SibEnzyme REBase

restriction enzymes database

Name search

Sequence search

Restriction enzyme search by DNA sequence
A, G, C, T: up to 50 nucleotides. Sequences up to 10 nucleotides may also contain R, W, S, K, M, Y, B, D, H, V, N.

Enzyme list

Quick navigation
ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ
Enzyme Prototype Recognition site Supply options
A back to alphabet
Aat II AatII
5'… GACGT▼C …3'
3'… C▲TGCAG …5'
 >>>
Abs I AbsI
5'… CC▼TCGAGG …3'
3'… GGAGCT▲CC …5'
 >>>
Acc16 I MstI
5'… TGC▼GCA …3'
3'… ACG▲CGT …5'
 >>>
Acc36 I BspMI
5'… ACCTGC(N)4▼ …3'
3'… TGGACG(N)8▲ …5'
 >>>
Acc65 I KpnI
5'… G▼GTACC …3'
3'… CCATG▲G …5'
 >>>
AccB1 I HgiCI
5'… G▼GYRCC …3'
3'… CCRYG▲G …5'
 >>>
AccB7 I PflMI
5'… CCANNNN▼NTGG …3'
3'… GGTN▲NNNNACC …5'
 >>>
AccBS I BsrBI
5'… GAG▼CGG …3'
3'… CTC▲GCC …5'
 >>>
Acl I AclI
5'… AA▼CGTT …3'
3'… TTGC▲AA …5'
 >>>
AclW I BinI
5'… GGATC(N)4▼ …3'
3'… CCTAG(N)5▲ …5'
 >>>
Aco I CfrI
5'… Y▼GGCCR …3'
3'… RCCGG▲Y …5'
 >>>
Acs I ApoI
5'… R▼AATTY …3'
3'… YTTAA▲R …5'
 >>>
Acu I Eco57I
5'… CTGAAG(N)16▼ …3'
3'… GACTTC(N)14▲ …5'
 >>>
Afe I Eco47III
5'… AGC▼GCT …3'
3'… TCG▲CGA …5'
 >>>
Ags I AgsI
5'… TTS▼AA …3'
3'… AA▲STT …5'
 >>>
Ahl I SpeI
5'… A▼CTAGT …3'
3'… TGATC▲A …5'
 >>>
Ajn I EcoRII
5'… ▼CCWGG …3'
3'… GGWCC▲ …5'
 >>>
Ale I OliI
5'… CACNN▼NNGTG …3'
3'… GTGNN▲NNCAC …5'
 >>>
Alu I AluI
5'… AG▼CT …3'
3'… TC▲GA …5'
 >>>
AluB I AluI
5'… AG▼CT …3'
3'… TC▲GA …5'
 >>>
Ama87 I AvaI
5'… C▼YCGRG …3'
3'… GRGCY▲C …5'
 >>>
Aox I AoxI
5'… ▼RG(5mC)Y …3'
3'… Y(5mC)GR▲ …5'
 >>>
Apa I ApaI
5'… GGGCC▼C …3'
3'… C▲CCGGG …5'
 >>>
Ars I ArsI
5'… ▼(N)8GACNNNNNNTTYG(N)11▼ …3'
3'… ▲(N)13CTGNNNNNNAARC(N)6▲ …5'
 >>>
AsiG I AgeI
5'… A▼CCGGT …3'
3'… TGGCC▲A …5'
 >>>
AsiS I #Н/Д
5'… GCGAT▼CGC …3'
3'… CGC▲TAGCG …5'
 >>>
AspA2 I AvrII
5'… C▼CTAGG …3'
3'… GGATC▲C …5'
 >>>
AspLE I HhaI
5'… GCG▼C …3'
3'… C▲GCG …5'
 >>>
AspS9 I Sau96I
5'… G▼GNCC …3'
3'… CCNG▲G …5'
 >>>
AsuC2 I CauII
5'… CC▼SGG …3'
3'… GGS▲CC …5'
 >>>
AsuHP I HphI
5'… GGTGA(N)8▼ …3'
3'… CCACT(N)7▲ …5'
 >>>
AsuNH I NheI
5'… G▼CTAGC …3'
3'… CGATC▲G …5'
 >>>
B back to alphabet
BamH I BamHI
5'… G▼GATCC …3'
3'… CCTAG▲G …5'
 >>>
Bar I BarI
5'… ▼(N)7GAAGNNNNNNTAC(N)12▼ …3'
3'… ▲(N)12CTTCNNNNNNATG(N)7▲ …5'
 >>>
Bbv12 I HgiAI
5'… GWGCW▼C …3'
3'… C▲WCGWG …5'
 >>>
Bgl I BglI
5'… GCCNNNN▼NGGC …3'
3'… CGGN▲NNNNCCG …5'
 >>>
Bgl II BglII
5'… A▼GATCT …3'
3'… TCTAG▲A …5'
 >>>
Bls I BlsI Неверный формат сайта узнавания >>>
Bme18 I AvaII
5'… G▼GWCC …3'
3'… CCWG▲G …5'
 >>>
Bmo I SanDI
5'… GG▼GWCCC …3'
3'… CCCWG▲GG …5'
 >>>
Bmt I NheI
5'… GCTAG▼C …3'
3'… C▲GATCG …5'
 >>>
Bmu I BfiI
5'… ACTGGG(N)5▼ …3'
3'… TGACCC(N)4▲ …5'
 >>>
Bpm I GsuI
5'… CTGGAG(N)16▼ …3'
3'… GACCTC(N)14▲ …5'
 >>>
Bpu10 I Bpu10I
5'… CC▼TNAGC …3'
3'… GGANT▲CG …5'
 >>>
Bpu14 I AsuII
5'… TT▼CGAA …3'
3'… AAGC▲TT …5'
 >>>
Bsa29 I ClaI
5'… AT▼CGAT …3'
3'… TAGC▲TA …5'
 >>>
Bsc4 I BsiYI
5'… CCNNNNN▼NNGG …3'
3'… GGNN▲NNNNNCC …5'
 >>>
Bse1 I BsrI
5'… ACTGGN▼ …3'
3'… TGAC▲CN …5'
 >>>
Bse118 I Cfr10I
5'… R▼CCGGY …3'
3'… YGGCC▲R …5'
 >>>
Bse21 I SauI
5'… CC▼TNAGG …3'
3'… GGANT▲CC …5'
 >>>
Bse3D I BsrDI
5'… GCAATGNN▼ …3'
3'… CGTTAC▲NN …5'
 >>>
Bse8 I BsaBI
5'… GATNN▼NNATC …3'
3'… CTANN▲NNTAG …5'
 >>>
BseP I BsePI
5'… G▼CGCGC …3'
3'… CGCGC▲G …5'
 >>>
BseX3 I XmaIII
5'… C▼GGCCG …3'
3'… GCCGG▲C …5'
 >>>
BslF I FinI
5'… GGGAC(N)10▼ …3'
3'… CCCTG(N)14▲ …5'
 >>>
Bso31 I Eco31I
5'… GGTCTCN▼ …3'
3'… CCAGAG(N)5▲ …5'
 >>>
Bsp13 I BspMII
5'… T▼CCGGA …3'
3'… AGGCC▲T …5'
 >>>
Bsp1720 I EspI
5'… GC▼TNAGC …3'
3'… CGANT▲CG …5'
 >>>
Bsp19 I NcoI
5'… C▼CATGG …3'
3'… GGTAC▲C …5'
 >>>
BspAC I AciI
5'… C▼CGC …3'
3'… GGC▲G …5'
 >>>
BspFN I FnuDII
5'… CG▼CG …3'
3'… GC▲GC …5'
 >>>
BssEC I SecI
5'… C▼CNNGG …3'
3'… GGNNC▲C …5'
 >>>
BssNA I SnaI
5'… GTA▼TAC …3'
3'… CAT▲ATG …5'
 >>>
BssT1 I StyI
5'… C▼CWWGG …3'
3'… GGWWC▲C …5'
 >>>
Bst2B I BsiI
5'… C▼TCGTG …3'
3'… GAGCA▲C …5'
 >>>
Bst2U I BstNI
5'… CC▼WGG …3'
3'… GGW▲CC …5'
 >>>
Bst4C I Tsp4CI
5'… ACN▼GT …3'
3'… TG▲NCA …5'
 >>>
Bst6 I Ksp632I
5'… CTCTTCN▼ …3'
3'… GAGAAG(N)4▲ …5'
 >>>
BstAC I AcyI
5'… GR▼CGYC …3'
3'… CYGC▲RG …5'
 >>>
BstAF I AflII
5'… C▼TTAAG …3'
3'… GAATT▲C …5'
 >>>
BstAP I (ApaBI)
5'… GCANNNN▼NTGC …3'
3'… CGTN▲NNNNACG …5'
 >>>
BstAU I Bsp1407I
5'… T▼GTACA …3'
3'… ACATG▲T …5'
 >>>
BstBA I BsaAI
5'… YAC▼GTR …3'
3'… RTG▲CAY …5'
 >>>
BstC8 I Cac8I
5'… GCN▼NGC …3'
3'… CGN▲NCG …5'
 >>>
BstDE I DdeI
5'… C▼TNAG …3'
3'… GANT▲C …5'
 >>>
BstDS I DsaI
5'… C▼CRYGG …3'
3'… GGYRC▲C …5'
 >>>
BstEN I EcoNI
5'… CCTNN▼NNNAGG …3'
3'… GGANNN▲NNTCC …5'
 >>>
BstF5 I (FokI)
5'… GGATGNN▼ …3'
3'… CCTAC▲NN …5'
 >>>
BstFN I FnuDII
5'… CG▼CG …3'
3'… GC▲GC …5'
 >>>
BstH2 I HaeII
5'… RGCGC▼Y …3'
3'… Y▲CGCGR …5'
 >>>
BstHH I HhaI
5'… GCG▼C …3'
3'… C▲GCG …5'
 >>>
BstKT I MboI
5'… GAT▼C …3'
3'… C▲TAG …5'
 >>>
BstMA I BsmAI
5'… GTCTCN▼ …3'
3'… CAGAG(N)5▲ …5'
 >>>
BstMB I MboI
5'… ▼GATC …3'
3'… CTAG▲ …5'
 >>>
BstMC I McrI
5'… CGRY▼CG …3'
3'… GC▲YRGC …5'
 >>>
BstMW I MwoI
5'… GCNNNNN▼NNGC …3'
3'… CGNN▲NNNNNCG …5'
 >>>
BstNS I NspI
5'… RCATG▼Y …3'
3'… Y▲GTACR …5'
 >>>
BstPA I PshAI
5'… GACNN▼NNGTC …3'
3'… CTGNN▲NNCAG …5'
 >>>
BstSC I ScrFI
5'… ▼CCNGG …3'
3'… GGNCC▲ …5'
 >>>
BstSF I SfeI
5'… C▼TRYAG …3'
3'… GAYRT▲C …5'
 >>>
BstSL I BseSI
5'… GKGCm▼C …3'
3'… C▲mCGKG …5'
 >>>
BstSN I SnaBI
5'… TAC▼GTA …3'
3'… ATG▲CAT …5'
 >>>
BstV1 I BbvI
5'… GCAGC(N)8▼ …3'
3'… CGTCG(N)12▲ …5'
 >>>
BstV2 I BbvII
5'… GAAGAC(N)2▼ …3'
3'… CTTCTG(N)6▲ …5'
 >>>
BstX I BstXI
5'… CCANNNNN▼NTGG …3'
3'… GGTN▲NNNNNACC …5'
 >>>
BstX2 I XhoII
5'… R▼GATCY …3'
3'… YCTAG▲R …5'
 >>>
Bsu I BciVI
5'… GTATCC(N)6▼ …3'
3'… CATAGG(N)5▲ …5'
 >>>
BsuR I HaeIII
5'… GG▼CC …3'
3'… CC▲GG …5'
 >>>
Btr I BtrI
5'… CAC▼GTC …3'
3'… GTG▲CAG …5'
 >>>
C back to alphabet
Cci I BspHI
5'… T▼CATGA …3'
3'… AGTAC▲T …5'
 >>>
CciN I NotI
5'… GC▼GGCCGC …3'
3'… CGCCGG▲CG …5'
 >>>
D back to alphabet
Dra I AhaIII
5'… TTT▼AAA …3'
3'… AAA▲TTT …5'
 >>>
Dra III DraIII
5'… CACNNN▼GTG …3'
3'… GTG▲NNNCAC …5'
 >>>
Dri I Eam1105I
5'… GACNNN▼NNGTC …3'
3'… CTGNN▲NNNCAG …5'
 >>>
DseD I DrdI
5'… GACNNNN▼NNGTC …3'
3'… CTGNN▲NNNNCAG …5'
 >>>
E back to alphabet
EcoICR I SacI
5'… GAG▼CTC …3'
3'… CTC▲GAG …5'
 >>>
EcoR I EcoRI
5'… G▼AATTC …3'
3'… CTTAA▲G …5'
 >>>
EcoR V EcoRV
5'… GAT▼ATC …3'
3'… CTA▲TAG …5'
 >>>
Ege I NarI
5'… GGC▼GCC …3'
3'… CCG▲CGG …5'
 >>>
EmiS6 I Ksp632I
5'… CTCTTC(N)1▼ …3'
3'… GAGAAG(N)4▲ …5'
 >>>
Erh I StyI
5'… C▼CWWGG …3'
3'… GGWWC▲C …5'
 >>>
F back to alphabet
Fae I NlaIII
5'… CATG▼ …3'
3'… ▲GTAC …5'
 >>>
Fai I FaiI
5'… YA▼TR …3'
3'… RT▲AY …5'
 >>>
Fal I FalI
5'… ▼(N)8AAGNNNNNCTT(N)13▼ …3'
3'… ▲(N)13TTCNNNNNGAA(N)8▲ …5'
 >>>
Fat I NlaIII
5'… ▼CATG …3'
3'… GTAC▲ …5'
 >>>
Fau I FauI
5'… CCCGC(N)4▼ …3'
3'… GGGCG(N)6▲ …5'
 >>>
FauND I NdeI
5'… CA▼TATG …3'
3'… GTAT▲AC …5'
 >>>
Fbl I AccI
5'… GT▼mKAC …3'
3'… CAKm▲TG …5'
 >>>
Fok I FokI
5'… GGATG(N)9▼ …3'
3'… CCTAC(N)13▲ …5'
 >>>
FriO I BanII
5'… GRGCY▼C …3'
3'… C▲YCGRG …5'
 >>>
Fsp4H I Fnu4HI
5'… GC▼NGC …3'
3'… CGN▲CG …5'
 >>>
G back to alphabet
Gla I GlaI
5'… R(5mC)▼GY …3'
3'… YG▲(5mC)R …5'
 >>>
Glu I GluI
5'… G(5mC)▼NG(5mC) …3'
3'… (5mC)GN▲(5mC)G …5'
 >>>
Gsa I BseYI
5'… CCCAG▼C …3'
3'… G▲GGTCG …5'
 >>>
H back to alphabet
Hae III HaeIII
5'… GG▼CC …3'
3'… CC▲GG …5'
 >>>
Hga I HgaI
5'… GACGC(N)5▼ …3'
3'… CTGCG(N)10▲ …5'
 >>>
Hind II HindII
5'… GTY▼RAC …3'
3'… CAR▲YTG …5'
 >>>
Hind III HindIII
5'… A▼AGCTT …3'
3'… TTCGA▲A …5'
 >>>
Hinf I HinfI
5'… G▼ANTC …3'
3'… CTNA▲G …5'
 >>>
Hpa I HpaI
5'… GTT▼AAC …3'
3'… CAA▲TTG …5'
 >>>
Hpa II HpaII
5'… C▼CGG …3'
3'… GGC▲C …5'
 >>>
HpySE526 I MaeII
5'… A▼CGT …3'
3'… TGC▲A …5'
 >>>
HspA I HhaI
5'… G▼CGC …3'
3'… CGC▲G …5'
 >>>
K back to alphabet
Kpn I KpnI
5'… GGTAC▼C …3'
3'… C▲CATGG …5'
 >>>
Kro I KroI
5'… G▼C(5mC)GGC …3'
3'… CGG(5mC)C▲G …5'
 >>>
KroN I NaeI
5'… GCC▼GGC …3'
3'… CGG▲CCG …5'
 >>>
Ksp22 I BclI
5'… T▼GATCA …3'
3'… ACTAG▲T …5'
 >>>
Kzo9 I MboI
5'… ▼GATC …3'
3'… CTAG▲ …5'
 >>>
L back to alphabet
Lmn I LmnI
5'… GCTCCN▼ …3'
3'… CGAG▲GN …5'
 >>>
M back to alphabet
Mab I SexAI
5'… A▼CCWGGT …3'
3'… TGGWCC▲A …5'
 >>>
Mal I DpnI
5'… G(mA)▼TC …3'
3'… CT▲(mA)G …5'
 >>>
Mbo II MboII
5'… GAAGA(N)8▼ …3'
3'… CTTCT(N)7▲ …5'
 >>>
Mfe I MfeI
5'… C▼AATTG …3'
3'… GTTAA▲C …5'
 >>>
Mhl I SduI
5'… GDGCH▼C …3'
3'… C▲HCGDG …5'
 >>>
Mlu I MluI
5'… A▼CGCGT …3'
3'… TGCGC▲A …5'
 >>>
Mly113 I NarI
5'… GG▼CGCC …3'
3'… CCGC▲GG …5'
 >>>
Mnl I MnlI
5'… CCTC(N)7▼ …3'
3'… GGAG(N)6▲ …5'
 >>>
Mox20 I BalI
5'… TGG▼CCA …3'
3'… ACC▲GGT …5'
 >>>
MroN I (NaeI)
5'… G▼CCGGC …3'
3'… CGGCC▲G …5'
 >>>
MroX I XmnI
5'… GAANN▼NNTTC …3'
3'… CTTNN▲NNAAG …5'
 >>>
Msp I HpaII
5'… C▼CGG …3'
3'… GGC▲C …5'
 >>>
MspA1 I NspBII
5'… CmG▼CKG …3'
3'… GKC▲GmC …5'
 >>>
MspR9 I ScrFI
5'… CC▼NGG …3'
3'… GGN▲CC …5'
 >>>
Mte I Mte
5'… G(5mC)G(5mC)▼NG(5mC)G(5mC) …3'
3'… (5mC)G(5mC)GN▲(5mC)G(5mC)G …5'
 >>>
N back to alphabet
Nru I NruI
5'… TCG▼CGA …3'
3'… AGC▲GCT …5'
 >>>
P back to alphabet
PalA I AscI
5'… GG▼CGCGCC …3'
3'… CCGCGC▲GG …5'
 >>>
Pce I StuI
5'… AGG▼CCT …3'
3'… TCC▲GGA …5'
 >>>
Pci I BspLU11I
5'… A▼CATGT …3'
3'… TGTAC▲A …5'
 >>>
PciS I SapI
5'… GCTCTTCN▼ …3'
3'… CGAGAAG(N)4▲ …5'
 >>>
Pcs I PcsI
5'… (5mC)GNNNNN▼NN(5mC)G …3'
3'… G(5mC)NN▲NNNNNG(5mC) …5'
 >>>
Pct I BsmI
5'… GAATGCN▼ …3'
3'… CTTAC▲GN …5'
 >>>
Pec I PsiI
5'… TTA▼TAA …3'
3'… AAT▲ATT …5'
 >>>
Pkr I PkrI
5'… G(5mC)N▼G(5mC) …3'
3'… (5mC)G▲N(5mC)G …5'
 >>>
Ple19 I PvuI
5'… CGAT▼CG …3'
3'… GC▲TAGC …5'
 >>>
Pps I PleI
5'… GAGTC(N)4▼ …3'
3'… CTCAG(N)5▲ …5'
 >>>
Pse31 I Eco31I
5'… GGTCTC(N)1▼ …3'
3'… CCAGAG(N)5▲ …5'
 >>>
Psi I PsiI
5'… TTA▼TAA …3'
3'… AAT▲ATT …5'
 >>>
Psp124B I SacI
5'… GAGCT▼C …3'
3'… C▲TCGAG …5'
 >>>
Psp6 I EcoRII
5'… ▼CCWGG …3'
3'… GGWCC▲ …5'
 >>>
PspC I PmaCI
5'… CAC▼GTG …3'
3'… GTG▲CAC …5'
 >>>
PspE I BstEII
5'… G▼GTNACC …3'
3'… CCANTG▲G …5'
 >>>
PspL I SplI
5'… C▼GTACG …3'
3'… GCATG▲C …5'
 >>>
PspN4 I NlaIV
5'… GGN▼NCC …3'
3'… CCN▲NGG …5'
 >>>
PspOM I (ApaI)
5'… G▼GGCCC …3'
3'… CCCGG▲G …5'
 >>>
PspPP I PpuMI
5'… RG▼GWCCY …3'
3'… YCCWG▲GR …5'
 >>>
PspX I PspXI
5'… VC▼TCGAGB …3'
3'… BGAGCT▲CV …5'
 >>>
Psr I PsrI
5'… ▼(N)7GAACNNNNNNTAC(N)12▼ …3'
3'… ▲(N)12CTTGNNNNNNATG(N)7▲ …5'
 >>>
Pst I PstI
5'… CTGCA▼G …3'
3'… G▲ACGTC …5'
 >>>
PstN I AlwNI
5'… CAGNNN▼CTG …3'
3'… GTC▲NNNGAC …5'
 >>>
Pvu II PvuII
5'… CAG▼CTG …3'
3'… GTC▲GAC …5'
 >>>
R back to alphabet
Rga I SgfI
5'… GCGAT▼CGC …3'
3'… CGC▲TAGCG …5'
 >>>
Rig I FseI
5'… GGCCGG▼CC …3'
3'… CC▲GGCCGG …5'
 >>>
Rsa I RsaI
5'… GT▼AC …3'
3'… CA▲TG …5'
 >>>
RsaN I RsaI
5'… G▼TAC …3'
3'… CAT▲G …5'
 >>>
Rsr2 I RsrII
5'… CG▼GWCCG …3'
3'… GCCWG▲GC …5'
 >>>
S back to alphabet
Sal I SalI
5'… G▼TCGAC …3'
3'… CAGCT▲G …5'
 >>>
Sbf I Sse8387I
5'… CCTGCA▼GG …3'
3'… GG▲ACGTCC …5'
 >>>
SegI FspAI
5'… RTGC▼GCAY …3'
3'… YACG▲CGTR …5'
 >>>
Set I SetI
5'… ASST▼ …3'
3'… ▲TSSA …5'
 >>>
SfaN I SfaNI
5'… GCATC(N)5▼ …3'
3'… CGTAG(N)9▲ …5'
 >>>
Sfi I SfiI
5'… GGCCNNNN▼NGGCC …3'
3'… CCGGN▲NNNNCCGG …5'
 >>>
Sfr274 I XhoI
5'… C▼TCGAG …3'
3'… GAGCT▲C …5'
 >>>
Sfr303 I SacII
5'… CCGC▼GG …3'
3'… GG▲CGCC …5'
 >>>
Sma I SmaI
5'… CCC▼GGG …3'
3'… GGG▲CCC …5'
 >>>
Smi I SwaI
5'… ATTT▼AAAT …3'
3'… TAAA▲TTTA …5'
 >>>
SmiM I MslI
5'… CAYNN▼NNRTG …3'
3'… GTRNN▲NNYAC …5'
 >>>
Sph I SphI
5'… GCATG▼C …3'
3'… C▲GTACG …5'
 >>>
Sse9 I Tsp509I
5'… ▼AATT …3'
3'… TTAA▲ …5'
 >>>
Ssp I SspI
5'… AAT▼ATT …3'
3'… TTA▲TAA …5'
 >>>
SspM I BfaI
5'… C▼TAG …3'
3'… GAT▲C …5'
 >>>
T back to alphabet
Taq I TaqI
5'… T▼CGA …3'
3'… AGC▲T …5'
 >>>
Tru9 I MseI
5'… T▼TAA …3'
3'… AAT▲T …5'
 >>>
TseF I Tsp45I
5'… ▼GTSAC …3'
3'… CASTG▲ …5'
 >>>
Tth111 I Tth111I
5'… GACN▼NNGTC …3'
3'… CTGNN▲NCAG …5'
 >>>
V back to alphabet
Vne I ApaLI
5'… G▼TGCAC …3'
3'… CACGT▲G …5'
 >>>
Vsp I VspI
5'… AT▼TAAT …3'
3'… TAAT▲TA …5'
 >>>
X back to alphabet
Xba I XbaI
5'… T▼CTAGA …3'
3'… AGATC▲T …5'
 >>>
Xma I XmaI
5'… C▼CCGGG …3'
3'… GGGCC▲C …5'
 >>>
Z back to alphabet
Zra I (AatII)
5'… GAC▼GTC …3'
3'… CTG▲CAG …5'
 >>>
Zrm I ScaI
5'… AGT▼ACT …3'
3'… TCA▲TGA …5'
 >>>
Zsp2 I NsiI
5'… ATGCA▼T …3'
3'… T▲ACGTA …5'
 >>>

Isoshizomers

Hpa II

Enzyme nameHpa II
PrototypeHpaII
Known analogsBsiSI, HapII, Msp I
SKUSE-E161
Turbo versionAvailable
High-concentration versionNot available
Restriction typeType IIEiType IIE enzymes interact with two recognition sites: one site is cleaved, while the second site acts as an allosteric effector site., Type IIPiType IIP enzymes are classical Type II restriction enzymes with palindromic recognition sequences and symmetric cleavage sites.
Recognition site
5'… C▼CGG …3'
3'… GGC▲C …5'
SourceAn E.coli strain, that carries the cloned gene Hpa II from Haemophilus parainfluenzae
Optimal bufferSE-buffer B (10 mM Tris-HCl (pH 7.6 at 25°C); 10 mM MgCl2; 1 mM DTT.)
Optimal temperature37 °C
Inactivation temperature80 °C
Buffer activity
BGOWYROSE
1005010255050
Unit definitionOne unit of the enzyme is the amount required to hydrolyze 1 μg of Lambda DNA in 1 hour at 37°C in a total reaction volume of 50 μl.
Assayed onLambda DNA
Storage conditions10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 50 mM NaCl; 0,1 mM EDTA; 1 mM DTT; 100 μg/ml BSA; 50% glycerol; Store at -20°C.
LigationAfter 10-fold overdigestion with enzyme more than 95% of the DNA fragments can be ligated and recut.
Nonspecific hydrolysisNo nonspecific activity was detected after incubation of 1 μg of Lambda DNA with 10 u.a. of enzyme for 16 hours at 37°C.
Methylation sensitivityBlocked by CG methylation.
Reagents supplied with enzyme10 X SE-buffer B
References
  3. External publication Sharp, P.A., Sugden, B., Sambrook, J. Biochemistry 12: 3055-3063 (1973).
// Код для некролога