SibEnzyme REBase

restriction enzymes database

Quick navigation
Enzyme Prototype Recognition site Supply options
A back to alphabet
Aat II AatII
5'… GACGTC …3'
3'… CTGCAG …5'
>>>
Abs I AbsI
5'… CCTCGAGG …3'
3'… GGAGCTCC …5'
>>>
Acc16 I MstI
5'… TGCGCA …3'
3'… ACGCGT …5'
>>>
Acc36 I BspMI
5'… ACCTGC(N)4 …3'
3'… TGGACG(N)8 …5'
>>>
Acc65 I KpnI
5'… GGTACC …3'
3'… CCATGG …5'
>>>
AccB1 I HgiCI
5'… GGYRCC …3'
3'… CCRYGG …5'
>>>
AccB7 I PflMI
5'… CCANNNNNTGG …3'
3'… GGTNNNNNACC …5'
>>>
AccBS I BsrBI
5'… GAGCGG …3'
3'… CTCGCC …5'
>>>
Acl I AclI
5'… AACGTT …3'
3'… TTGCAA …5'
>>>
AclW I BinI
5'… GGATC(N)4 …3'
3'… CCTAG(N)5 …5'
>>>
Aco I CfrI
5'… YGGCCR …3'
3'… RCCGGY …5'
>>>
Acs I ApoI
5'… RAATTY …3'
3'… YTTAAR …5'
>>>
Acu I Eco57I
5'… CTGAAG(N)16 …3'
3'… GACTTC(N)14 …5'
>>>
Afe I Eco47III
5'… AGCGCT …3'
3'… TCGCGA …5'
>>>
Ags I AgsI
5'… TTSAA …3'
3'… AASTT …5'
>>>
Ahl I SpeI
5'… ACTAGT …3'
3'… TGATCA …5'
>>>
Ajn I EcoRII
5'… CCWGG …3'
3'… GGWCC …5'
>>>
Ale I OliI
5'… CACNNNNGTG …3'
3'… GTGNNNNCAC …5'
>>>
Alu I AluI
5'… AGCT …3'
3'… TCGA …5'
>>>
AluB I AluI
5'… AGCT …3'
3'… TCGA …5'
>>>
Ama87 I AvaI
5'… CYCGRG …3'
3'… GRGCYC …5'
>>>
Aox I AoxI
5'… RG(5mC)Y …3'
3'… Y(5mC)GR …5'
>>>
Apa I ApaI
5'… GGGCCC …3'
3'… CCCGGG …5'
>>>
Ars I ArsI
5'… (N)8GACNNNNNNTTYG(N)11 …3'
3'… (N)13CTGNNNNNNAARC(N)6 …5'
>>>
AsiG I AgeI
5'… ACCGGT …3'
3'… TGGCCA …5'
>>>
AsiS I #Н/Д
5'… GCGATCGC …3'
3'… CGCTAGCG …5'
>>>
AspA2 I AvrII
5'… CCTAGG …3'
3'… GGATCC …5'
>>>
AspLE I HhaI
5'… GCGC …3'
3'… CGCG …5'
>>>
AspS9 I Sau96I
5'… GGNCC …3'
3'… CCNGG …5'
>>>
AsuC2 I CauII
5'… CCSGG …3'
3'… GGSCC …5'
>>>
AsuHP I HphI
5'… GGTGA(N)8 …3'
3'… CCACT(N)7 …5'
>>>
AsuNH I NheI
5'… GCTAGC …3'
3'… CGATCG …5'
>>>
B back to alphabet
BamH I BamHI
5'… GGATCC …3'
3'… CCTAGG …5'
>>>
Bar I BarI
5'… (N)7GAAGNNNNNNTAC(N)12 …3'
3'… (N)12CTTCNNNNNNATG(N)7 …5'
>>>
Bbv12 I HgiAI
5'… GWGCWC …3'
3'… CWCGWG …5'
>>>
Bgl I BglI
5'… GCCNNNNNGGC …3'
3'… CGGNNNNNCCG …5'
>>>
Bgl II BglII
5'… AGATCT …3'
3'… TCTAGA …5'
>>>
Bls I BlsI Неверный формат сайта узнавания >>>
Bme18 I AvaII
5'… GGWCC …3'
3'… CCWGG …5'
>>>
Bmo I SanDI
5'… GGGWCCC …3'
3'… CCCWGGG …5'
>>>
Bmt I NheI
5'… GCTAGC …3'
3'… CGATCG …5'
>>>
Bmu I BfiI
5'… ACTGGG(N)5 …3'
3'… TGACCC(N)4 …5'
>>>
Bpm I GsuI
5'… CTGGAG(N)16 …3'
3'… GACCTC(N)14 …5'
>>>
Bpu10 I Bpu10I
5'… CCTNAGC …3'
3'… GGANTCG …5'
>>>
Bpu14 I AsuII
5'… TTCGAA …3'
3'… AAGCTT …5'
>>>
Bsa29 I ClaI
5'… ATCGAT …3'
3'… TAGCTA …5'
>>>
Bsc4 I BsiYI
5'… CCNNNNNNNGG …3'
3'… GGNNNNNNNCC …5'
>>>
Bse1 I BsrI
5'… ACTGGN …3'
3'… TGACCN …5'
>>>
Bse118 I Cfr10I
5'… RCCGGY …3'
3'… YGGCCR …5'
>>>
Bse21 I SauI
5'… CCTNAGG …3'
3'… GGANTCC …5'
>>>
Bse3D I BsrDI
5'… GCAATGNN …3'
3'… CGTTACNN …5'
>>>
Bse8 I BsaBI
5'… GATNNNNATC …3'
3'… CTANNNNTAG …5'
>>>
BseP I BsePI
5'… GCGCGC …3'
3'… CGCGCG …5'
>>>
BseX3 I XmaIII
5'… CGGCCG …3'
3'… GCCGGC …5'
>>>
BslF I FinI
5'… GGGAC(N)10 …3'
3'… CCCTG(N)14 …5'
>>>
Bso31 I Eco31I
5'… GGTCTCN …3'
3'… CCAGAG(N)5 …5'
>>>
Bsp13 I BspMII
5'… TCCGGA …3'
3'… AGGCCT …5'
>>>
Bsp1720 I EspI
5'… GCTNAGC …3'
3'… CGANTCG …5'
>>>
Bsp19 I NcoI
5'… CCATGG …3'
3'… GGTACC …5'
>>>
BspAC I AciI
5'… CCGC …3'
3'… GGCG …5'
>>>
BspFN I FnuDII
5'… CGCG …3'
3'… GCGC …5'
>>>
BssEC I SecI
5'… CCNNGG …3'
3'… GGNNCC …5'
>>>
BssNA I SnaI
5'… GTATAC …3'
3'… CATATG …5'
>>>
BssT1 I StyI
5'… CCWWGG …3'
3'… GGWWCC …5'
>>>
Bst2B I BsiI
5'… CTCGTG …3'
3'… GAGCAC …5'
>>>
Bst2U I BstNI
5'… CCWGG …3'
3'… GGWCC …5'
>>>
Bst4C I Tsp4CI
5'… ACNGT …3'
3'… TGNCA …5'
>>>
Bst6 I Ksp632I
5'… CTCTTCN …3'
3'… GAGAAG(N)4 …5'
>>>
BstAC I AcyI
5'… GRCGYC …3'
3'… CYGCRG …5'
>>>
BstAF I AflII
5'… CTTAAG …3'
3'… GAATTC …5'
>>>
BstAP I (ApaBI)
5'… GCANNNNNTGC …3'
3'… CGTNNNNNACG …5'
>>>
BstAU I Bsp1407I
5'… TGTACA …3'
3'… ACATGT …5'
>>>
BstBA I BsaAI
5'… YACGTR …3'
3'… RTGCAY …5'
>>>
BstC8 I Cac8I
5'… GCNNGC …3'
3'… CGNNCG …5'
>>>
BstDE I DdeI
5'… CTNAG …3'
3'… GANTC …5'
>>>
BstDS I DsaI
5'… CCRYGG …3'
3'… GGYRCC …5'
>>>
BstEN I EcoNI
5'… CCTNNNNNAGG …3'
3'… GGANNNNNTCC …5'
>>>
BstF5 I (FokI)
5'… GGATGNN …3'
3'… CCTACNN …5'
>>>
BstFN I FnuDII
5'… CGCG …3'
3'… GCGC …5'
>>>
BstH2 I HaeII
5'… RGCGCY …3'
3'… YCGCGR …5'
>>>
BstHH I HhaI
5'… GCGC …3'
3'… CGCG …5'
>>>
BstKT I MboI
5'… GATC …3'
3'… CTAG …5'
>>>
BstMA I BsmAI
5'… GTCTCN …3'
3'… CAGAG(N)5 …5'
>>>
BstMB I MboI
5'… GATC …3'
3'… CTAG …5'
>>>
BstMC I McrI
5'… CGRYCG …3'
3'… GCYRGC …5'
>>>
BstMW I MwoI
5'… GCNNNNNNNGC …3'
3'… CGNNNNNNNCG …5'
>>>
BstNS I NspI
5'… RCATGY …3'
3'… YGTACR …5'
>>>
BstPA I PshAI
5'… GACNNNNGTC …3'
3'… CTGNNNNCAG …5'
>>>
BstSC I ScrFI
5'… CCNGG …3'
3'… GGNCC …5'
>>>
BstSF I SfeI
5'… CTRYAG …3'
3'… GAYRTC …5'
>>>
BstSL I BseSI
5'… GKGCmC …3'
3'… CmCGKG …5'
>>>
BstSN I SnaBI
5'… TACGTA …3'
3'… ATGCAT …5'
>>>
BstV1 I BbvI
5'… GCAGC(N)8 …3'
3'… CGTCG(N)12 …5'
>>>
BstV2 I BbvII
5'… GAAGAC(N)2 …3'
3'… CTTCTG(N)6 …5'
>>>
BstX I BstXI
5'… CCANNNNNNTGG …3'
3'… GGTNNNNNNACC …5'
>>>
BstX2 I XhoII
5'… RGATCY …3'
3'… YCTAGR …5'
>>>
Bsu I BciVI
5'… GTATCC(N)6 …3'
3'… CATAGG(N)5 …5'
>>>
BsuR I HaeIII
5'… GGCC …3'
3'… CCGG …5'
>>>
Btr I BtrI
5'… CACGTC …3'
3'… GTGCAG …5'
>>>
C back to alphabet
Cci I BspHI
5'… TCATGA …3'
3'… AGTACT …5'
>>>
CciN I NotI
5'… GCGGCCGC …3'
3'… CGCCGGCG …5'
>>>
D back to alphabet
Dra I AhaIII
5'… TTTAAA …3'
3'… AAATTT …5'
>>>
Dra III DraIII
5'… CACNNNGTG …3'
3'… GTGNNNCAC …5'
>>>
Dri I Eam1105I
5'… GACNNNNNGTC …3'
3'… CTGNNNNNCAG …5'
>>>
DseD I DrdI
5'… GACNNNNNNGTC …3'
3'… CTGNNNNNNCAG …5'
>>>
E back to alphabet
EcoICR I SacI
5'… GAGCTC …3'
3'… CTCGAG …5'
>>>
EcoR I EcoRI
5'… GAATTC …3'
3'… CTTAAG …5'
>>>
EcoR V EcoRV
5'… GATATC …3'
3'… CTATAG …5'
>>>
Ege I NarI
5'… GGCGCC …3'
3'… CCGCGG …5'
>>>
Emi I Ksp632I
5'… CTCTTC(N)1 …3'
3'… GAGAAG(N)4 …5'
>>>
Erh I StyI
5'… CCWWGG …3'
3'… GGWWCC …5'
>>>
F back to alphabet
Fae I NlaIII
5'… CATG …3'
3'… GTAC …5'
>>>
Fai I FaiI
5'… YATR …3'
3'… RTAY …5'
>>>
Fal I FalI
5'… (N)8AAGNNNNNCTT(N)13 …3'
3'… (N)13TTCNNNNNGAA(N)8 …5'
>>>
Fat I NlaIII
5'… CATG …3'
3'… GTAC …5'
>>>
Fau I FauI
5'… CCCGC(N)4 …3'
3'… GGGCG(N)6 …5'
>>>
FauND I NdeI
5'… CATATG …3'
3'… GTATAC …5'
>>>
Fbl I AccI
5'… GTmKAC …3'
3'… CAKmTG …5'
>>>
Fok I FokI
5'… GGATG(N)9 …3'
3'… CCTAC(N)13 …5'
>>>
FriO I BanII
5'… GRGCYC …3'
3'… CYCGRG …5'
>>>
Fsp4H I Fnu4HI
5'… GCNGC …3'
3'… CGNCG …5'
>>>
G back to alphabet
Gla I GlaI
5'… R(5mC)GY …3'
3'… YG(5mC)R …5'
>>>
Glu I GluI
5'… G(5mC)NG(5mC) …3'
3'… (5mC)GN(5mC)G …5'
>>>
Gsa I BseYI
5'… CCCAGC …3'
3'… GGGTCG …5'
>>>
H back to alphabet
Hae III HaeIII
5'… GGCC …3'
3'… CCGG …5'
>>>
Hga I HgaI
5'… GACGC(N)5 …3'
3'… CTGCG(N)10 …5'
>>>
Hind II HindII
5'… GTYRAC …3'
3'… CARYTG …5'
>>>
Hind III HindIII
5'… AAGCTT …3'
3'… TTCGAA …5'
>>>
Hinf I HinfI
5'… GANTC …3'
3'… CTNAG …5'
>>>
Hpa I HpaI
5'… GTTAAC …3'
3'… CAATTG …5'
>>>
Hpa II HpaII
5'… CCGG …3'
3'… GGCC …5'
>>>
HpySE526 I MaeII
5'… ACGT …3'
3'… TGCA …5'
>>>
HspA I HhaI
5'… GCGC …3'
3'… CGCG …5'
>>>
K back to alphabet
Kpn I KpnI
5'… GGTACC …3'
3'… CCATGG …5'
>>>
Kro I KroI
5'… GC(5mC)GGC …3'
3'… CGG(5mC)CG …5'
>>>
KroN I NaeI
5'… GCCGGC …3'
3'… CGGCCG …5'
>>>
Ksp22 I BclI
5'… TGATCA …3'
3'… ACTAGT …5'
>>>
Kzo9 I MboI
5'… GATC …3'
3'… CTAG …5'
>>>
L back to alphabet
Lmn I LmnI
5'… GCTCCN …3'
3'… CGAGGN …5'
>>>
M back to alphabet
Mab I SexAI
5'… ACCWGGT …3'
3'… TGGWCCA …5'
>>>
Mal I DpnI
5'… G(mA)TC …3'
3'… CT(mA)G …5'
>>>
Mbo II MboII
5'… GAAGA(N)8 …3'
3'… CTTCT(N)7 …5'
>>>
Mfe I MfeI
5'… CAATTG …3'
3'… GTTAAC …5'
>>>
Mhl I SduI
5'… GDGCHC …3'
3'… CHCGDG …5'
>>>
Mlu I MluI
5'… ACGCGT …3'
3'… TGCGCA …5'
>>>
Mly113 I NarI
5'… GGCGCC …3'
3'… CCGCGG …5'
>>>
Mnl I MnlI
5'… CCTC(N)7 …3'
3'… GGAG(N)6 …5'
>>>
Mox20 I BalI
5'… TGGCCA …3'
3'… ACCGGT …5'
>>>
MroN I (NaeI)
5'… GCCGGC …3'
3'… CGGCCG …5'
>>>
MroX I XmnI
5'… GAANNNNTTC …3'
3'… CTTNNNNAAG …5'
>>>
Msp I HpaII
5'… CCGG …3'
3'… GGCC …5'
>>>
MspA1 I NspBII
5'… CmGCKG …3'
3'… GKCGmC …5'
>>>
MspR9 I ScrFI
5'… CCNGG …3'
3'… GGNCC …5'
>>>
Mte I Mte
5'… G(5mC)G(5mC)NG(5mC)G(5mC) …3'
3'… (5mC)G(5mC)GN(5mC)G(5mC)G …5'
>>>
N back to alphabet
Nru I NruI
5'… TCGCGA …3'
3'… AGCGCT …5'
>>>
P back to alphabet
PalA I AscI
5'… GGCGCGCC …3'
3'… CCGCGCGG …5'
>>>
Pce I StuI
5'… AGGCCT …3'
3'… TCCGGA …5'
>>>
Pci I BspLU11I
5'… ACATGT …3'
3'… TGTACA …5'
>>>
PciS I SapI
5'… GCTCTTCN …3'
3'… CGAGAAG(N)4 …5'
>>>
Pcs I PcsI
5'… (5mC)GNNNNNNN(5mC)G …3'
3'… G(5mC)NNNNNNNG(5mC) …5'
>>>
Pct I BsmI
5'… GAATGCN …3'
3'… CTTACGN …5'
>>>
Pec I PsiI
5'… TTATAA …3'
3'… AATATT …5'
>>>
Pkr I PkrI
5'… G(5mC)NG(5mC) …3'
3'… (5mC)GN(5mC)G …5'
>>>
Ple19 I PvuI
5'… CGATCG …3'
3'… GCTAGC …5'
>>>
Pps I PleI
5'… GAGTC(N)4 …3'
3'… CTCAG(N)5 …5'
>>>
Pse31 I Eco31I
5'… GGTCTC(N)1 …3'
3'… CCAGAG(N)5 …5'
>>>
Psi I PsiI
5'… TTATAA …3'
3'… AATATT …5'
>>>
Psp124B I SacI
5'… GAGCTC …3'
3'… CTCGAG …5'
>>>
Psp6 I EcoRII
5'… CCWGG …3'
3'… GGWCC …5'
>>>
PspC I PmaCI
5'… CACGTG …3'
3'… GTGCAC …5'
>>>
PspE I BstEII
5'… GGTNACC …3'
3'… CCANTGG …5'
>>>
PspL I SplI
5'… CGTACG …3'
3'… GCATGC …5'
>>>
PspN4 I NlaIV
5'… GGNNCC …3'
3'… CCNNGG …5'
>>>
PspOM I (ApaI)
5'… GGGCCC …3'
3'… CCCGGG …5'
>>>
PspPP I PpuMI
5'… RGGWCCY …3'
3'… YCCWGGR …5'
>>>
PspX I PspXI
5'… VCTCGAGB …3'
3'… BGAGCTCV …5'
>>>
Psr I PsrI
5'… (N)7GAACNNNNNNTAC(N)12 …3'
3'… (N)12CTTGNNNNNNATG(N)7 …5'
>>>
Pst I PstI
5'… CTGCAG …3'
3'… GACGTC …5'
>>>
PstN I AlwNI
5'… CAGNNNCTG …3'
3'… GTCNNNGAC …5'
>>>
Pvu II PvuII
5'… CAGCTG …3'
3'… GTCGAC …5'
>>>
R back to alphabet
Rga I SgfI
5'… GCGATCGC …3'
3'… CGCTAGCG …5'
>>>
Rig I FseI
5'… GGCCGGCC …3'
3'… CCGGCCGG …5'
>>>
Rsa I RsaI
5'… GTAC …3'
3'… CATG …5'
>>>
RsaN I RsaI
5'… GTAC …3'
3'… CATG …5'
>>>
Rsr2 I RsrII
5'… CGGWCCG …3'
3'… GCCWGGC …5'
>>>
S back to alphabet
Sal I SalI
5'… GTCGAC …3'
3'… CAGCTG …5'
>>>
Sbf I Sse8387I
5'… CCTGCAGG …3'
3'… GGACGTCC …5'
>>>
Set I SetI
5'… ASST …3'
3'… TSSA …5'
>>>
SfaN I SfaNI
5'… GCATC(N)5 …3'
3'… CGTAG(N)9 …5'
>>>
Sfi I SfiI
5'… GGCCNNNNNGGCC …3'
3'… CCGGNNNNNCCGG …5'
>>>
Sfr274 I XhoI
5'… CTCGAG …3'
3'… GAGCTC …5'
>>>
Sfr303 I SacII
5'… CCGCGG …3'
3'… GGCGCC …5'
>>>
Sma I SmaI
5'… CCCGGG …3'
3'… GGGCCC …5'
>>>
Smi I SwaI
5'… ATTTAAAT …3'
3'… TAAATTTA …5'
>>>
SmiM I MslI
5'… CAYNNNNRTG …3'
3'… GTRNNNNYAC …5'
>>>
Sph I SphI
5'… GCATGC …3'
3'… CGTACG …5'
>>>
Sse9 I Tsp509I
5'… AATT …3'
3'… TTAA …5'
>>>
Ssp I SspI
5'… AATATT …3'
3'… TTATAA …5'
>>>
SspM I BfaI
5'… CTAG …3'
3'… GATC …5'
>>>
T back to alphabet
Taq I TaqI
5'… TCGA …3'
3'… AGCT …5'
>>>
Tru9 I MseI
5'… TTAA …3'
3'… AATT …5'
>>>
TseF I Tsp45I
5'… GTSAC …3'
3'… CASTG …5'
>>>
Tth111 I Tth111I
5'… GACNNNGTC …3'
3'… CTGNNNCAG …5'
>>>
V back to alphabet
Vne I ApaLI
5'… GTGCAC …3'
3'… CACGTG …5'
>>>
Vsp I VspI
5'… ATTAAT …3'
3'… TAATTA …5'
>>>
X back to alphabet
Xba I XbaI
5'… TCTAGA …3'
3'… AGATCT …5'
>>>
Xma I XmaI
5'… CCCGGG …3'
3'… GGGCCC …5'
>>>
Z back to alphabet
Zra I (AatII)
5'… GACGTC …3'
3'… CTGCAG …5'
>>>
Zrm I ScaI
5'… AGTACT …3'
3'… TCATGA …5'
>>>
Zsp2 I NsiI
5'… ATGCAT …3'
3'… TACGTA …5'
>>>

PalA I

Enzyme name PalA I
Prototype AscI
Known analogs AscI, AsoI, SgsI
SKU SE-E483
Turbo version Not available
High-concentration version Not available
Restriction type Type IIPiType IIP enzymes are classical Type II restriction enzymes with palindromic recognition sequences and symmetric cleavage sites.
Recognition site
5'… GGCGCGCC …3'
3'… CCGCGCGG …5'
Source An E. coli strain, that carries the cloned gene from Pseudomanas alcaligenes BS17
Optimal buffer SE-buffer Y (33 mM Tris-acetate (pH 7.9 at 25°C); 10 mM magnesium acetate; 66 mM potassium acetate; 1 mM DTT.)
Optimal temperature 37 °C
Inactivation temperature 65 °C
Buffer activity
BGOWYROSE
2510101010040
Unit definition One unit of the enzyme is the amount required to hydrolyze 1 μg of Lambda DNA in 1 hour at 37°C in a total reaction volume of 50 μl.
Assayed on Lambda DNA
Storage conditions 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 100 mM KCl; 0.1 mM EDTA; 7 mM 2-mercaptoethanol; 200 μg/ml BSA; 50% glycerol; Store at -20°C.
Ligation After 5-fold overdigestion with enzyme more than 90% of the DNA fragments can be ligated and 95% of these can be recut.
Nonspecific hydrolysis No nonspecific activity was detected after incubation of 1 μg of Lambda DNA with 5 u.a. of enzyme for 16 hours at 37°C.
Methylation sensitivity Blocked by CG methylation.
Reagents supplied with enzyme 10 X SE-buffer Y
Notes
References
  1. Unpublished data Dedkov, V.S., Belichenko, O.A., Gonchar, D.A., Akishev, A.G., Yamkovaya, T.V., Mezentseva, N.V., Tomilova, J.E., Abdurashitov, M.A., Degtyarev, S.K Unpublished observations(2005)
// Код для некролога