SibEnzyme REBase

restriction enzymes database

Quick navigation
Enzyme Prototype Recognition site Supply options
A back to alphabet
Aat II AatII
5'… GACGTC …3'
3'… CTGCAG …5'
>>>
Abs I AbsI
5'… CCTCGAGG …3'
3'… GGAGCTCC …5'
>>>
Acc16 I MstI
5'… TGCGCA …3'
3'… ACGCGT …5'
>>>
Acc36 I BspMI
5'… ACCTGC(N)4 …3'
3'… TGGACG(N)8 …5'
>>>
Acc65 I KpnI
5'… GGTACC …3'
3'… CCATGG …5'
>>>
AccB1 I HgiCI
5'… GGYRCC …3'
3'… CCRYGG …5'
>>>
AccB7 I PflMI
5'… CCANNNNNTGG …3'
3'… GGTNNNNNACC …5'
>>>
AccBS I BsrBI
5'… GAGCGG …3'
3'… CTCGCC …5'
>>>
Acl I AclI
5'… AACGTT …3'
3'… TTGCAA …5'
>>>
AclW I BinI
5'… GGATC(N)4 …3'
3'… CCTAG(N)5 …5'
>>>
Aco I CfrI
5'… YGGCCR …3'
3'… RCCGGY …5'
>>>
Acs I ApoI
5'… RAATTY …3'
3'… YTTAAR …5'
>>>
Acu I Eco57I
5'… CTGAAG(N)16 …3'
3'… GACTTC(N)14 …5'
>>>
Afe I Eco47III
5'… AGCGCT …3'
3'… TCGCGA …5'
>>>
Ags I AgsI
5'… TTSAA …3'
3'… AASTT …5'
>>>
Ahl I SpeI
5'… ACTAGT …3'
3'… TGATCA …5'
>>>
Ajn I EcoRII
5'… CCWGG …3'
3'… GGWCC …5'
>>>
Ale I OliI
5'… CACNNNNGTG …3'
3'… GTGNNNNCAC …5'
>>>
Alu I AluI
5'… AGCT …3'
3'… TCGA …5'
>>>
AluB I AluI
5'… AGCT …3'
3'… TCGA …5'
>>>
Ama87 I AvaI
5'… CYCGRG …3'
3'… GRGCYC …5'
>>>
Aox I AoxI
5'… RG(5mC)Y …3'
3'… Y(5mC)GR …5'
>>>
Apa I ApaI
5'… GGGCCC …3'
3'… CCCGGG …5'
>>>
Ars I ArsI
5'… (N)8GACNNNNNNTTYG(N)11 …3'
3'… (N)13CTGNNNNNNAARC(N)6 …5'
>>>
AsiG I AgeI
5'… ACCGGT …3'
3'… TGGCCA …5'
>>>
AsiS I #Н/Д
5'… GCGATCGC …3'
3'… CGCTAGCG …5'
>>>
AspA2 I AvrII
5'… CCTAGG …3'
3'… GGATCC …5'
>>>
AspLE I HhaI
5'… GCGC …3'
3'… CGCG …5'
>>>
AspS9 I Sau96I
5'… GGNCC …3'
3'… CCNGG …5'
>>>
AsuC2 I CauII
5'… CCSGG …3'
3'… GGSCC …5'
>>>
AsuHP I HphI
5'… GGTGA(N)8 …3'
3'… CCACT(N)7 …5'
>>>
AsuNH I NheI
5'… GCTAGC …3'
3'… CGATCG …5'
>>>
B back to alphabet
BamH I BamHI
5'… GGATCC …3'
3'… CCTAGG …5'
>>>
Bar I BarI
5'… (N)7GAAGNNNNNNTAC(N)12 …3'
3'… (N)12CTTCNNNNNNATG(N)7 …5'
>>>
Bbv12 I HgiAI
5'… GWGCWC …3'
3'… CWCGWG …5'
>>>
Bgl I BglI
5'… GCCNNNNNGGC …3'
3'… CGGNNNNNCCG …5'
>>>
Bgl II BglII
5'… AGATCT …3'
3'… TCTAGA …5'
>>>
Bls I BlsI Неверный формат сайта узнавания >>>
Bme18 I AvaII
5'… GGWCC …3'
3'… CCWGG …5'
>>>
Bmo I SanDI
5'… GGGWCCC …3'
3'… CCCWGGG …5'
>>>
Bmt I NheI
5'… GCTAGC …3'
3'… CGATCG …5'
>>>
Bmu I BfiI
5'… ACTGGG(N)5 …3'
3'… TGACCC(N)4 …5'
>>>
Bpm I GsuI
5'… CTGGAG(N)16 …3'
3'… GACCTC(N)14 …5'
>>>
Bpu10 I Bpu10I
5'… CCTNAGC …3'
3'… GGANTCG …5'
>>>
Bpu14 I AsuII
5'… TTCGAA …3'
3'… AAGCTT …5'
>>>
Bsa29 I ClaI
5'… ATCGAT …3'
3'… TAGCTA …5'
>>>
Bsc4 I BsiYI
5'… CCNNNNNNNGG …3'
3'… GGNNNNNNNCC …5'
>>>
Bse1 I BsrI
5'… ACTGGN …3'
3'… TGACCN …5'
>>>
Bse118 I Cfr10I
5'… RCCGGY …3'
3'… YGGCCR …5'
>>>
Bse21 I SauI
5'… CCTNAGG …3'
3'… GGANTCC …5'
>>>
Bse3D I BsrDI
5'… GCAATGNN …3'
3'… CGTTACNN …5'
>>>
Bse8 I BsaBI
5'… GATNNNNATC …3'
3'… CTANNNNTAG …5'
>>>
BseP I BsePI
5'… GCGCGC …3'
3'… CGCGCG …5'
>>>
BseX3 I XmaIII
5'… CGGCCG …3'
3'… GCCGGC …5'
>>>
BslF I FinI
5'… GGGAC(N)10 …3'
3'… CCCTG(N)14 …5'
>>>
Bso31 I Eco31I
5'… GGTCTCN …3'
3'… CCAGAG(N)5 …5'
>>>
Bsp13 I BspMII
5'… TCCGGA …3'
3'… AGGCCT …5'
>>>
Bsp1720 I EspI
5'… GCTNAGC …3'
3'… CGANTCG …5'
>>>
Bsp19 I NcoI
5'… CCATGG …3'
3'… GGTACC …5'
>>>
BspAC I AciI
5'… CCGC …3'
3'… GGCG …5'
>>>
BspFN I FnuDII
5'… CGCG …3'
3'… GCGC …5'
>>>
BssEC I SecI
5'… CCNNGG …3'
3'… GGNNCC …5'
>>>
BssNA I SnaI
5'… GTATAC …3'
3'… CATATG …5'
>>>
BssT1 I StyI
5'… CCWWGG …3'
3'… GGWWCC …5'
>>>
Bst2B I BsiI
5'… CTCGTG …3'
3'… GAGCAC …5'
>>>
Bst2U I BstNI
5'… CCWGG …3'
3'… GGWCC …5'
>>>
Bst4C I Tsp4CI
5'… ACNGT …3'
3'… TGNCA …5'
>>>
Bst6 I Ksp632I
5'… CTCTTCN …3'
3'… GAGAAG(N)4 …5'
>>>
BstAC I AcyI
5'… GRCGYC …3'
3'… CYGCRG …5'
>>>
BstAF I AflII
5'… CTTAAG …3'
3'… GAATTC …5'
>>>
BstAP I (ApaBI)
5'… GCANNNNNTGC …3'
3'… CGTNNNNNACG …5'
>>>
BstAU I Bsp1407I
5'… TGTACA …3'
3'… ACATGT …5'
>>>
BstBA I BsaAI
5'… YACGTR …3'
3'… RTGCAY …5'
>>>
BstC8 I Cac8I
5'… GCNNGC …3'
3'… CGNNCG …5'
>>>
BstDE I DdeI
5'… CTNAG …3'
3'… GANTC …5'
>>>
BstDS I DsaI
5'… CCRYGG …3'
3'… GGYRCC …5'
>>>
BstEN I EcoNI
5'… CCTNNNNNAGG …3'
3'… GGANNNNNTCC …5'
>>>
BstF5 I (FokI)
5'… GGATGNN …3'
3'… CCTACNN …5'
>>>
BstFN I FnuDII
5'… CGCG …3'
3'… GCGC …5'
>>>
BstH2 I HaeII
5'… RGCGCY …3'
3'… YCGCGR …5'
>>>
BstHH I HhaI
5'… GCGC …3'
3'… CGCG …5'
>>>
BstKT I MboI
5'… GATC …3'
3'… CTAG …5'
>>>
BstMA I BsmAI
5'… GTCTCN …3'
3'… CAGAG(N)5 …5'
>>>
BstMB I MboI
5'… GATC …3'
3'… CTAG …5'
>>>
BstMC I McrI
5'… CGRYCG …3'
3'… GCYRGC …5'
>>>
BstMW I MwoI
5'… GCNNNNNNNGC …3'
3'… CGNNNNNNNCG …5'
>>>
BstNS I NspI
5'… RCATGY …3'
3'… YGTACR …5'
>>>
BstPA I PshAI
5'… GACNNNNGTC …3'
3'… CTGNNNNCAG …5'
>>>
BstSC I ScrFI
5'… CCNGG …3'
3'… GGNCC …5'
>>>
BstSF I SfeI
5'… CTRYAG …3'
3'… GAYRTC …5'
>>>
BstSL I BseSI
5'… GKGCmC …3'
3'… CmCGKG …5'
>>>
BstSN I SnaBI
5'… TACGTA …3'
3'… ATGCAT …5'
>>>
BstV1 I BbvI
5'… GCAGC(N)8 …3'
3'… CGTCG(N)12 …5'
>>>
BstV2 I BbvII
5'… GAAGAC(N)2 …3'
3'… CTTCTG(N)6 …5'
>>>
BstX I BstXI
5'… CCANNNNNNTGG …3'
3'… GGTNNNNNNACC …5'
>>>
BstX2 I XhoII
5'… RGATCY …3'
3'… YCTAGR …5'
>>>
Bsu I BciVI
5'… GTATCC(N)6 …3'
3'… CATAGG(N)5 …5'
>>>
BsuR I HaeIII
5'… GGCC …3'
3'… CCGG …5'
>>>
Btr I BtrI
5'… CACGTC …3'
3'… GTGCAG …5'
>>>
C back to alphabet
Cci I BspHI
5'… TCATGA …3'
3'… AGTACT …5'
>>>
CciN I NotI
5'… GCGGCCGC …3'
3'… CGCCGGCG …5'
>>>
D back to alphabet
Dra I AhaIII
5'… TTTAAA …3'
3'… AAATTT …5'
>>>
Dra III DraIII
5'… CACNNNGTG …3'
3'… GTGNNNCAC …5'
>>>
Dri I Eam1105I
5'… GACNNNNNGTC …3'
3'… CTGNNNNNCAG …5'
>>>
DseD I DrdI
5'… GACNNNNNNGTC …3'
3'… CTGNNNNNNCAG …5'
>>>
E back to alphabet
EcoICR I SacI
5'… GAGCTC …3'
3'… CTCGAG …5'
>>>
EcoR I EcoRI
5'… GAATTC …3'
3'… CTTAAG …5'
>>>
EcoR V EcoRV
5'… GATATC …3'
3'… CTATAG …5'
>>>
Ege I NarI
5'… GGCGCC …3'
3'… CCGCGG …5'
>>>
Emi I Ksp632I
5'… CTCTTC(N)1 …3'
3'… GAGAAG(N)4 …5'
>>>
Erh I StyI
5'… CCWWGG …3'
3'… GGWWCC …5'
>>>
F back to alphabet
Fae I NlaIII
5'… CATG …3'
3'… GTAC …5'
>>>
Fai I FaiI
5'… YATR …3'
3'… RTAY …5'
>>>
Fal I FalI
5'… (N)8AAGNNNNNCTT(N)13 …3'
3'… (N)13TTCNNNNNGAA(N)8 …5'
>>>
Fat I NlaIII
5'… CATG …3'
3'… GTAC …5'
>>>
Fau I FauI
5'… CCCGC(N)4 …3'
3'… GGGCG(N)6 …5'
>>>
FauND I NdeI
5'… CATATG …3'
3'… GTATAC …5'
>>>
Fbl I AccI
5'… GTmKAC …3'
3'… CAKmTG …5'
>>>
Fok I FokI
5'… GGATG(N)9 …3'
3'… CCTAC(N)13 …5'
>>>
FriO I BanII
5'… GRGCYC …3'
3'… CYCGRG …5'
>>>
Fsp4H I Fnu4HI
5'… GCNGC …3'
3'… CGNCG …5'
>>>
G back to alphabet
Gla I GlaI
5'… R(5mC)GY …3'
3'… YG(5mC)R …5'
>>>
Glu I GluI
5'… G(5mC)NG(5mC) …3'
3'… (5mC)GN(5mC)G …5'
>>>
Gsa I BseYI
5'… CCCAGC …3'
3'… GGGTCG …5'
>>>
H back to alphabet
Hae III HaeIII
5'… GGCC …3'
3'… CCGG …5'
>>>
Hga I HgaI
5'… GACGC(N)5 …3'
3'… CTGCG(N)10 …5'
>>>
Hind II HindII
5'… GTYRAC …3'
3'… CARYTG …5'
>>>
Hind III HindIII
5'… AAGCTT …3'
3'… TTCGAA …5'
>>>
Hinf I HinfI
5'… GANTC …3'
3'… CTNAG …5'
>>>
Hpa I HpaI
5'… GTTAAC …3'
3'… CAATTG …5'
>>>
Hpa II HpaII
5'… CCGG …3'
3'… GGCC …5'
>>>
HpySE526 I MaeII
5'… ACGT …3'
3'… TGCA …5'
>>>
HspA I HhaI
5'… GCGC …3'
3'… CGCG …5'
>>>
K back to alphabet
Kpn I KpnI
5'… GGTACC …3'
3'… CCATGG …5'
>>>
Kro I KroI
5'… GC(5mC)GGC …3'
3'… CGG(5mC)CG …5'
>>>
KroN I NaeI
5'… GCCGGC …3'
3'… CGGCCG …5'
>>>
Ksp22 I BclI
5'… TGATCA …3'
3'… ACTAGT …5'
>>>
Kzo9 I MboI
5'… GATC …3'
3'… CTAG …5'
>>>
L back to alphabet
Lmn I LmnI
5'… GCTCCN …3'
3'… CGAGGN …5'
>>>
M back to alphabet
Mab I SexAI
5'… ACCWGGT …3'
3'… TGGWCCA …5'
>>>
Mal I DpnI
5'… G(mA)TC …3'
3'… CT(mA)G …5'
>>>
Mbo II MboII
5'… GAAGA(N)8 …3'
3'… CTTCT(N)7 …5'
>>>
Mfe I MfeI
5'… CAATTG …3'
3'… GTTAAC …5'
>>>
Mhl I SduI
5'… GDGCHC …3'
3'… CHCGDG …5'
>>>
Mlu I MluI
5'… ACGCGT …3'
3'… TGCGCA …5'
>>>
Mly113 I NarI
5'… GGCGCC …3'
3'… CCGCGG …5'
>>>
Mnl I MnlI
5'… CCTC(N)7 …3'
3'… GGAG(N)6 …5'
>>>
Mox20 I BalI
5'… TGGCCA …3'
3'… ACCGGT …5'
>>>
MroN I (NaeI)
5'… GCCGGC …3'
3'… CGGCCG …5'
>>>
MroX I XmnI
5'… GAANNNNTTC …3'
3'… CTTNNNNAAG …5'
>>>
Msp I HpaII
5'… CCGG …3'
3'… GGCC …5'
>>>
MspA1 I NspBII
5'… CmGCKG …3'
3'… GKCGmC …5'
>>>
MspR9 I ScrFI
5'… CCNGG …3'
3'… GGNCC …5'
>>>
Mte I Mte
5'… G(5mC)G(5mC)NG(5mC)G(5mC) …3'
3'… (5mC)G(5mC)GN(5mC)G(5mC)G …5'
>>>
N back to alphabet
Nru I NruI
5'… TCGCGA …3'
3'… AGCGCT …5'
>>>
P back to alphabet
PalA I AscI
5'… GGCGCGCC …3'
3'… CCGCGCGG …5'
>>>
Pce I StuI
5'… AGGCCT …3'
3'… TCCGGA …5'
>>>
Pci I BspLU11I
5'… ACATGT …3'
3'… TGTACA …5'
>>>
PciS I SapI
5'… GCTCTTCN …3'
3'… CGAGAAG(N)4 …5'
>>>
Pcs I PcsI
5'… (5mC)GNNNNNNN(5mC)G …3'
3'… G(5mC)NNNNNNNG(5mC) …5'
>>>
Pct I BsmI
5'… GAATGCN …3'
3'… CTTACGN …5'
>>>
Pec I PsiI
5'… TTATAA …3'
3'… AATATT …5'
>>>
Pkr I PkrI
5'… G(5mC)NG(5mC) …3'
3'… (5mC)GN(5mC)G …5'
>>>
Ple19 I PvuI
5'… CGATCG …3'
3'… GCTAGC …5'
>>>
Pps I PleI
5'… GAGTC(N)4 …3'
3'… CTCAG(N)5 …5'
>>>
Pse31 I Eco31I
5'… GGTCTC(N)1 …3'
3'… CCAGAG(N)5 …5'
>>>
Psi I PsiI
5'… TTATAA …3'
3'… AATATT …5'
>>>
Psp124B I SacI
5'… GAGCTC …3'
3'… CTCGAG …5'
>>>
Psp6 I EcoRII
5'… CCWGG …3'
3'… GGWCC …5'
>>>
PspC I PmaCI
5'… CACGTG …3'
3'… GTGCAC …5'
>>>
PspE I BstEII
5'… GGTNACC …3'
3'… CCANTGG …5'
>>>
PspL I SplI
5'… CGTACG …3'
3'… GCATGC …5'
>>>
PspN4 I NlaIV
5'… GGNNCC …3'
3'… CCNNGG …5'
>>>
PspOM I (ApaI)
5'… GGGCCC …3'
3'… CCCGGG …5'
>>>
PspPP I PpuMI
5'… RGGWCCY …3'
3'… YCCWGGR …5'
>>>
PspX I PspXI
5'… VCTCGAGB …3'
3'… BGAGCTCV …5'
>>>
Psr I PsrI
5'… (N)7GAACNNNNNNTAC(N)12 …3'
3'… (N)12CTTGNNNNNNATG(N)7 …5'
>>>
Pst I PstI
5'… CTGCAG …3'
3'… GACGTC …5'
>>>
PstN I AlwNI
5'… CAGNNNCTG …3'
3'… GTCNNNGAC …5'
>>>
Pvu II PvuII
5'… CAGCTG …3'
3'… GTCGAC …5'
>>>
R back to alphabet
Rga I SgfI
5'… GCGATCGC …3'
3'… CGCTAGCG …5'
>>>
Rig I FseI
5'… GGCCGGCC …3'
3'… CCGGCCGG …5'
>>>
Rsa I RsaI
5'… GTAC …3'
3'… CATG …5'
>>>
RsaN I RsaI
5'… GTAC …3'
3'… CATG …5'
>>>
Rsr2 I RsrII
5'… CGGWCCG …3'
3'… GCCWGGC …5'
>>>
S back to alphabet
Sal I SalI
5'… GTCGAC …3'
3'… CAGCTG …5'
>>>
Sbf I Sse8387I
5'… CCTGCAGG …3'
3'… GGACGTCC …5'
>>>
Set I SetI
5'… ASST …3'
3'… TSSA …5'
>>>
SfaN I SfaNI
5'… GCATC(N)5 …3'
3'… CGTAG(N)9 …5'
>>>
Sfi I SfiI
5'… GGCCNNNNNGGCC …3'
3'… CCGGNNNNNCCGG …5'
>>>
Sfr274 I XhoI
5'… CTCGAG …3'
3'… GAGCTC …5'
>>>
Sfr303 I SacII
5'… CCGCGG …3'
3'… GGCGCC …5'
>>>
Sma I SmaI
5'… CCCGGG …3'
3'… GGGCCC …5'
>>>
Smi I SwaI
5'… ATTTAAAT …3'
3'… TAAATTTA …5'
>>>
SmiM I MslI
5'… CAYNNNNRTG …3'
3'… GTRNNNNYAC …5'
>>>
Sph I SphI
5'… GCATGC …3'
3'… CGTACG …5'
>>>
Sse9 I Tsp509I
5'… AATT …3'
3'… TTAA …5'
>>>
Ssp I SspI
5'… AATATT …3'
3'… TTATAA …5'
>>>
SspM I BfaI
5'… CTAG …3'
3'… GATC …5'
>>>
T back to alphabet
Taq I TaqI
5'… TCGA …3'
3'… AGCT …5'
>>>
Tru9 I MseI
5'… TTAA …3'
3'… AATT …5'
>>>
TseF I Tsp45I
5'… GTSAC …3'
3'… CASTG …5'
>>>
Tth111 I Tth111I
5'… GACNNNGTC …3'
3'… CTGNNNCAG …5'
>>>
V back to alphabet
Vne I ApaLI
5'… GTGCAC …3'
3'… CACGTG …5'
>>>
Vsp I VspI
5'… ATTAAT …3'
3'… TAATTA …5'
>>>
X back to alphabet
Xba I XbaI
5'… TCTAGA …3'
3'… AGATCT …5'
>>>
Xma I XmaI
5'… CCCGGG …3'
3'… GGGCCC …5'
>>>
Z back to alphabet
Zra I (AatII)
5'… GACGTC …3'
3'… CTGCAG …5'
>>>
Zrm I ScaI
5'… AGTACT …3'
3'… TCATGA …5'
>>>
Zsp2 I NsiI
5'… ATGCAT …3'
3'… TACGTA …5'
>>>

Zra I

Enzyme name Zra I
Prototype (AatII)
Known analogs Aat II
SKU SE-E463
Turbo version Not available
High-concentration version Not available
Restriction type Type IIPiType IIP enzymes are classical Type II restriction enzymes with palindromic recognition sequences and symmetric cleavage sites.
Recognition site
5'… GACGTC …3'
3'… CTGCAG …5'
Source An E.coli strain that carries the cloned Zra I gene from Zoogloea ramigera 11
Optimal buffer SE-buffer B (10 mM Tris-HCl (pH 7.6 at 25°C); 10 mM MgCl2; 1 mM DTT.)
Optimal temperature 37 °C
Inactivation temperature 80 °C
Buffer activity
BGOWYROSE
10050252575100
Unit definition One unit of the enzyme is the amount required to hydrolyze 1 μg of Lambda DNA in 1 hour at 37°C in a total reaction volume of 50 μl.
Assayed on Lambda DNA
Storage conditions 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 50 mM NaCl; 0.1 mM EDTA; 1 mM DTT; 200 μg/ml BSA; 50% glycerol. Store at -20°C.
Ligation After 10-fold overdigestion with enzyme more than 90% of the DNA fragments can be ligated and recut. In the presence of 10% PEG
Nonspecific hydrolysis No nonspecific activity was detected after incubation of 1 μg of Lambda DNA with 10 u.a. of enzyme for 16 hours at 37°C.
Methylation sensitivity not tested
Reagents supplied with enzyme 10 X SE-buffer B
Notes High enzyme concentration may result in star activity.The minimum number of units that resulted in complete digestion of 1 ug of substrate DNA in 16 hours is 0,5.ZraI cleaves linear plasmid DNA at a rate 1,5-2 times higher than supercoiled plasmid DNA.
References
// Код для некролога