SibEnzyme REBase

restriction enzymes database

Quick navigation
Enzyme Prototype Recognition site Supply options
A back to alphabet
Aat II AatII
5'… GACGTC …3'
3'… CTGCAG …5'
>>>
Abs I AbsI
5'… CCTCGAGG …3'
3'… GGAGCTCC …5'
>>>
Acc16 I MstI
5'… TGCGCA …3'
3'… ACGCGT …5'
>>>
Acc36 I BspMI
5'… ACCTGC(N)4 …3'
3'… TGGACG(N)8 …5'
>>>
Acc65 I KpnI
5'… GGTACC …3'
3'… CCATGG …5'
>>>
AccB1 I HgiCI
5'… GGYRCC …3'
3'… CCRYGG …5'
>>>
AccB7 I PflMI
5'… CCANNNNNTGG …3'
3'… GGTNNNNNACC …5'
>>>
AccBS I BsrBI
5'… GAGCGG …3'
3'… CTCGCC …5'
>>>
Acl I AclI
5'… AACGTT …3'
3'… TTGCAA …5'
>>>
AclW I BinI
5'… GGATC(N)4 …3'
3'… CCTAG(N)5 …5'
>>>
Aco I CfrI
5'… YGGCCR …3'
3'… RCCGGY …5'
>>>
Acs I ApoI
5'… RAATTY …3'
3'… YTTAAR …5'
>>>
Acu I Eco57I
5'… CTGAAG(N)16 …3'
3'… GACTTC(N)14 …5'
>>>
Afe I Eco47III
5'… AGCGCT …3'
3'… TCGCGA …5'
>>>
Ags I AgsI
5'… TTSAA …3'
3'… AASTT …5'
>>>
Ahl I SpeI
5'… ACTAGT …3'
3'… TGATCA …5'
>>>
Ajn I EcoRII
5'… CCWGG …3'
3'… GGWCC …5'
>>>
Ale I OliI
5'… CACNNNNGTG …3'
3'… GTGNNNNCAC …5'
>>>
Alu I AluI
5'… AGCT …3'
3'… TCGA …5'
>>>
AluB I AluI
5'… AGCT …3'
3'… TCGA …5'
>>>
Ama87 I AvaI
5'… CYCGRG …3'
3'… GRGCYC …5'
>>>
Aox I AoxI
5'… RG(5mC)Y …3'
3'… Y(5mC)GR …5'
>>>
Apa I ApaI
5'… GGGCCC …3'
3'… CCCGGG …5'
>>>
Ars I ArsI
5'… (N)8GACNNNNNNTTYG(N)11 …3'
3'… (N)13CTGNNNNNNAARC(N)6 …5'
>>>
AsiG I AgeI
5'… ACCGGT …3'
3'… TGGCCA …5'
>>>
AsiS I #Н/Д
5'… GCGATCGC …3'
3'… CGCTAGCG …5'
>>>
AspA2 I AvrII
5'… CCTAGG …3'
3'… GGATCC …5'
>>>
AspLE I HhaI
5'… GCGC …3'
3'… CGCG …5'
>>>
AspS9 I Sau96I
5'… GGNCC …3'
3'… CCNGG …5'
>>>
AsuC2 I CauII
5'… CCSGG …3'
3'… GGSCC …5'
>>>
AsuHP I HphI
5'… GGTGA(N)8 …3'
3'… CCACT(N)7 …5'
>>>
AsuNH I NheI
5'… GCTAGC …3'
3'… CGATCG …5'
>>>
B back to alphabet
BamH I BamHI
5'… GGATCC …3'
3'… CCTAGG …5'
>>>
Bar I BarI
5'… (N)7GAAGNNNNNNTAC(N)12 …3'
3'… (N)12CTTCNNNNNNATG(N)7 …5'
>>>
Bbv12 I HgiAI
5'… GWGCWC …3'
3'… CWCGWG …5'
>>>
Bgl I BglI
5'… GCCNNNNNGGC …3'
3'… CGGNNNNNCCG …5'
>>>
Bgl II BglII
5'… AGATCT …3'
3'… TCTAGA …5'
>>>
Bls I BlsI Неверный формат сайта узнавания >>>
Bme18 I AvaII
5'… GGWCC …3'
3'… CCWGG …5'
>>>
Bmo I SanDI
5'… GGGWCCC …3'
3'… CCCWGGG …5'
>>>
Bmt I NheI
5'… GCTAGC …3'
3'… CGATCG …5'
>>>
Bmu I BfiI
5'… ACTGGG(N)5 …3'
3'… TGACCC(N)4 …5'
>>>
Bpm I GsuI
5'… CTGGAG(N)16 …3'
3'… GACCTC(N)14 …5'
>>>
Bpu10 I Bpu10I
5'… CCTNAGC …3'
3'… GGANTCG …5'
>>>
Bpu14 I AsuII
5'… TTCGAA …3'
3'… AAGCTT …5'
>>>
Bsa29 I ClaI
5'… ATCGAT …3'
3'… TAGCTA …5'
>>>
Bsc4 I BsiYI
5'… CCNNNNNNNGG …3'
3'… GGNNNNNNNCC …5'
>>>
Bse1 I BsrI
5'… ACTGGN …3'
3'… TGACCN …5'
>>>
Bse118 I Cfr10I
5'… RCCGGY …3'
3'… YGGCCR …5'
>>>
Bse21 I SauI
5'… CCTNAGG …3'
3'… GGANTCC …5'
>>>
Bse3D I BsrDI
5'… GCAATGNN …3'
3'… CGTTACNN …5'
>>>
Bse8 I BsaBI
5'… GATNNNNATC …3'
3'… CTANNNNTAG …5'
>>>
BseP I BsePI
5'… GCGCGC …3'
3'… CGCGCG …5'
>>>
BseX3 I XmaIII
5'… CGGCCG …3'
3'… GCCGGC …5'
>>>
BslF I FinI
5'… GGGAC(N)10 …3'
3'… CCCTG(N)14 …5'
>>>
Bso31 I Eco31I
5'… GGTCTCN …3'
3'… CCAGAG(N)5 …5'
>>>
Bsp13 I BspMII
5'… TCCGGA …3'
3'… AGGCCT …5'
>>>
Bsp1720 I EspI
5'… GCTNAGC …3'
3'… CGANTCG …5'
>>>
Bsp19 I NcoI
5'… CCATGG …3'
3'… GGTACC …5'
>>>
BspAC I AciI
5'… CCGC …3'
3'… GGCG …5'
>>>
BspFN I FnuDII
5'… CGCG …3'
3'… GCGC …5'
>>>
BssEC I SecI
5'… CCNNGG …3'
3'… GGNNCC …5'
>>>
BssNA I SnaI
5'… GTATAC …3'
3'… CATATG …5'
>>>
BssT1 I StyI
5'… CCWWGG …3'
3'… GGWWCC …5'
>>>
Bst2B I BsiI
5'… CTCGTG …3'
3'… GAGCAC …5'
>>>
Bst2U I BstNI
5'… CCWGG …3'
3'… GGWCC …5'
>>>
Bst4C I Tsp4CI
5'… ACNGT …3'
3'… TGNCA …5'
>>>
Bst6 I Ksp632I
5'… CTCTTCN …3'
3'… GAGAAG(N)4 …5'
>>>
BstAC I AcyI
5'… GRCGYC …3'
3'… CYGCRG …5'
>>>
BstAF I AflII
5'… CTTAAG …3'
3'… GAATTC …5'
>>>
BstAP I (ApaBI)
5'… GCANNNNNTGC …3'
3'… CGTNNNNNACG …5'
>>>
BstAU I Bsp1407I
5'… TGTACA …3'
3'… ACATGT …5'
>>>
BstBA I BsaAI
5'… YACGTR …3'
3'… RTGCAY …5'
>>>
BstC8 I Cac8I
5'… GCNNGC …3'
3'… CGNNCG …5'
>>>
BstDE I DdeI
5'… CTNAG …3'
3'… GANTC …5'
>>>
BstDS I DsaI
5'… CCRYGG …3'
3'… GGYRCC …5'
>>>
BstEN I EcoNI
5'… CCTNNNNNAGG …3'
3'… GGANNNNNTCC …5'
>>>
BstF5 I (FokI)
5'… GGATGNN …3'
3'… CCTACNN …5'
>>>
BstFN I FnuDII
5'… CGCG …3'
3'… GCGC …5'
>>>
BstH2 I HaeII
5'… RGCGCY …3'
3'… YCGCGR …5'
>>>
BstHH I HhaI
5'… GCGC …3'
3'… CGCG …5'
>>>
BstKT I MboI
5'… GATC …3'
3'… CTAG …5'
>>>
BstMA I BsmAI
5'… GTCTCN …3'
3'… CAGAG(N)5 …5'
>>>
BstMB I MboI
5'… GATC …3'
3'… CTAG …5'
>>>
BstMC I McrI
5'… CGRYCG …3'
3'… GCYRGC …5'
>>>
BstMW I MwoI
5'… GCNNNNNNNGC …3'
3'… CGNNNNNNNCG …5'
>>>
BstNS I NspI
5'… RCATGY …3'
3'… YGTACR …5'
>>>
BstPA I PshAI
5'… GACNNNNGTC …3'
3'… CTGNNNNCAG …5'
>>>
BstSC I ScrFI
5'… CCNGG …3'
3'… GGNCC …5'
>>>
BstSF I SfeI
5'… CTRYAG …3'
3'… GAYRTC …5'
>>>
BstSL I BseSI
5'… GKGCmC …3'
3'… CmCGKG …5'
>>>
BstSN I SnaBI
5'… TACGTA …3'
3'… ATGCAT …5'
>>>
BstV1 I BbvI
5'… GCAGC(N)8 …3'
3'… CGTCG(N)12 …5'
>>>
BstV2 I BbvII
5'… GAAGAC(N)2 …3'
3'… CTTCTG(N)6 …5'
>>>
BstX I BstXI
5'… CCANNNNNNTGG …3'
3'… GGTNNNNNNACC …5'
>>>
BstX2 I XhoII
5'… RGATCY …3'
3'… YCTAGR …5'
>>>
Bsu I BciVI
5'… GTATCC(N)6 …3'
3'… CATAGG(N)5 …5'
>>>
BsuR I HaeIII
5'… GGCC …3'
3'… CCGG …5'
>>>
Btr I BtrI
5'… CACGTC …3'
3'… GTGCAG …5'
>>>
C back to alphabet
Cci I BspHI
5'… TCATGA …3'
3'… AGTACT …5'
>>>
CciN I NotI
5'… GCGGCCGC …3'
3'… CGCCGGCG …5'
>>>
D back to alphabet
Dra I AhaIII
5'… TTTAAA …3'
3'… AAATTT …5'
>>>
Dra III DraIII
5'… CACNNNGTG …3'
3'… GTGNNNCAC …5'
>>>
Dri I Eam1105I
5'… GACNNNNNGTC …3'
3'… CTGNNNNNCAG …5'
>>>
DseD I DrdI
5'… GACNNNNNNGTC …3'
3'… CTGNNNNNNCAG …5'
>>>
E back to alphabet
EcoICR I SacI
5'… GAGCTC …3'
3'… CTCGAG …5'
>>>
EcoR I EcoRI
5'… GAATTC …3'
3'… CTTAAG …5'
>>>
EcoR V EcoRV
5'… GATATC …3'
3'… CTATAG …5'
>>>
Ege I NarI
5'… GGCGCC …3'
3'… CCGCGG …5'
>>>
Emi I Ksp632I
5'… CTCTTC(N)1 …3'
3'… GAGAAG(N)4 …5'
>>>
Erh I StyI
5'… CCWWGG …3'
3'… GGWWCC …5'
>>>
F back to alphabet
Fae I NlaIII
5'… CATG …3'
3'… GTAC …5'
>>>
Fai I FaiI
5'… YATR …3'
3'… RTAY …5'
>>>
Fal I FalI
5'… (N)8AAGNNNNNCTT(N)13 …3'
3'… (N)13TTCNNNNNGAA(N)8 …5'
>>>
Fat I NlaIII
5'… CATG …3'
3'… GTAC …5'
>>>
Fau I FauI
5'… CCCGC(N)4 …3'
3'… GGGCG(N)6 …5'
>>>
FauND I NdeI
5'… CATATG …3'
3'… GTATAC …5'
>>>
Fbl I AccI
5'… GTmKAC …3'
3'… CAKmTG …5'
>>>
Fok I FokI
5'… GGATG(N)9 …3'
3'… CCTAC(N)13 …5'
>>>
FriO I BanII
5'… GRGCYC …3'
3'… CYCGRG …5'
>>>
Fsp4H I Fnu4HI
5'… GCNGC …3'
3'… CGNCG …5'
>>>
G back to alphabet
Gla I GlaI
5'… R(5mC)GY …3'
3'… YG(5mC)R …5'
>>>
Glu I GluI
5'… G(5mC)NG(5mC) …3'
3'… (5mC)GN(5mC)G …5'
>>>
Gsa I BseYI
5'… CCCAGC …3'
3'… GGGTCG …5'
>>>
H back to alphabet
Hae III HaeIII
5'… GGCC …3'
3'… CCGG …5'
>>>
Hga I HgaI
5'… GACGC(N)5 …3'
3'… CTGCG(N)10 …5'
>>>
Hind II HindII
5'… GTYRAC …3'
3'… CARYTG …5'
>>>
Hind III HindIII
5'… AAGCTT …3'
3'… TTCGAA …5'
>>>
Hinf I HinfI
5'… GANTC …3'
3'… CTNAG …5'
>>>
Hpa I HpaI
5'… GTTAAC …3'
3'… CAATTG …5'
>>>
Hpa II HpaII
5'… CCGG …3'
3'… GGCC …5'
>>>
HpySE526 I MaeII
5'… ACGT …3'
3'… TGCA …5'
>>>
HspA I HhaI
5'… GCGC …3'
3'… CGCG …5'
>>>
K back to alphabet
Kpn I KpnI
5'… GGTACC …3'
3'… CCATGG …5'
>>>
Kro I KroI
5'… GC(5mC)GGC …3'
3'… CGG(5mC)CG …5'
>>>
KroN I NaeI
5'… GCCGGC …3'
3'… CGGCCG …5'
>>>
Ksp22 I BclI
5'… TGATCA …3'
3'… ACTAGT …5'
>>>
Kzo9 I MboI
5'… GATC …3'
3'… CTAG …5'
>>>
L back to alphabet
Lmn I LmnI
5'… GCTCCN …3'
3'… CGAGGN …5'
>>>
M back to alphabet
Mab I SexAI
5'… ACCWGGT …3'
3'… TGGWCCA …5'
>>>
Mal I DpnI
5'… G(mA)TC …3'
3'… CT(mA)G …5'
>>>
Mbo II MboII
5'… GAAGA(N)8 …3'
3'… CTTCT(N)7 …5'
>>>
Mfe I MfeI
5'… CAATTG …3'
3'… GTTAAC …5'
>>>
Mhl I SduI
5'… GDGCHC …3'
3'… CHCGDG …5'
>>>
Mlu I MluI
5'… ACGCGT …3'
3'… TGCGCA …5'
>>>
Mly113 I NarI
5'… GGCGCC …3'
3'… CCGCGG …5'
>>>
Mnl I MnlI
5'… CCTC(N)7 …3'
3'… GGAG(N)6 …5'
>>>
Mox20 I BalI
5'… TGGCCA …3'
3'… ACCGGT …5'
>>>
MroN I (NaeI)
5'… GCCGGC …3'
3'… CGGCCG …5'
>>>
MroX I XmnI
5'… GAANNNNTTC …3'
3'… CTTNNNNAAG …5'
>>>
Msp I HpaII
5'… CCGG …3'
3'… GGCC …5'
>>>
MspA1 I NspBII
5'… CmGCKG …3'
3'… GKCGmC …5'
>>>
MspR9 I ScrFI
5'… CCNGG …3'
3'… GGNCC …5'
>>>
Mte I Mte
5'… G(5mC)G(5mC)NG(5mC)G(5mC) …3'
3'… (5mC)G(5mC)GN(5mC)G(5mC)G …5'
>>>
N back to alphabet
Nru I NruI
5'… TCGCGA …3'
3'… AGCGCT …5'
>>>
P back to alphabet
PalA I AscI
5'… GGCGCGCC …3'
3'… CCGCGCGG …5'
>>>
Pce I StuI
5'… AGGCCT …3'
3'… TCCGGA …5'
>>>
Pci I BspLU11I
5'… ACATGT …3'
3'… TGTACA …5'
>>>
PciS I SapI
5'… GCTCTTCN …3'
3'… CGAGAAG(N)4 …5'
>>>
Pcs I PcsI
5'… (5mC)GNNNNNNN(5mC)G …3'
3'… G(5mC)NNNNNNNG(5mC) …5'
>>>
Pct I BsmI
5'… GAATGCN …3'
3'… CTTACGN …5'
>>>
Pec I PsiI
5'… TTATAA …3'
3'… AATATT …5'
>>>
Pkr I PkrI
5'… G(5mC)NG(5mC) …3'
3'… (5mC)GN(5mC)G …5'
>>>
Ple19 I PvuI
5'… CGATCG …3'
3'… GCTAGC …5'
>>>
Pps I PleI
5'… GAGTC(N)4 …3'
3'… CTCAG(N)5 …5'
>>>
Pse31 I Eco31I
5'… GGTCTC(N)1 …3'
3'… CCAGAG(N)5 …5'
>>>
Psi I PsiI
5'… TTATAA …3'
3'… AATATT …5'
>>>
Psp124B I SacI
5'… GAGCTC …3'
3'… CTCGAG …5'
>>>
Psp6 I EcoRII
5'… CCWGG …3'
3'… GGWCC …5'
>>>
PspC I PmaCI
5'… CACGTG …3'
3'… GTGCAC …5'
>>>
PspE I BstEII
5'… GGTNACC …3'
3'… CCANTGG …5'
>>>
PspL I SplI
5'… CGTACG …3'
3'… GCATGC …5'
>>>
PspN4 I NlaIV
5'… GGNNCC …3'
3'… CCNNGG …5'
>>>
PspOM I (ApaI)
5'… GGGCCC …3'
3'… CCCGGG …5'
>>>
PspPP I PpuMI
5'… RGGWCCY …3'
3'… YCCWGGR …5'
>>>
PspX I PspXI
5'… VCTCGAGB …3'
3'… BGAGCTCV …5'
>>>
Psr I PsrI
5'… (N)7GAACNNNNNNTAC(N)12 …3'
3'… (N)12CTTGNNNNNNATG(N)7 …5'
>>>
Pst I PstI
5'… CTGCAG …3'
3'… GACGTC …5'
>>>
PstN I AlwNI
5'… CAGNNNCTG …3'
3'… GTCNNNGAC …5'
>>>
Pvu II PvuII
5'… CAGCTG …3'
3'… GTCGAC …5'
>>>
R back to alphabet
Rga I SgfI
5'… GCGATCGC …3'
3'… CGCTAGCG …5'
>>>
Rig I FseI
5'… GGCCGGCC …3'
3'… CCGGCCGG …5'
>>>
Rsa I RsaI
5'… GTAC …3'
3'… CATG …5'
>>>
RsaN I RsaI
5'… GTAC …3'
3'… CATG …5'
>>>
Rsr2 I RsrII
5'… CGGWCCG …3'
3'… GCCWGGC …5'
>>>
S back to alphabet
Sal I SalI
5'… GTCGAC …3'
3'… CAGCTG …5'
>>>
Sbf I Sse8387I
5'… CCTGCAGG …3'
3'… GGACGTCC …5'
>>>
Set I SetI
5'… ASST …3'
3'… TSSA …5'
>>>
SfaN I SfaNI
5'… GCATC(N)5 …3'
3'… CGTAG(N)9 …5'
>>>
Sfi I SfiI
5'… GGCCNNNNNGGCC …3'
3'… CCGGNNNNNCCGG …5'
>>>
Sfr274 I XhoI
5'… CTCGAG …3'
3'… GAGCTC …5'
>>>
Sfr303 I SacII
5'… CCGCGG …3'
3'… GGCGCC …5'
>>>
Sma I SmaI
5'… CCCGGG …3'
3'… GGGCCC …5'
>>>
Smi I SwaI
5'… ATTTAAAT …3'
3'… TAAATTTA …5'
>>>
SmiM I MslI
5'… CAYNNNNRTG …3'
3'… GTRNNNNYAC …5'
>>>
Sph I SphI
5'… GCATGC …3'
3'… CGTACG …5'
>>>
Sse9 I Tsp509I
5'… AATT …3'
3'… TTAA …5'
>>>
Ssp I SspI
5'… AATATT …3'
3'… TTATAA …5'
>>>
SspM I BfaI
5'… CTAG …3'
3'… GATC …5'
>>>
T back to alphabet
Taq I TaqI
5'… TCGA …3'
3'… AGCT …5'
>>>
Tru9 I MseI
5'… TTAA …3'
3'… AATT …5'
>>>
TseF I Tsp45I
5'… GTSAC …3'
3'… CASTG …5'
>>>
Tth111 I Tth111I
5'… GACNNNGTC …3'
3'… CTGNNNCAG …5'
>>>
V back to alphabet
Vne I ApaLI
5'… GTGCAC …3'
3'… CACGTG …5'
>>>
Vsp I VspI
5'… ATTAAT …3'
3'… TAATTA …5'
>>>
X back to alphabet
Xba I XbaI
5'… TCTAGA …3'
3'… AGATCT …5'
>>>
Xma I XmaI
5'… CCCGGG …3'
3'… GGGCCC …5'
>>>
Z back to alphabet
Zra I (AatII)
5'… GACGTC …3'
3'… CTGCAG …5'
>>>
Zrm I ScaI
5'… AGTACT …3'
3'… TCATGA …5'
>>>
Zsp2 I NsiI
5'… ATGCAT …3'
3'… TACGTA …5'
>>>

Smi I

Enzyme name Smi I
Prototype SwaI
Known analogs SwaI
SKU SE-E225
Turbo version Available
High-concentration version Not available
Restriction type Type IIPiType IIP enzymes are classical Type II restriction enzymes with palindromic recognition sequences and symmetric cleavage sites.
Recognition site
5'… ATTTAAAT …3'
3'… TAAATTTA …5'
Source Streptococcus milleri S
Optimal buffer SE-buffer O (50 mM Tris-HCl (pH 7.6 at 25°C); 10 mM MgCl2; 100 mM NaCl; 1 mM DTT.)
Optimal temperature 37 °C
Inactivation temperature 65 °C
Buffer activity
BGOWYROSE
2525100752510
Unit definition One unit of the enzyme is the amount required to hydrolyze 1 μg of T7 DNA (SspI-digest) in 1 hour at 37°C in a total reaction volume of 50 μl.
Assayed on T7 DNA (SspI-digest)
Storage conditions 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 250 mM NaCl; 0.1 mM EDTA; 7 mM 2-mercaptoethanol; 100 μg/ml BSA; 50% glycerol. Store at -20°C.
Ligation After 20-fold overdigestion with enzyme >95% of the DNA fragments can be ligated and recut.
Nonspecific hydrolysis No nonspecific activity was detected after incubation of 1 μg of T7 DNA with 40 u.a. of enzyme for 16 hours at 37°C.
Methylation sensitivity not tested
Reagents supplied with enzyme 10 X SE-buffer O, BSA
Notes To obtain 100% activity, BSA should be added to the 1 x reaction mix to a final concentration of 100 μg/ml. Do not use BSA for long incubation.
References
  1. V.S. Dedkov, T.S. Bondar, A.V. Shevchenko, S.Kh. Degtyarev Novel restriction endonuclease SmiI from Streptococcus milleri recognize 5′-ATTT^AAAT-3′. // Molecular Biology and Virusology, No.1, 23-27 (2000). (In Russian)
  2. V.S. Dedkov, S.Kh. Degtyarev Actinobacillus and Streptococcus: producers of isoschizomers of the restriction endonucleases R.Hph I, R.Sau I, R.Nhe I, R.Mbo I and R.Swa I. // Biol. Chem., Vol. 379, 573-574, (1998).
// Код для некролога