTC …3'
3'… CTGCAG …5'
>>>
Zrm I ScaI
5'… AGTACT …3'
3'… TCATGA …5'
>>>
Zsp2 I NsiI
5'… ATGCAT …3'
3'… TACGTA …5'
>>>

BstDE I

Enzyme name BstDE I
Prototype DdeI
Known analogs DdeI, HpyF3I
SKU SE-E227
Turbo version Available
High-concentration version Not available
Restriction type Type IIPiType IIP enzymes are classical Type II restriction enzymes with palindromic recognition sequences and symmetric cleavage sites.
Recognition site
5'… CTNAG …3'
3'… GANTC …5'
Source Bacillus stearothermophilus DE
Optimal buffer SE-buffer G (10 mM Tris-HCl (pH 7.6 at 25°C); 10 mM MgCl2; 50 mM NaCl; 1 mM DTT.)
Optimal temperature 60 °C
Inactivation temperature 80 °C
Buffer activity
BGOWYROSE
75100255010100
Unit definition One unit of the enzyme is the amount required to hydrolyze 1 μg of Lambda DNA in 1 hour at 60°C in a total reaction volume of 50 μl.
Assayed on Lambda DNA
Storage conditions 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 100 mM NaCl; 0.1 mM EDTA; 7 mM 2-mercaptoethanol; 50% glycerol; Store at -20°C.
Ligation After 20-fold overdigestion with enzyme 90% of the DNA fragments can be ligated and recut
Nonspecific hydrolysis No nonspecific activity was detected after incubation of 1 μg of Lambda DNA with 40 u.a. of enzyme for 16 hours at 60°C.
Methylation sensitivity not tested
Reagents supplied with enzyme 10 X SE-buffer G
Notes At 37°C activity is 50%-75% from maximum.
References
  1. Unpublished data Shinkarenko, N.M., Shevchenko, A.V., Dedkov, V.S., Abdurashitov, M.A., Degtyarev, S.K Unpublished observations (1995).
// Код для некролога