SibEnzyme REBase

restriction enzymes database

Name search

Sequence search

Restriction enzyme search by DNA sequence
A, G, C, T: up to 50 nucleotides. Sequences up to 10 nucleotides may also contain R, W, S, K, M, Y, B, D, H, V, N.

Enzyme list

Quick navigation
ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ
Enzyme Prototype Recognition site Supply options
A back to alphabet
Aat II AatII
5'… GACGT▼C …3'
3'… C▲TGCAG …5'
 >>>
Abs I AbsI
5'… CC▼TCGAGG …3'
3'… GGAGCT▲CC …5'
 >>>
Acc16 I MstI
5'… TGC▼GCA …3'
3'… ACG▲CGT …5'
 >>>
Acc36 I BspMI
5'… ACCTGC(N)4▼ …3'
3'… TGGACG(N)8▲ …5'
 >>>
Acc65 I KpnI
5'… G▼GTACC …3'
3'… CCATG▲G …5'
 >>>
AccB1 I HgiCI
5'… G▼GYRCC …3'
3'… CCRYG▲G …5'
 >>>
AccB7 I PflMI
5'… CCANNNN▼NTGG …3'
3'… GGTN▲NNNNACC …5'
 >>>
AccBS I BsrBI
5'… GAG▼CGG …3'
3'… CTC▲GCC …5'
 >>>
Acl I AclI
5'… AA▼CGTT …3'
3'… TTGC▲AA …5'
 >>>
AclW I BinI
5'… GGATC(N)4▼ …3'
3'… CCTAG(N)5▲ …5'
 >>>
Aco I CfrI
5'… Y▼GGCCR …3'
3'… RCCGG▲Y …5'
 >>>
Acs I ApoI
5'… R▼AATTY …3'
3'… YTTAA▲R …5'
 >>>
Acu I Eco57I
5'… CTGAAG(N)16▼ …3'
3'… GACTTC(N)14▲ …5'
 >>>
Afe I Eco47III
5'… AGC▼GCT …3'
3'… TCG▲CGA …5'
 >>>
Ags I AgsI
5'… TTS▼AA …3'
3'… AA▲STT …5'
 >>>
Ahl I SpeI
5'… A▼CTAGT …3'
3'… TGATC▲A …5'
 >>>
Ajn I EcoRII
5'… ▼CCWGG …3'
3'… GGWCC▲ …5'
 >>>
Ale I OliI
5'… CACNN▼NNGTG …3'
3'… GTGNN▲NNCAC …5'
 >>>
Alu I AluI
5'… AG▼CT …3'
3'… TC▲GA …5'
 >>>
AluB I AluI
5'… AG▼CT …3'
3'… TC▲GA …5'
 >>>
Ama87 I AvaI
5'… C▼YCGRG …3'
3'… GRGCY▲C …5'
 >>>
Aox I AoxI
5'… ▼RG(5mC)Y …3'
3'… Y(5mC)GR▲ …5'
 >>>
Apa I ApaI
5'… GGGCC▼C …3'
3'… C▲CCGGG …5'
 >>>
Ars I ArsI
5'… ▼(N)8GACNNNNNNTTYG(N)11▼ …3'
3'… ▲(N)13CTGNNNNNNAARC(N)6▲ …5'
 >>>
AsiG I AgeI
5'… A▼CCGGT …3'
3'… TGGCC▲A …5'
 >>>
AsiS I #Н/Д
5'… GCGAT▼CGC …3'
3'… CGC▲TAGCG …5'
 >>>
AspA2 I AvrII
5'… C▼CTAGG …3'
3'… GGATC▲C …5'
 >>>
AspLE I HhaI
5'… GCG▼C …3'
3'… C▲GCG …5'
 >>>
AspS9 I Sau96I
5'… G▼GNCC …3'
3'… CCNG▲G …5'
 >>>
AsuC2 I CauII
5'… CC▼SGG …3'
3'… GGS▲CC …5'
 >>>
AsuHP I HphI
5'… GGTGA(N)8▼ …3'
3'… CCACT(N)7▲ …5'
 >>>
AsuNH I NheI
5'… G▼CTAGC …3'
3'… CGATC▲G …5'
 >>>
B back to alphabet
BamH I BamHI
5'… G▼GATCC …3'
3'… CCTAG▲G …5'
 >>>
Bar I BarI
5'… ▼(N)7GAAGNNNNNNTAC(N)12▼ …3'
3'… ▲(N)12CTTCNNNNNNATG(N)7▲ …5'
 >>>
Bbv12 I HgiAI
5'… GWGCW▼C …3'
3'… C▲WCGWG …5'
 >>>
Bgl I BglI
5'… GCCNNNN▼NGGC …3'
3'… CGGN▲NNNNCCG …5'
 >>>
Bgl II BglII
5'… A▼GATCT …3'
3'… TCTAG▲A …5'
 >>>
Bls I BlsI Неверный формат сайта узнавания >>>
Bme18 I AvaII
5'… G▼GWCC …3'
3'… CCWG▲G …5'
 >>>
Bmo I SanDI
5'… GG▼GWCCC …3'
3'… CCCWG▲GG …5'
 >>>
Bmt I NheI
5'… GCTAG▼C …3'
3'… C▲GATCG …5'
 >>>
Bmu I BfiI
5'… ACTGGG(N)5▼ …3'
3'… TGACCC(N)4▲ …5'
 >>>
Bpm I GsuI
5'… CTGGAG(N)16▼ …3'
3'… GACCTC(N)14▲ …5'
 >>>
Bpu10 I Bpu10I
5'… CC▼TNAGC …3'
3'… GGANT▲CG …5'
 >>>
Bpu14 I AsuII
5'… TT▼CGAA …3'
3'… AAGC▲TT …5'
 >>>
Bsa29 I ClaI
5'… AT▼CGAT …3'
3'… TAGC▲TA …5'
 >>>
Bsc4 I BsiYI
5'… CCNNNNN▼NNGG …3'
3'… GGNN▲NNNNNCC …5'
 >>>
Bse1 I BsrI
5'… ACTGGN▼ …3'
3'… TGAC▲CN …5'
 >>>
Bse118 I Cfr10I
5'… R▼CCGGY …3'
3'… YGGCC▲R …5'
 >>>
Bse21 I SauI
5'… CC▼TNAGG …3'
3'… GGANT▲CC …5'
 >>>
Bse3D I BsrDI
5'… GCAATGNN▼ …3'
3'… CGTTAC▲NN …5'
 >>>
Bse8 I BsaBI
5'… GATNN▼NNATC …3'
3'… CTANN▲NNTAG …5'
 >>>
BseP I BsePI
5'… G▼CGCGC …3'
3'… CGCGC▲G …5'
 >>>
BseX3 I XmaIII
5'… C▼GGCCG …3'
3'… GCCGG▲C …5'
 >>>
BslF I FinI
5'… GGGAC(N)10▼ …3'
3'… CCCTG(N)14▲ …5'
 >>>
Bso31 I Eco31I
5'… GGTCTCN▼ …3'
3'… CCAGAG(N)5▲ …5'
 >>>
Bsp13 I BspMII
5'… T▼CCGGA …3'
3'… AGGCC▲T …5'
 >>>
Bsp1720 I EspI
5'… GC▼TNAGC …3'
3'… CGANT▲CG …5'
 >>>
Bsp19 I NcoI
5'… C▼CATGG …3'
3'… GGTAC▲C …5'
 >>>
BspAC I AciI
5'… C▼CGC …3'
3'… GGC▲G …5'
 >>>
BspFN I FnuDII
5'… CG▼CG …3'
3'… GC▲GC …5'
 >>>
BssEC I SecI
5'… C▼CNNGG …3'
3'… GGNNC▲C …5'
 >>>
BssNA I SnaI
5'… GTA▼TAC …3'
3'… CAT▲ATG …5'
 >>>
BssT1 I StyI
5'… C▼CWWGG …3'
3'… GGWWC▲C …5'
 >>>
Bst2B I BsiI
5'… C▼TCGTG …3'
3'… GAGCA▲C …5'
 >>>
Bst2U I BstNI
5'… CC▼WGG …3'
3'… GGW▲CC …5'
 >>>
Bst4C I Tsp4CI
5'… ACN▼GT …3'
3'… TG▲NCA …5'
 >>>
Bst6 I Ksp632I
5'… CTCTTCN▼ …3'
3'… GAGAAG(N)4▲ …5'
 >>>
BstAC I AcyI
5'… GR▼CGYC …3'
3'… CYGC▲RG …5'
 >>>
BstAF I AflII
5'… C▼TTAAG …3'
3'… GAATT▲C …5'
 >>>
BstAP I (ApaBI)
5'… GCANNNN▼NTGC …3'
3'… CGTN▲NNNNACG …5'
 >>>
BstAU I Bsp1407I
5'… T▼GTACA …3'
3'… ACATG▲T …5'
 >>>
BstBA I BsaAI
5'… YAC▼GTR …3'
3'… RTG▲CAY …5'
 >>>
BstC8 I Cac8I
5'… GCN▼NGC …3'
3'… CGN▲NCG …5'
 >>>
BstDE I DdeI
5'… C▼TNAG …3'
3'… GANT▲C …5'
 >>>
BstDS I DsaI
5'… C▼CRYGG …3'
3'… GGYRC▲C …5'
 >>>
BstEN I EcoNI
5'… CCTNN▼NNNAGG …3'
3'… GGANNN▲NNTCC …5'
 >>>
BstF5 I (FokI)
5'… GGATGNN▼ …3'
3'… CCTAC▲NN …5'
 >>>
BstFN I FnuDII
5'… CG▼CG …3'
3'… GC▲GC …5'
 >>>
BstH2 I HaeII
5'… RGCGC▼Y …3'
3'… Y▲CGCGR …5'
 >>>
BstHH I HhaI
5'… GCG▼C …3'
3'… C▲GCG …5'
 >>>
BstKT I MboI
5'… GAT▼C …3'
3'… C▲TAG …5'
 >>>
BstMA I BsmAI
5'… GTCTCN▼ …3'
3'… CAGAG(N)5▲ …5'
 >>>
BstMB I MboI
5'… ▼GATC …3'
3'… CTAG▲ …5'
 >>>
BstMC I McrI
5'… CGRY▼CG …3'
3'… GC▲YRGC …5'
 >>>
BstMW I MwoI
5'… GCNNNNN▼NNGC …3'
3'… CGNN▲NNNNNCG …5'
 >>>
BstNS I NspI
5'… RCATG▼Y …3'
3'… Y▲GTACR …5'
 >>>
BstPA I PshAI
5'… GACNN▼NNGTC …3'
3'… CTGNN▲NNCAG …5'
 >>>
BstSC I ScrFI
5'… ▼CCNGG …3'
3'… GGNCC▲ …5'
 >>>
BstSF I SfeI
5'… C▼TRYAG …3'
3'… GAYRT▲C …5'
 >>>
BstSL I BseSI
5'… GKGCm▼C …3'
3'… C▲mCGKG …5'
 >>>
BstSN I SnaBI
5'… TAC▼GTA …3'
3'… ATG▲CAT …5'
 >>>
BstV1 I BbvI
5'… GCAGC(N)8▼ …3'
3'… CGTCG(N)12▲ …5'
 >>>
BstV2 I BbvII
5'… GAAGAC(N)2▼ …3'
3'… CTTCTG(N)6▲ …5'
 >>>
BstX I BstXI
5'… CCANNNNN▼NTGG …3'
3'… GGTN▲NNNNNACC …5'
 >>>
BstX2 I XhoII
5'… R▼GATCY …3'
3'… YCTAG▲R …5'
 >>>
Bsu I BciVI
5'… GTATCC(N)6▼ …3'
3'… CATAGG(N)5▲ …5'
 >>>
BsuR I HaeIII
5'… GG▼CC …3'
3'… CC▲GG …5'
 >>>
Btr I BtrI
5'… CAC▼GTC …3'
3'… GTG▲CAG …5'
 >>>
C back to alphabet
Cci I BspHI
5'… T▼CATGA …3'
3'… AGTAC▲T …5'
 >>>
CciN I NotI
5'… GC▼GGCCGC …3'
3'… CGCCGG▲CG …5'
 >>>
D back to alphabet
Dra I AhaIII
5'… TTT▼AAA …3'
3'… AAA▲TTT …5'
 >>>
Dra III DraIII
5'… CACNNN▼GTG …3'
3'… GTG▲NNNCAC …5'
 >>>
Dri I Eam1105I
5'… GACNNN▼NNGTC …3'
3'… CTGNN▲NNNCAG …5'
 >>>
DseD I DrdI
5'… GACNNNN▼NNGTC …3'
3'… CTGNN▲NNNNCAG …5'
 >>>
E back to alphabet
EcoICR I SacI
5'… GAG▼CTC …3'
3'… CTC▲GAG …5'
 >>>
EcoR I EcoRI
5'… G▼AATTC …3'
3'… CTTAA▲G …5'
 >>>
EcoR V EcoRV
5'… GAT▼ATC …3'
3'… CTA▲TAG …5'
 >>>
Ege I NarI
5'… GGC▼GCC …3'
3'… CCG▲CGG …5'
 >>>
Emi I Ksp632I
5'… CTCTTC(N)1▼ …3'
3'… GAGAAG(N)4▲ …5'
 >>>
Erh I StyI
5'… C▼CWWGG …3'
3'… GGWWC▲C …5'
 >>>
F back to alphabet
Fae I NlaIII
5'… CATG▼ …3'
3'… ▲GTAC …5'
 >>>
Fai I FaiI
5'… YA▼TR …3'
3'… RT▲AY …5'
 >>>
Fal I FalI
5'… ▼(N)8AAGNNNNNCTT(N)13▼ …3'
3'… ▲(N)13TTCNNNNNGAA(N)8▲ …5'
 >>>
Fat I NlaIII
5'… ▼CATG …3'
3'… GTAC▲ …5'
 >>>
Fau I FauI
5'… CCCGC(N)4▼ …3'
3'… GGGCG(N)6▲ …5'
 >>>
FauND I NdeI
5'… CA▼TATG …3'
3'… GTAT▲AC …5'
 >>>
Fbl I AccI
5'… GT▼mKAC …3'
3'… CAKm▲TG …5'
 >>>
Fok I FokI
5'… GGATG(N)9▼ …3'
3'… CCTAC(N)13▲ …5'
 >>>
FriO I BanII
5'… GRGCY▼C …3'
3'… C▲YCGRG …5'
 >>>
Fsp4H I Fnu4HI
5'… GC▼NGC …3'
3'… CGN▲CG …5'
 >>>
G back to alphabet
Gla I GlaI
5'… R(5mC)▼GY …3'
3'… YG▲(5mC)R …5'
 >>>
Glu I GluI
5'… G(5mC)▼NG(5mC) …3'
3'… (5mC)GN▲(5mC)G …5'
 >>>
Gsa I BseYI
5'… CCCAG▼C …3'
3'… G▲GGTCG …5'
 >>>
H back to alphabet
Hae III HaeIII
5'… GG▼CC …3'
3'… CC▲GG …5'
 >>>
Hga I HgaI
5'… GACGC(N)5▼ …3'
3'… CTGCG(N)10▲ …5'
 >>>
Hind II HindII
5'… GTY▼RAC …3'
3'… CAR▲YTG …5'
 >>>
Hind III HindIII
5'… A▼AGCTT …3'
3'… TTCGA▲A …5'
 >>>
Hinf I HinfI
5'… G▼ANTC …3'
3'… CTNA▲G …5'
 >>>
Hpa I HpaI
5'… GTT▼AAC …3'
3'… CAA▲TTG …5'
 >>>
Hpa II HpaII
5'… C▼CGG …3'
3'… GGC▲C …5'
 >>>
HpySE526 I MaeII
5'… A▼CGT …3'
3'… TGC▲A …5'
 >>>
HspA I HhaI
5'… G▼CGC …3'
3'… CGC▲G …5'
 >>>
K back to alphabet
Kpn I KpnI
5'… GGTAC▼C …3'
3'… C▲CATGG …5'
 >>>
Kro I KroI
5'… G▼C(5mC)GGC …3'
3'… CGG(5mC)C▲G …5'
 >>>
KroN I NaeI
5'… GCC▼GGC …3'
3'… CGG▲CCG …5'
 >>>
Ksp22 I BclI
5'… T▼GATCA …3'
3'… ACTAG▲T …5'
 >>>
Kzo9 I MboI
5'… ▼GATC …3'
3'… CTAG▲ …5'
 >>>
L back to alphabet
Lmn I LmnI
5'… GCTCCN▼ …3'
3'… CGAG▲GN …5'
 >>>
M back to alphabet
Mab I SexAI
5'… A▼CCWGGT …3'
3'… TGGWCC▲A …5'
 >>>
Mal I DpnI
5'… G(mA)▼TC …3'
3'… CT▲(mA)G …5'
 >>>
Mbo II MboII
5'… GAAGA(N)8▼ …3'
3'… CTTCT(N)7▲ …5'
 >>>
Mfe I MfeI
5'… C▼AATTG …3'
3'… GTTAA▲C …5'
 >>>
Mhl I SduI
5'… GDGCH▼C …3'
3'… C▲HCGDG …5'
 >>>
Mlu I MluI
5'… A▼CGCGT …3'
3'… TGCGC▲A …5'
 >>>
Mly113 I NarI
5'… GG▼CGCC …3'
3'… CCGC▲GG …5'
 >>>
Mnl I MnlI
5'… CCTC(N)7▼ …3'
3'… GGAG(N)6▲ …5'
 >>>
Mox20 I BalI
5'… TGG▼CCA …3'
3'… ACC▲GGT …5'
 >>>
MroN I (NaeI)
5'… G▼CCGGC …3'
3'… CGGCC▲G …5'
 >>>
MroX I XmnI
5'… GAANN▼NNTTC …3'
3'… CTTNN▲NNAAG …5'
 >>>
Msp I HpaII
5'… C▼CGG …3'
3'… GGC▲C …5'
 >>>
MspA1 I NspBII
5'… CmG▼CKG …3'
3'… GKC▲GmC …5'
 >>>
MspR9 I ScrFI
5'… CC▼NGG …3'
3'… GGN▲CC …5'
 >>>
Mte I Mte
5'… G(5mC)G(5mC)▼NG(5mC)G(5mC) …3'
3'… (5mC)G(5mC)GN▲(5mC)G(5mC)G …5'
 >>>
N back to alphabet
Nru I NruI
5'… TCG▼CGA …3'
3'… AGC▲GCT …5'
 >>>
P back to alphabet
PalA I AscI
5'… GG▼CGCGCC …3'
3'… CCGCGC▲GG …5'
 >>>
Pce I StuI
5'… AGG▼CCT …3'
3'… TCC▲GGA …5'
 >>>
Pci I BspLU11I
5'… A▼CATGT …3'
3'… TGTAC▲A …5'
 >>>
PciS I SapI
5'… GCTCTTCN▼ …3'
3'… CGAGAAG(N)4▲ …5'
 >>>
Pcs I PcsI
5'… (5mC)GNNNNN▼NN(5mC)G …3'
3'… G(5mC)NN▲NNNNNG(5mC) …5'
 >>>
Pct I BsmI
5'… GAATGCN▼ …3'
3'… CTTAC▲GN …5'
 >>>
Pec I PsiI
5'… TTA▼TAA …3'
3'… AAT▲ATT …5'
 >>>
Pkr I PkrI
5'… G(5mC)N▼G(5mC) …3'
3'… (5mC)G▲N(5mC)G …5'
 >>>
Ple19 I PvuI
5'… CGAT▼CG …3'
3'… GC▲TAGC …5'
 >>>
Pps I PleI
5'… GAGTC(N)4▼ …3'
3'… CTCAG(N)5▲ …5'
 >>>
Pse31 I Eco31I
5'… GGTCTC(N)1▼ …3'
3'… CCAGAG(N)5▲ …5'
 >>>
Psi I PsiI
5'… TTA▼TAA …3'
3'… AAT▲ATT …5'
 >>>
Psp124B I SacI
5'… GAGCT▼C …3'
3'… C▲TCGAG …5'
 >>>
Psp6 I EcoRII
5'… ▼CCWGG …3'
3'… GGWCC▲ …5'
 >>>
PspC I PmaCI
5'… CAC▼GTG …3'
3'… GTG▲CAC …5'
 >>>
PspE I BstEII
5'… G▼GTNACC …3'
3'… CCANTG▲G …5'
 >>>
PspL I SplI
5'… C▼GTACG …3'
3'… GCATG▲C …5'
 >>>
PspN4 I NlaIV
5'… GGN▼NCC …3'
3'… CCN▲NGG …5'
 >>>
PspOM I (ApaI)
5'… G▼GGCCC …3'
3'… CCCGG▲G …5'
 >>>
PspPP I PpuMI
5'… RG▼GWCCY …3'
3'… YCCWG▲GR …5'
 >>>
PspX I PspXI
5'… VC▼TCGAGB …3'
3'… BGAGCT▲CV …5'
 >>>
Psr I PsrI
5'… ▼(N)7GAACNNNNNNTAC(N)12▼ …3'
3'… ▲(N)12CTTGNNNNNNATG(N)7▲ …5'
 >>>
Pst I PstI
5'… CTGCA▼G …3'
3'… G▲ACGTC …5'
 >>>
PstN I AlwNI
5'… CAGNNN▼CTG …3'
3'… GTC▲NNNGAC …5'
 >>>
Pvu II PvuII
5'… CAG▼CTG …3'
3'… GTC▲GAC …5'
 >>>
R back to alphabet
Rga I SgfI
5'… GCGAT▼CGC …3'
3'… CGC▲TAGCG …5'
 >>>
Rig I FseI
5'… GGCCGG▼CC …3'
3'… CC▲GGCCGG …5'
 >>>
Rsa I RsaI
5'… GT▼AC …3'
3'… CA▲TG …5'
 >>>
RsaN I RsaI
5'… G▼TAC …3'
3'… CAT▲G …5'
 >>>
Rsr2 I RsrII
5'… CG▼GWCCG …3'
3'… GCCWG▲GC …5'
 >>>
S back to alphabet
Sal I SalI
5'… G▼TCGAC …3'
3'… CAGCT▲G …5'
 >>>
Sbf I Sse8387I
5'… CCTGCA▼GG …3'
3'… GG▲ACGTCC …5'
 >>>
Set I SetI
5'… ASST▼ …3'
3'… ▲TSSA …5'
 >>>
SfaN I SfaNI
5'… GCATC(N)5▼ …3'
3'… CGTAG(N)9▲ …5'
 >>>
Sfi I SfiI
5'… GGCCNNNN▼NGGCC …3'
3'… CCGGN▲NNNNCCGG …5'
 >>>
Sfr274 I XhoI
5'… C▼TCGAG …3'
3'… GAGCT▲C …5'
 >>>
Sfr303 I SacII
5'… CCGC▼GG …3'
3'… GG▲CGCC …5'
 >>>
Sma I SmaI
5'… CCC▼GGG …3'
3'… GGG▲CCC …5'
 >>>
Smi I SwaI
5'… ATTT▼AAAT …3'
3'… TAAA▲TTTA …5'
 >>>
SmiM I MslI
5'… CAYNN▼NNRTG …3'
3'… GTRNN▲NNYAC …5'
 >>>
Sph I SphI
5'… GCATG▼C …3'
3'… C▲GTACG …5'
 >>>
Sse9 I Tsp509I
5'… ▼AATT …3'
3'… TTAA▲ …5'
 >>>
Ssp I SspI
5'… AAT▼ATT …3'
3'… TTA▲TAA …5'
 >>>
SspM I BfaI
5'… C▼TAG …3'
3'… GAT▲C …5'
 >>>
T back to alphabet
Taq I TaqI
5'… T▼CGA …3'
3'… AGC▲T …5'
 >>>
Tru9 I MseI
5'… T▼TAA …3'
3'… AAT▲T …5'
 >>>
TseF I Tsp45I
5'… ▼GTSAC …3'
3'… CASTG▲ …5'
 >>>
Tth111 I Tth111I
5'… GACN▼NNGTC …3'
3'… CTGNN▲NCAG …5'
 >>>
V back to alphabet
Vne I ApaLI
5'… G▼TGCAC …3'
3'… CACGT▲G …5'
 >>>
Vsp I VspI
5'… AT▼TAAT …3'
3'… TAAT▲TA …5'
 >>>
X back to alphabet
Xba I XbaI
5'… T▼CTAGA …3'
3'… AGATC▲T …5'
 >>>
Xma I XmaI
5'… C▼CCGGG …3'
3'… GGGCC▲C …5'
 >>>
Z back to alphabet
Zra I (AatII)
5'… GAC▼GTC …3'
3'… CTG▲CAG …5'
 >>>
Zrm I ScaI
5'… AGT▼ACT …3'
3'… TCA▲TGA …5'
 >>>
Zsp2 I NsiI
5'… ATGCA▼T …3'
3'… T▲ACGTA …5'
 >>>

Isoshizomers

Hga I

Enzyme name Hga I
Prototype HgaI
Known analogs CseI
SKU SE-E461
Turbo version Not available
High-concentration version Not available
Restriction type Type IISiType IIS enzymes recognize asymmetric DNA sequences and cleave outside the recognition site at a defined distance. They are widely used in Golden Gate assembly.
Recognition site
5'… GACGC(N)5▼ …3'
3'… CTGCG(N)10▲ …5'
Source An E.coli strain that carries the cloned HgaI gene from Haemophilus gallinarum
Optimal buffer SE-buffer B (10 mM Tris-HCl (pH 7.6 at 25°C); 10 mM MgCl2; 1 mM DTT.)
Optimal temperature 37 °C
Inactivation temperature 65 °C
Buffer activity
BGOWYROSE
1007510255050
Unit definition One unit of the enzyme is the amount required to hydrolyze 1 μg of DNA pBR322 in 1 hour at 37°C in a total reaction volume of 50 μl.
Assayed on DNA pBR322
Storage conditions 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 50 mM NaCl; 0.1 mM EDTA; 1 mM DTT; 200 μg/ml BSA; 50% glycerol; Store at -20°C.
Ligation After 3-fold overdigestion with enzyme more than 90% of the DNA fragments can be ligated and recut.
Nonspecific hydrolysis Incubation with > 2 units of HgaI per 1 μg of DNA and digestion > 1 hour are not recommended.
Methylation sensitivity Blocked by CG methylation.
Reagents supplied with enzyme 10 X SE-buffer B
Notes Incubation with more than 2 units of enzyme per 1 μg of DNA for longer than 1 hour at 37°C is not recommended.
References
  1. S.Kh. Degtyarev, V.E. Repin, N.A. Bozhko, S.N. Schelkunov Preparation method of restriction endonuclease Hga I // Soviet Union patent SU1389292 (1985). (In Russian)
// Код для некролога