SibEnzyme REBase

База данных эндонуклеаз рестрикции и метилзависимых ДНК эндонуклеаз производства SibEnzyme

Поиск по последовательности

Поиск рестриктаз по последовательности ДНК
A, G, C, T — до 50 нуклеотидов. Для последовательностей до 10 нуклеотидов также допустимы R, W, S, K, M, Y, B, D, H, V, N.

Список ферментов

Быстрый переход
ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ
Фермент Прототип Сайт узнавания Варианты поставки
A к алфавиту
Aat II AatII
5'… GACGT▼C …3'
3'… C▲TGCAG …5'
 >>>
Abs I AbsI
5'… CC▼TCGAGG …3'
3'… GGAGCT▲CC …5'
 >>>
Acc16 I MstI
5'… TGC▼GCA …3'
3'… ACG▲CGT …5'
 >>>
Acc36 I BspMI
5'… ACCTGC(N)4▼ …3'
3'… TGGACG(N)8▲ …5'
 >>>
Acc65 I KpnI
5'… G▼GTACC …3'
3'… CCATG▲G …5'
 >>>
AccB1 I HgiCI
5'… G▼GYRCC …3'
3'… CCRYG▲G …5'
 >>>
AccB7 I PflMI
5'… CCANNNN▼NTGG …3'
3'… GGTN▲NNNNACC …5'
 >>>
AccBS I BsrBI
5'… GAG▼CGG …3'
3'… CTC▲GCC …5'
 >>>
Acl I AclI
5'… AA▼CGTT …3'
3'… TTGC▲AA …5'
 >>>
AclW I BinI
5'… GGATC(N)4▼ …3'
3'… CCTAG(N)5▲ …5'
 >>>
Aco I CfrI
5'… Y▼GGCCR …3'
3'… RCCGG▲Y …5'
 >>>
Acs I ApoI
5'… R▼AATTY …3'
3'… YTTAA▲R …5'
 >>>
Acu I Eco57I
5'… CTGAAG(N)16▼ …3'
3'… GACTTC(N)14▲ …5'
 >>>
Afe I Eco47III
5'… AGC▼GCT …3'
3'… TCG▲CGA …5'
 >>>
Ags I AgsI
5'… TTS▼AA …3'
3'… AA▲STT …5'
 >>>
Ahl I SpeI
5'… A▼CTAGT …3'
3'… TGATC▲A …5'
 >>>
Ajn I EcoRII
5'… ▼CCWGG …3'
3'… GGWCC▲ …5'
 >>>
Ale I OliI
5'… CACNN▼NNGTG …3'
3'… GTGNN▲NNCAC …5'
 >>>
Alu I AluI
5'… AG▼CT …3'
3'… TC▲GA …5'
 >>>
AluB I AluI
5'… AG▼CT …3'
3'… TC▲GA …5'
 >>>
Ama87 I AvaI
5'… C▼YCGRG …3'
3'… GRGCY▲C …5'
 >>>
Aox I AoxI
5'… ▼RG(5mC)Y …3'
3'… Y(5mC)GR▲ …5'
 >>>
Apa I ApaI
5'… GGGCC▼C …3'
3'… C▲CCGGG …5'
 >>>
Ars I ArsI
5'… ▼(N)8GACNNNNNNTTYG(N)11▼ …3'
3'… ▲(N)13CTGNNNNNNAARC(N)6▲ …5'
 >>>
AsiG I AgeI
5'… A▼CCGGT …3'
3'… TGGCC▲A …5'
 >>>
AsiS I #Н/Д
5'… GCGAT▼CGC …3'
3'… CGC▲TAGCG …5'
 >>>
AspA2 I AvrII
5'… C▼CTAGG …3'
3'… GGATC▲C …5'
 >>>
AspLE I HhaI
5'… GCG▼C …3'
3'… C▲GCG …5'
 >>>
AspS9 I Sau96I
5'… G▼GNCC …3'
3'… CCNG▲G …5'
 >>>
AsuC2 I CauII
5'… CC▼SGG …3'
3'… GGS▲CC …5'
 >>>
AsuHP I HphI
5'… GGTGA(N)8▼ …3'
3'… CCACT(N)7▲ …5'
 >>>
AsuNH I NheI
5'… G▼CTAGC …3'
3'… CGATC▲G …5'
 >>>
B к алфавиту
BamH I BamHI
5'… G▼GATCC …3'
3'… CCTAG▲G …5'
 >>>
Bar I BarI
5'… ▼(N)7GAAGNNNNNNTAC(N)12▼ …3'
3'… ▲(N)12CTTCNNNNNNATG(N)7▲ …5'
 >>>
Bbv12 I HgiAI
5'… GWGCW▼C …3'
3'… C▲WCGWG …5'
 >>>
Bgl I BglI
5'… GCCNNNN▼NGGC …3'
3'… CGGN▲NNNNCCG …5'
 >>>
Bgl II BglII
5'… A▼GATCT …3'
3'… TCTAG▲A …5'
 >>>
Bls I BlsI Неверный формат сайта узнавания >>>
Bme18 I AvaII
5'… G▼GWCC …3'
3'… CCWG▲G …5'
 >>>
Bmo I SanDI
5'… GG▼GWCCC …3'
3'… CCCWG▲GG …5'
 >>>
Bmt I NheI
5'… GCTAG▼C …3'
3'… C▲GATCG …5'
 >>>
Bmu I BfiI
5'… ACTGGG(N)5▼ …3'
3'… TGACCC(N)4▲ …5'
 >>>
Bpm I GsuI
5'… CTGGAG(N)16▼ …3'
3'… GACCTC(N)14▲ …5'
 >>>
Bpu10 I Bpu10I
5'… CC▼TNAGC …3'
3'… GGANT▲CG …5'
 >>>
Bpu14 I AsuII
5'… TT▼CGAA …3'
3'… AAGC▲TT …5'
 >>>
Bsa29 I ClaI
5'… AT▼CGAT …3'
3'… TAGC▲TA …5'
 >>>
Bsc4 I BsiYI
5'… CCNNNNN▼NNGG …3'
3'… GGNN▲NNNNNCC …5'
 >>>
Bse1 I BsrI
5'… ACTGGN▼ …3'
3'… TGAC▲CN …5'
 >>>
Bse118 I Cfr10I
5'… R▼CCGGY …3'
3'… YGGCC▲R …5'
 >>>
Bse21 I SauI
5'… CC▼TNAGG …3'
3'… GGANT▲CC …5'
 >>>
Bse3D I BsrDI
5'… GCAATGNN▼ …3'
3'… CGTTAC▲NN …5'
 >>>
Bse8 I BsaBI
5'… GATNN▼NNATC …3'
3'… CTANN▲NNTAG …5'
 >>>
BseP I BsePI
5'… G▼CGCGC …3'
3'… CGCGC▲G …5'
 >>>
BseX3 I XmaIII
5'… C▼GGCCG …3'
3'… GCCGG▲C …5'
 >>>
BslF I FinI
5'… GGGAC(N)10▼ …3'
3'… CCCTG(N)14▲ …5'
 >>>
Bso31 I Eco31I
5'… GGTCTCN▼ …3'
3'… CCAGAG(N)5▲ …5'
 >>>
Bsp13 I BspMII
5'… T▼CCGGA …3'
3'… AGGCC▲T …5'
 >>>
Bsp1720 I EspI
5'… GC▼TNAGC …3'
3'… CGANT▲CG …5'
 >>>
Bsp19 I NcoI
5'… C▼CATGG …3'
3'… GGTAC▲C …5'
 >>>
BspAC I AciI
5'… C▼CGC …3'
3'… GGC▲G …5'
 >>>
BspFN I FnuDII
5'… CG▼CG …3'
3'… GC▲GC …5'
 >>>
BssEC I SecI
5'… C▼CNNGG …3'
3'… GGNNC▲C …5'
 >>>
BssNA I SnaI
5'… GTA▼TAC …3'
3'… CAT▲ATG …5'
 >>>
BssT1 I StyI
5'… C▼CWWGG …3'
3'… GGWWC▲C …5'
 >>>
Bst2B I BsiI
5'… C▼TCGTG …3'
3'… GAGCA▲C …5'
 >>>
Bst2U I BstNI
5'… CC▼WGG …3'
3'… GGW▲CC …5'
 >>>
Bst4C I Tsp4CI
5'… ACN▼GT …3'
3'… TG▲NCA …5'
 >>>
Bst6 I Ksp632I
5'… CTCTTCN▼ …3'
3'… GAGAAG(N)4▲ …5'
 >>>
BstAC I AcyI
5'… GR▼CGYC …3'
3'… CYGC▲RG …5'
 >>>
BstAF I AflII
5'… C▼TTAAG …3'
3'… GAATT▲C …5'
 >>>
BstAP I (ApaBI)
5'… GCANNNN▼NTGC …3'
3'… CGTN▲NNNNACG …5'
 >>>
BstAU I Bsp1407I
5'… T▼GTACA …3'
3'… ACATG▲T …5'
 >>>
BstBA I BsaAI
5'… YAC▼GTR …3'
3'… RTG▲CAY …5'
 >>>
BstC8 I Cac8I
5'… GCN▼NGC …3'
3'… CGN▲NCG …5'
 >>>
BstDE I DdeI
5'… C▼TNAG …3'
3'… GANT▲C …5'
 >>>
BstDS I DsaI
5'… C▼CRYGG …3'
3'… GGYRC▲C …5'
 >>>
BstEN I EcoNI
5'… CCTNN▼NNNAGG …3'
3'… GGANNN▲NNTCC …5'
 >>>
BstF5 I (FokI)
5'… GGATGNN▼ …3'
3'… CCTAC▲NN …5'
 >>>
BstFN I FnuDII
5'… CG▼CG …3'
3'… GC▲GC …5'
 >>>
BstH2 I HaeII
5'… RGCGC▼Y …3'
3'… Y▲CGCGR …5'
 >>>
BstHH I HhaI
5'… GCG▼C …3'
3'… C▲GCG …5'
 >>>
BstKT I MboI
5'… GAT▼C …3'
3'… C▲TAG …5'
 >>>
BstMA I BsmAI
5'… GTCTCN▼ …3'
3'… CAGAG(N)5▲ …5'
 >>>
BstMB I MboI
5'… ▼GATC …3'
3'… CTAG▲ …5'
 >>>
BstMC I McrI
5'… CGRY▼CG …3'
3'… GC▲YRGC …5'
 >>>
BstMW I MwoI
5'… GCNNNNN▼NNGC …3'
3'… CGNN▲NNNNNCG …5'
 >>>
BstNS I NspI
5'… RCATG▼Y …3'
3'… Y▲GTACR …5'
 >>>
BstPA I PshAI
5'… GACNN▼NNGTC …3'
3'… CTGNN▲NNCAG …5'
 >>>
BstSC I ScrFI
5'… ▼CCNGG …3'
3'… GGNCC▲ …5'
 >>>
BstSF I SfeI
5'… C▼TRYAG …3'
3'… GAYRT▲C …5'
 >>>
BstSL I BseSI
5'… GKGCm▼C …3'
3'… C▲mCGKG …5'
 >>>
BstSN I SnaBI
5'… TAC▼GTA …3'
3'… ATG▲CAT …5'
 >>>
BstV1 I BbvI
5'… GCAGC(N)8▼ …3'
3'… CGTCG(N)12▲ …5'
 >>>
BstV2 I BbvII
5'… GAAGAC(N)2▼ …3'
3'… CTTCTG(N)6▲ …5'
 >>>
BstX I BstXI
5'… CCANNNNN▼NTGG …3'
3'… GGTN▲NNNNNACC …5'
 >>>
BstX2 I XhoII
5'… R▼GATCY …3'
3'… YCTAG▲R …5'
 >>>
Bsu I BciVI
5'… GTATCC(N)6▼ …3'
3'… CATAGG(N)5▲ …5'
 >>>
BsuR I HaeIII
5'… GG▼CC …3'
3'… CC▲GG …5'
 >>>
Btr I BtrI
5'… CAC▼GTC …3'
3'… GTG▲CAG …5'
 >>>
C к алфавиту
Cci I BspHI
5'… T▼CATGA …3'
3'… AGTAC▲T …5'
 >>>
CciN I NotI
5'… GC▼GGCCGC …3'
3'… CGCCGG▲CG …5'
 >>>
D к алфавиту
Dra I AhaIII
5'… TTT▼AAA …3'
3'… AAA▲TTT …5'
 >>>
Dra III DraIII
5'… CACNNN▼GTG …3'
3'… GTG▲NNNCAC …5'
 >>>
Dri I Eam1105I
5'… GACNNN▼NNGTC …3'
3'… CTGNN▲NNNCAG …5'
 >>>
DseD I DrdI
5'… GACNNNN▼NNGTC …3'
3'… CTGNN▲NNNNCAG …5'
 >>>
E к алфавиту
EcoICR I SacI
5'… GAG▼CTC …3'
3'… CTC▲GAG …5'
 >>>
EcoR I EcoRI
5'… G▼AATTC …3'
3'… CTTAA▲G …5'
 >>>
EcoR V EcoRV
5'… GAT▼ATC …3'
3'… CTA▲TAG …5'
 >>>
Ege I NarI
5'… GGC▼GCC …3'
3'… CCG▲CGG …5'
 >>>
Emi I Ksp632I
5'… CTCTTC(N)1▼ …3'
3'… GAGAAG(N)4▲ …5'
 >>>
Erh I StyI
5'… C▼CWWGG …3'
3'… GGWWC▲C …5'
 >>>
F к алфавиту
Fae I NlaIII
5'… CATG▼ …3'
3'… ▲GTAC …5'
 >>>
Fai I FaiI
5'… YA▼TR …3'
3'… RT▲AY …5'
 >>>
Fal I FalI
5'… ▼(N)8AAGNNNNNCTT(N)13▼ …3'
3'… ▲(N)13TTCNNNNNGAA(N)8▲ …5'
 >>>
Fat I NlaIII
5'… ▼CATG …3'
3'… GTAC▲ …5'
 >>>
Fau I FauI
5'… CCCGC(N)4▼ …3'
3'… GGGCG(N)6▲ …5'
 >>>
FauND I NdeI
5'… CA▼TATG …3'
3'… GTAT▲AC …5'
 >>>
Fbl I AccI
5'… GT▼mKAC …3'
3'… CAKm▲TG …5'
 >>>
Fok I FokI
5'… GGATG(N)9▼ …3'
3'… CCTAC(N)13▲ …5'
 >>>
FriO I BanII
5'… GRGCY▼C …3'
3'… C▲YCGRG …5'
 >>>
Fsp4H I Fnu4HI
5'… GC▼NGC …3'
3'… CGN▲CG …5'
 >>>
G к алфавиту
Gla I GlaI
5'… R(5mC)▼GY …3'
3'… YG▲(5mC)R …5'
 >>>
Glu I GluI
5'… G(5mC)▼NG(5mC) …3'
3'… (5mC)GN▲(5mC)G …5'
 >>>
Gsa I BseYI
5'… CCCAG▼C …3'
3'… G▲GGTCG …5'
 >>>
H к алфавиту
Hae III HaeIII
5'… GG▼CC …3'
3'… CC▲GG …5'
 >>>
Hga I HgaI
5'… GACGC(N)5▼ …3'
3'… CTGCG(N)10▲ …5'
 >>>
Hind II HindII
5'… GTY▼RAC …3'
3'… CAR▲YTG …5'
 >>>
Hind III HindIII
5'… A▼AGCTT …3'
3'… TTCGA▲A …5'
 >>>
Hinf I HinfI
5'… G▼ANTC …3'
3'… CTNA▲G …5'
 >>>
Hpa I HpaI
5'… GTT▼AAC …3'
3'… CAA▲TTG …5'
 >>>
Hpa II HpaII
5'… C▼CGG …3'
3'… GGC▲C …5'
 >>>
HpySE526 I MaeII
5'… A▼CGT …3'
3'… TGC▲A …5'
 >>>
HspA I HhaI
5'… G▼CGC …3'
3'… CGC▲G …5'
 >>>
K к алфавиту
Kpn I KpnI
5'… GGTAC▼C …3'
3'… C▲CATGG …5'
 >>>
Kro I KroI
5'… G▼C(5mC)GGC …3'
3'… CGG(5mC)C▲G …5'
 >>>
KroN I NaeI
5'… GCC▼GGC …3'
3'… CGG▲CCG …5'
 >>>
Ksp22 I BclI
5'… T▼GATCA …3'
3'… ACTAG▲T …5'
 >>>
Kzo9 I MboI
5'… ▼GATC …3'
3'… CTAG▲ …5'
 >>>
L к алфавиту
Lmn I LmnI
5'… GCTCCN▼ …3'
3'… CGAG▲GN …5'
 >>>
M к алфавиту
Mab I SexAI
5'… A▼CCWGGT …3'
3'… TGGWCC▲A …5'
 >>>
Mal I DpnI
5'… G(mA)▼TC …3'
3'… CT▲(mA)G …5'
 >>>
Mbo II MboII
5'… GAAGA(N)8▼ …3'
3'… CTTCT(N)7▲ …5'
 >>>
Mfe I MfeI
5'… C▼AATTG …3'
3'… GTTAA▲C …5'
 >>>
Mhl I SduI
5'… GDGCH▼C …3'
3'… C▲HCGDG …5'
 >>>
Mlu I MluI
5'… A▼CGCGT …3'
3'… TGCGC▲A …5'
 >>>
Mly113 I NarI
5'… GG▼CGCC …3'
3'… CCGC▲GG …5'
 >>>
Mnl I MnlI
5'… CCTC(N)7▼ …3'
3'… GGAG(N)6▲ …5'
 >>>
Mox20 I BalI
5'… TGG▼CCA …3'
3'… ACC▲GGT …5'
 >>>
MroN I (NaeI)
5'… G▼CCGGC …3'
3'… CGGCC▲G …5'
 >>>
MroX I XmnI
5'… GAANN▼NNTTC …3'
3'… CTTNN▲NNAAG …5'
 >>>
Msp I HpaII
5'… C▼CGG …3'
3'… GGC▲C …5'
 >>>
MspA1 I NspBII
5'… CmG▼CKG …3'
3'… GKC▲GmC …5'
 >>>
MspR9 I ScrFI
5'… CC▼NGG …3'
3'… GGN▲CC …5'
 >>>
Mte I Mte
5'… G(5mC)G(5mC)▼NG(5mC)G(5mC) …3'
3'… (5mC)G(5mC)GN▲(5mC)G(5mC)G …5'
 >>>
N к алфавиту
Nru I NruI
5'… TCG▼CGA …3'
3'… AGC▲GCT …5'
 >>>
P к алфавиту
PalA I AscI
5'… GG▼CGCGCC …3'
3'… CCGCGC▲GG …5'
 >>>
Pce I StuI
5'… AGG▼CCT …3'
3'… TCC▲GGA …5'
 >>>
Pci I BspLU11I
5'… A▼CATGT …3'
3'… TGTAC▲A …5'
 >>>
PciS I SapI
5'… GCTCTTCN▼ …3'
3'… CGAGAAG(N)4▲ …5'
 >>>
Pcs I PcsI
5'… (5mC)GNNNNN▼NN(5mC)G …3'
3'… G(5mC)NN▲NNNNNG(5mC) …5'
 >>>
Pct I BsmI
5'… GAATGCN▼ …3'
3'… CTTAC▲GN …5'
 >>>
Pec I PsiI
5'… TTA▼TAA …3'
3'… AAT▲ATT …5'
 >>>
Pkr I PkrI
5'… G(5mC)N▼G(5mC) …3'
3'… (5mC)G▲N(5mC)G …5'
 >>>
Ple19 I PvuI
5'… CGAT▼CG …3'
3'… GC▲TAGC …5'
 >>>
Pps I PleI
5'… GAGTC(N)4▼ …3'
3'… CTCAG(N)5▲ …5'
 >>>
Pse31 I Eco31I
5'… GGTCTC(N)1▼ …3'
3'… CCAGAG(N)5▲ …5'
 >>>
Psi I PsiI
5'… TTA▼TAA …3'
3'… AAT▲ATT …5'
 >>>
Psp124B I SacI
5'… GAGCT▼C …3'
3'… C▲TCGAG …5'
 >>>
Psp6 I EcoRII
5'… ▼CCWGG …3'
3'… GGWCC▲ …5'
 >>>
PspC I PmaCI
5'… CAC▼GTG …3'
3'… GTG▲CAC …5'
 >>>
PspE I BstEII
5'… G▼GTNACC …3'
3'… CCANTG▲G …5'
 >>>
PspL I SplI
5'… C▼GTACG …3'
3'… GCATG▲C …5'
 >>>
PspN4 I NlaIV
5'… GGN▼NCC …3'
3'… CCN▲NGG …5'
 >>>
PspOM I (ApaI)
5'… G▼GGCCC …3'
3'… CCCGG▲G …5'
 >>>
PspPP I PpuMI
5'… RG▼GWCCY …3'
3'… YCCWG▲GR …5'
 >>>
PspX I PspXI
5'… VC▼TCGAGB …3'
3'… BGAGCT▲CV …5'
 >>>
Psr I PsrI
5'… ▼(N)7GAACNNNNNNTAC(N)12▼ …3'
3'… ▲(N)12CTTGNNNNNNATG(N)7▲ …5'
 >>>
Pst I PstI
5'… CTGCA▼G …3'
3'… G▲ACGTC …5'
 >>>
PstN I AlwNI
5'… CAGNNN▼CTG …3'
3'… GTC▲NNNGAC …5'
 >>>
Pvu II PvuII
5'… CAG▼CTG …3'
3'… GTC▲GAC …5'
 >>>
R к алфавиту
Rga I SgfI
5'… GCGAT▼CGC …3'
3'… CGC▲TAGCG …5'
 >>>
Rig I FseI
5'… GGCCGG▼CC …3'
3'… CC▲GGCCGG …5'
 >>>
Rsa I RsaI
5'… GT▼AC …3'
3'… CA▲TG …5'
 >>>
RsaN I RsaI
5'… G▼TAC …3'
3'… CAT▲G …5'
 >>>
Rsr2 I RsrII
5'… CG▼GWCCG …3'
3'… GCCWG▲GC …5'
 >>>
S к алфавиту
Sal I SalI
5'… G▼TCGAC …3'
3'… CAGCT▲G …5'
 >>>
Sbf I Sse8387I
5'… CCTGCA▼GG …3'
3'… GG▲ACGTCC …5'
 >>>
Set I SetI
5'… ASST▼ …3'
3'… ▲TSSA …5'
 >>>
SfaN I SfaNI
5'… GCATC(N)5▼ …3'
3'… CGTAG(N)9▲ …5'
 >>>
Sfi I SfiI
5'… GGCCNNNN▼NGGCC …3'
3'… CCGGN▲NNNNCCGG …5'
 >>>
Sfr274 I XhoI
5'… C▼TCGAG …3'
3'… GAGCT▲C …5'
 >>>
Sfr303 I SacII
5'… CCGC▼GG …3'
3'… GG▲CGCC …5'
 >>>
Sma I SmaI
5'… CCC▼GGG …3'
3'… GGG▲CCC …5'
 >>>
Smi I SwaI
5'… ATTT▼AAAT …3'
3'… TAAA▲TTTA …5'
 >>>
SmiM I MslI
5'… CAYNN▼NNRTG …3'
3'… GTRNN▲NNYAC …5'
 >>>
Sph I SphI
5'… GCATG▼C …3'
3'… C▲GTACG …5'
 >>>
Sse9 I Tsp509I
5'… ▼AATT …3'
3'… TTAA▲ …5'
 >>>
Ssp I SspI
5'… AAT▼ATT …3'
3'… TTA▲TAA …5'
 >>>
SspM I BfaI
5'… C▼TAG …3'
3'… GAT▲C …5'
 >>>
T к алфавиту
Taq I TaqI
5'… T▼CGA …3'
3'… AGC▲T …5'
 >>>
Tru9 I MseI
5'… T▼TAA …3'
3'… AAT▲T …5'
 >>>
TseF I Tsp45I
5'… ▼GTSAC …3'
3'… CASTG▲ …5'
 >>>
Tth111 I Tth111I
5'… GACN▼NNGTC …3'
3'… CTGNN▲NCAG …5'
 >>>
V к алфавиту
Vne I ApaLI
5'… G▼TGCAC …3'
3'… CACGT▲G …5'
 >>>
Vsp I VspI
5'… AT▼TAAT …3'
3'… TAAT▲TA …5'
 >>>
X к алфавиту
Xba I XbaI
5'… T▼CTAGA …3'
3'… AGATC▲T …5'
 >>>
Xma I XmaI
5'… C▼CCGGG …3'
3'… GGGCC▲C …5'
 >>>
Z к алфавиту
Zra I (AatII)
5'… GAC▼GTC …3'
3'… CTG▲CAG …5'
 >>>
Zrm I ScaI
5'… AGT▼ACT …3'
3'… TCA▲TGA …5'
 >>>
Zsp2 I NsiI
5'… ATGCA▼T …3'
3'… T▲ACGTA …5'
 >>>

Изошизомеры

Изошизомеры и неошизомеры

Записей: 483; групп сайтов: 144
SE-ферментСайт узнаванияИзвестные аналогиТипСайт узнавания
Aat II
5'… GACGT▼C …3'
3'… C▲TGCAG …5'
Zra I
Неошизомер
5'… GAC▼GTC …3'
3'… CTG▲CAG …5'
Acc16 I
5'… TGC▼GCA …3'
3'… ACG▲CGT …5'
AviII
FspI
MstI
NsbI
Изошизомер
5'… TGC▼GCA …3'
3'… ACG▲CGT …5'
Acc36 I
5'… ACCTGC(N)4▼ …3'
3'… TGGACG(N)8▲ …5'
BfuAI
BspMI
BveI
Изошизомер
5'… ACCTGC(N)4▼ …3'
3'… TGGACG(N)8▲ …5'
Acc65 I
5'… G▼GTACC …3'
3'… CCATG▲G …5'
Asp718I
Изошизомер
5'… G▼GTACC …3'
3'… CCATG▲G …5'
Kpn I
Неошизомер
5'… GGTAC▼C …3'
3'… C▲CATGG …5'
AccB1 I
5'… G▼GYRCC …3'
3'… CCRYG▲G …5'
BanI
BshNI
BspT107I
HgiCI
Изошизомер
5'… G▼GYRCC …3'
3'… CCRYG▲G …5'
AccB7 I
5'… CCANNNN▼NTGG …3'
3'… GGTN▲NNNNACC …5'
PflBI
PflMI
Van91I
Изошизомер
5'… CCANNNN▼NTGG …3'
3'… GGTN▲NNNNACC …5'
AccBS I
5'… GAG▼CGG …3'
3'… CTC▲GCC …5'
BsrBI
MbiI
Изошизомер
5'… GAG▼CGG …3'
3'… CTC▲GCC …5'
Acl I
5'… AA▼CGTT …3'
3'… TTGC▲AA …5'
Psp1406I
Изошизомер
5'… AA▼CGTT …3'
3'… TTGC▲AA …5'
AclW I
5'… GGATC(N)4▼ …3'
3'… CCTAG(N)5▲ …5'
AlwI
BinI
BspPI
Изошизомер
5'… GGATC(N)4▼ …3'
3'… CCTAG(N)5▲ …5'
Aco I
5'… Y▼GGCCR …3'
3'… RCCGG▲Y …5'
CfrI
EaeI
Изошизомер
5'… Y▼GGCCR …3'
3'… RCCGG▲Y …5'
Acs I
5'… R▼AATTY …3'
3'… YTTAA▲R …5'
ApoI
XapI
Изошизомер
5'… R▼AATTY …3'
3'… YTTAA▲R …5'
Acu I
5'… CTGAAG(N)16▼ …3'
3'… GACTTC(N)14▲ …5'
Eco57I
Изошизомер
5'… CTGAAG(N)16▼ …3'
3'… GACTTC(N)14▲ …5'
Afe I
5'… AGC▼GCT …3'
3'… TCG▲CGA …5'
Aor51HI
Eco47III
FunI
Изошизомер
5'… AGC▼GCT …3'
3'… TCG▲CGA …5'
Ahl I
5'… A▼CTAGT …3'
3'… TGATC▲A …5'
BcuI
SpeI
Изошизомер
5'… A▼CTAGT …3'
3'… TGATC▲A …5'
Ajn I
Psp6 I
5'… ▼CCWGG …3'
3'… GGWCC▲ …5'
EcoRII
PspGI
Изошизомер
5'… ▼CCWGG …3'
3'… GGWCC▲ …5'
BptI
BseBI
Bst2U I
BstNI
BstOI
MvaI
Неошизомер
5'… CC▼WGG …3'
3'… GGW▲CC …5'
Ama87 I
5'… C▼YCGRG …3'
3'… GRGCY▲C …5'
AvaI
BsiHKCI
BsoBI
Eco88I
NspIII
Изошизомер
5'… C▼YCGRG …3'
3'… GRGCY▲C …5'
Apa I
5'… GGGCC▼C …3'
3'… C▲CCGGG …5'
Bsp120I
PspOM I
Неошизомер
5'… G▼GGCCC …3'
3'… CCCGG▲G …5'
AsiG I
5'… A▼CCGGT …3'
3'… TGGCC▲A …5'
AgeI
BshTI
CspAI
PinAI
Изошизомер
5'… A▼CCGGT …3'
3'… TGGCC▲A …5'
AsiS I
Rga I
5'… GCGAT▼CGC …3'
3'… CGC▲TAGCG …5'
SgfI
Изошизомер
5'… GCGAT▼CGC …3'
3'… CGC▲TAGCG …5'
AspA2 I
5'… C▼CTAGG …3'
3'… GGATC▲C …5'
AvrII
BlnI
XmaJI
Изошизомер
5'… C▼CTAGG …3'
3'… GGATC▲C …5'
AspLE I
BstHH I
5'… GCG▼C …3'
3'… C▲GCG …5'
CfoI
HhaI
Изошизомер
5'… GCG▼C …3'
3'… C▲GCG …5'
Hin6I
HinP1I
HspA I
Неошизомер
5'… G▼CGC …3'
3'… CGC▲G …5'
AspS9 I
5'… G▼GNCC …3'
3'… CCNG▲G …5'
AsuI
Cfr13I
PspPI
Sau96I
Изошизомер
5'… G▼GNCC …3'
3'… CCNG▲G …5'
AsuC2 I
5'… CC▼SGG …3'
3'… GGS▲CC …5'
BcnI
CauII
NciI
Изошизомер
5'… CC▼SGG …3'
3'… GGS▲CC …5'
AsuHP I
5'… GGTGA(N)8▼ …3'
3'… CCACT(N)7▲ …5'
HphI
Изошизомер
5'… GGTGA(N)8▼ …3'
3'… CCACT(N)7▲ …5'
AsuNH I
5'… G▼CTAGC …3'
3'… CGATC▲G …5'
NheI
Изошизомер
5'… G▼CTAGC …3'
3'… CGATC▲G …5'
Bmt I
Неошизомер
5'… GCTAG▼C …3'
3'… C▲GATCG …5'
Bbv12 I
5'… GWGCW▼C …3'
3'… C▲WCGWG …5'
Alw21I
BsiHKAI
HgiAI
Изошизомер
5'… GWGCW▼C …3'
3'… C▲WCGWG …5'
Bme18 I
5'… G▼GWCC …3'
3'… CCWG▲G …5'
AvaII
Eco47I
SinI
VpaK11BI
Изошизомер
5'… G▼GWCC …3'
3'… CCWG▲G …5'
Bmu I
5'… ACTGGG(N)5▼ …3'
3'… TGACCC(N)4▲ …5'
BfiI
BmrI
Изошизомер
5'… ACTGGG(N)5▼ …3'
3'… TGACCC(N)4▲ …5'
Bpm I
5'… CTGGAG(N)16▼ …3'
3'… GACCTC(N)14▲ …5'
GsuI
Изошизомер
5'… CTGGAG(N)16▼ …3'
3'… GACCTC(N)14▲ …5'
Bpu14 I
5'… TT▼CGAA …3'
3'… AAGC▲TT …5'
AsuII
Bsp119I
BspT104I
BstBI
Csp45I
NspV
SfuI
Изошизомер
5'… TT▼CGAA …3'
3'… AAGC▲TT …5'
Bsa29 I
5'… AT▼CGAT …3'
3'… TAGC▲TA …5'
BanIII
BseCI
BspDI
BspXI
Bsu15I
BsuTUI
ClaI
ZhoI
Изошизомер
5'… AT▼CGAT …3'
3'… TAGC▲TA …5'
Bsc4 I
5'… CCNNNNN▼NNGG …3'
3'… GGNN▲NNNNNCC …5'
BseLI
BsiYI
BslI
Изошизомер
5'… CCNNNNN▼NNGG …3'
3'… GGNN▲NNNNNCC …5'
Bse1 I
5'… ACTGGN▼ …3'
3'… TGAC▲CN …5'
BseNI
BsrI
BsrSI
Изошизомер
5'… ACTGGN▼ …3'
3'… TGAC▲CN …5'
Bse3D I
5'… GCAATGNN▼ …3'
3'… CGTTAC▲NN …5'
BseMI
BsrDI
Изошизомер
5'… GCAATGNN▼ …3'
3'… CGTTAC▲NN …5'
Bse8 I
5'… GATNN▼NNATC …3'
3'… CTANN▲NNTAG …5'
BsaBI
BseJI
MamI
Изошизомер
5'… GATNN▼NNATC …3'
3'… CTANN▲NNTAG …5'
Bse21 I
5'… CC▼TNAGG …3'
3'… GGANT▲CC …5'
AxyI
Bsu36I
Eco81I
SauI
Изошизомер
5'… CC▼TNAGG …3'
3'… GGANT▲CC …5'
Bse118 I
5'… R▼CCGGY …3'
3'… YGGCC▲R …5'
BsrFI
BssAI
Cfr10I
Изошизомер
5'… R▼CCGGY …3'
3'… YGGCC▲R …5'
BseP I
5'… G▼CGCGC …3'
3'… CGCGC▲G …5'
BssHII
PauI
Изошизомер
5'… G▼CGCGC …3'
3'… CGCGC▲G …5'
BseX3 I
5'… C▼GGCCG …3'
3'… GCCGG▲C …5'
BstZI
EagI
EclXI
Eco52I
XmaIII
Изошизомер
5'… C▼GGCCG …3'
3'… GCCGG▲C …5'
BslF I
5'… GGGAC(N)10▼ …3'
3'… CCCTG(N)14▲ …5'
BsmFI
FaqI
Изошизомер
5'… GGGAC(N)10▼ …3'
3'… CCCTG(N)14▲ …5'
Bso31 I
5'… GGTCTCN▼ …3'
3'… CCAGAG(N)5▲ …5'
BsaI
BspTNI
Eco31I
Изошизомер
5'… GGTCTCN▼ …3'
3'… CCAGAG(N)5▲ …5'
Bsp13 I
5'… T▼CCGGA …3'
3'… AGGCC▲T …5'
AccIII
Aor13HI
BlfI
BseAI
BspEI
BspMII
Kpn2I
MroI
Изошизомер
5'… T▼CCGGA …3'
3'… AGGCC▲T …5'
Bsp19 I
5'… C▼CATGG …3'
3'… GGTAC▲C …5'
NcoI
Изошизомер
5'… C▼CATGG …3'
3'… GGTAC▲C …5'
Bsp1720 I
5'… GC▼TNAGC …3'
3'… CGANT▲CG …5'
BlpI
Bpu1102I
CelII
EspI
Изошизомер
5'… GC▼TNAGC …3'
3'… CGANT▲CG …5'
BspAC I
5'… C▼CGC …3'
3'… GGC▲G …5'
AciI
SsiI
Изошизомер
5'… C▼CGC …3'
3'… GGC▲G …5'
BssEC I
5'… C▼CNNGG …3'
3'… GGNNC▲C …5'
BsaJI
BseDI
SecI
Изошизомер
5'… C▼CNNGG …3'
3'… GGNNC▲C …5'
BssNA I
5'… GTA▼TAC …3'
3'… CAT▲ATG …5'
Bst1107I
BstZ17I
Изошизомер
5'… GTA▼TAC …3'
3'… CAT▲ATG …5'
BssT1 I
Erh I
5'… C▼CWWGG …3'
3'… GGWWC▲C …5'
Eco130I
EcoT14I
StyI
Изошизомер
5'… C▼CWWGG …3'
3'… GGWWC▲C …5'
Bst2B I
5'… C▼TCGTG …3'
3'… GAGCA▲C …5'
BauI
BsiI
BssSI
Изошизомер
5'… C▼TCGTG …3'
3'… GAGCA▲C …5'
Bst4C I
5'… ACN▼GT …3'
3'… TG▲NCA …5'
HpyCH4III
TaaI
Tsp4CI
Изошизомер
5'… ACN▼GT …3'
3'… TG▲NCA …5'
Bst6 I
5'… CTCTTCN▼ …3'
3'… GAGAAG(N)4▲ …5'
Eam1104I
EarI
Ksp632I
Изошизомер
5'… CTCTTCN▼ …3'
3'… GAGAAG(N)4▲ …5'
BstAC I
5'… GR▼CGYC …3'
3'… CYGC▲RG …5'
AcyI
BsaHI
Hin1I
Hsp92I
Изошизомер
5'… GR▼CGYC …3'
3'… CYGC▲RG …5'
BstAF I
5'… C▼TTAAG …3'
3'… GAATT▲C …5'
AflII
BfrI
BspTI
Bst98I
MspCI
Изошизомер
5'… C▼TTAAG …3'
3'… GAATT▲C …5'
BstAP I
5'… GCANNNN▼NTGC …3'
3'… CGTN▲NNNNACG …5'
ApaBI
Неошизомер
5'… GCANNNNN▼TGC …3'
3'… CGT▲NNNNNACG …5'
BstAU I
5'… T▼GTACA …3'
3'… ACATG▲T …5'
Bsp1407I
BsrGI
SspBI
Изошизомер
5'… T▼GTACA …3'
3'… ACATG▲T …5'
BstBA I
5'… YAC▼GTR …3'
3'… RTG▲CAY …5'
BsaAI
Изошизомер
5'… YAC▼GTR …3'
3'… RTG▲CAY …5'
BstC8 I
5'… GCN▼NGC …3'
3'… CGN▲NCG …5'
Cac8I
Изошизомер
5'… GCN▼NGC …3'
3'… CGN▲NCG …5'
BstDE I
5'… C▼TNAG …3'
3'… GANT▲C …5'
DdeI
HpyF3I
Изошизомер
5'… C▼TNAG …3'
3'… GANT▲C …5'
BstDS I
5'… C▼CRYGG …3'
3'… GGYRC▲C …5'
BtgI
DsaI
Изошизомер
5'… C▼CRYGG …3'
3'… GGYRC▲C …5'
BstEN I
5'… CCTNN▼NNNAGG …3'
3'… GGANNN▲NNTCC …5'
EcoNI
XagI
Изошизомер
5'… CCTNN▼NNNAGG …3'
3'… GGANNN▲NNTCC …5'
BstF5 I
5'… GGATGNN▼ …3'
3'… CCTAC▲NN …5'
BseGI
Изошизомер
5'… GGATGNN▼ …3'
3'… CCTAC▲NN …5'
Fok I
Неошизомер
5'… GGATG(N)9▼ …3'
3'… CCTAC(N)13▲ …5'
BstFN I
5'… CG▼CG …3'
3'… GC▲GC …5'
AccII
Bsh1236I
BstUI
FnuDII
MvnI
Изошизомер
5'… CG▼CG …3'
3'… GC▲GC …5'
BstH2 I
5'… RGCGC▼Y …3'
3'… Y▲CGCGR …5'
Bsp143II
HaeII
Изошизомер
5'… RGCGC▼Y …3'
3'… Y▲CGCGR …5'
BstKT I
5'… GAT▼C …3'
3'… C▲TAG …5'
BfuCI
Bsp143I
BstMB I
DpnII
Kzo9 I
MboI
NdeII
Sau3AI
Неошизомер
5'… ▼GATC …3'
3'… CTAG▲ …5'
Mal I
5'… G(mA)▼TC …3'
3'… CT▲(mA)G …5'
DpnI
Изошизомер
5'… G(mA)▼TC …3'
3'… CT▲(mA)G …5'
BstMA I
5'… GTCTCN▼ …3'
3'… CAGAG(N)5▲ …5'
Alw26I
BsmAI
Изошизомер
5'… GTCTCN▼ …3'
3'… CAGAG(N)5▲ …5'
BstMC I
5'… CGRY▼CG …3'
3'… GC▲YRGC …5'
Bsh1285I
BsiEI
McrI
Изошизомер
5'… CGRY▼CG …3'
3'… GC▲YRGC …5'
BstMW I
5'… GCNNNNN▼NNGC …3'
3'… CGNN▲NNNNNCG …5'
HpyF10VI
MwoI
Изошизомер
5'… GCNNNNN▼NNGC …3'
3'… CGNN▲NNNNNCG …5'
BstNS I
5'… RCATG▼Y …3'
3'… Y▲GTACR …5'
NspI
XceI
Изошизомер
5'… RCATG▼Y …3'
3'… Y▲GTACR …5'
BstPA I
5'… GACNN▼NNGTC …3'
3'… CTGNN▲NNCAG …5'
BoxI
PshAI
Изошизомер
5'… GACNN▼NNGTC …3'
3'… CTGNN▲NNCAG …5'
BstSC I
5'… ▼CCNGG …3'
3'… GGNCC▲ …5'
BssKI
StyD4I
Изошизомер
5'… ▼CCNGG …3'
3'… GGNCC▲ …5'
Bme1390I
MspR9 I
ScrFI
Неошизомер
5'… CC▼NGG …3'
3'… GGN▲CC …5'
BstSF I
5'… C▼TRYAG …3'
3'… GAYRT▲C …5'
BfmI
BpcI
SfcI
SfeI
Изошизомер
5'… C▼TRYAG …3'
3'… GAYRT▲C …5'
BstSN I
5'… TAC▼GTA …3'
3'… ATG▲CAT …5'
Eco105I
SnaBI
Изошизомер
5'… TAC▼GTA …3'
3'… ATG▲CAT …5'
BstV1 I
5'… GCAGC(N)8▼ …3'
3'… CGTCG(N)12▲ …5'
BbvI
BseXI
Изошизомер
5'… GCAGC(N)8▼ …3'
3'… CGTCG(N)12▲ …5'
BstV2 I
5'… GAAGAC(N)2▼ …3'
3'… CTTCTG(N)6▲ …5'
BbsI
BbvII
BpiI
BpuAI
Изошизомер
5'… GAAGAC(N)2▼ …3'
3'… CTTCTG(N)6▲ …5'
BstX2 I
5'… R▼GATCY …3'
3'… YCTAG▲R …5'
BstYI
MflI
PsuI
XhoII
Изошизомер
5'… R▼GATCY …3'
3'… YCTAG▲R …5'
Bsu I
5'… GTATCC(N)6▼ …3'
3'… CATAGG(N)5▲ …5'
BciVI
Изошизомер
5'… GTATCC(N)6▼ …3'
3'… CATAGG(N)5▲ …5'
BsuR I
Hae III
5'… GG▼CC …3'
3'… CC▲GG …5'
BshFI
BspANI
PhoI
Изошизомер
5'… GG▼CC …3'
3'… CC▲GG …5'
Btr I
5'… CAC▼GTC …3'
3'… GTG▲CAG …5'
BmgBI
Изошизомер
5'… CAC▼GTC …3'
3'… GTG▲CAG …5'
CciN I
5'… GC▼GGCCGC …3'
3'… CGCCGG▲CG …5'
NotI
Изошизомер
5'… GC▼GGCCGC …3'
3'… CGCCGG▲CG …5'
Dra I
5'… TTT▼AAA …3'
3'… AAA▲TTT …5'
AhaIII
Изошизомер
5'… TTT▼AAA …3'
3'… AAA▲TTT …5'
Dra III
5'… CACNNN▼GTG …3'
3'… GTG▲NNNCAC …5'
AdeI
Изошизомер
5'… CACNNN▼GTG …3'
3'… GTG▲NNNCAC …5'
Dri I
5'… GACNNN▼NNGTC …3'
3'… CTGNN▲NNNCAG …5'
AhdI
AspEI
Eam1105I
EclHKI
Изошизомер
5'… GACNNN▼NNGTC …3'
3'… CTGNN▲NNNCAG …5'
DseD I
5'… GACNNNN▼NNGTC …3'
3'… CTGNN▲NNNNCAG …5'
AasI
DrdI
Изошизомер
5'… GACNNNN▼NNGTC …3'
3'… CTGNN▲NNNNCAG …5'
EcoICR I
5'… GAG▼CTC …3'
3'… CTC▲GAG …5'
Ecl136II
Изошизомер
5'… GAG▼CTC …3'
3'… CTC▲GAG …5'
Psp124B I
SacI
SstI
Неошизомер
5'… GAGCT▼C …3'
3'… C▲TCGAG …5'
EcoR I
5'… G▼AATTC …3'
3'… CTTAA▲G …5'
FunII
Изошизомер
5'… G▼AATTC …3'
3'… CTTAA▲G …5'
EcoR V
5'… GAT▼ATC …3'
3'… CTA▲TAG …5'
Eco32I
Изошизомер
5'… GAT▼ATC …3'
3'… CTA▲TAG …5'
Ege I
5'… GGC▼GCC …3'
3'… CCG▲CGG …5'
EheI
SfoI
Изошизомер
5'… GGC▼GCC …3'
3'… CCG▲CGG …5'
BbeI
Неошизомер
5'… GGCGC▼C …3'
3'… C▲CGCGG …5'
KasI
Неошизомер
5'… G▼GCGCC …3'
3'… CCGCG▲G …5'
Mly113 I
NarI
Неошизомер
5'… GG▼CGCC …3'
3'… CCGC▲GG …5'
Fae I
5'… CATG▼ …3'
3'… ▲GTAC …5'
Hin1II
Hsp92II
NlaIII
Изошизомер
5'… CATG▼ …3'
3'… ▲GTAC …5'
CviAII
Неошизомер
5'… C▼ATG …3'
3'… GTA▲C …5'
Fat I
Неошизомер
5'… ▼CATG …3'
3'… GTAC▲ …5'
Fau I
5'… CCCGC(N)4▼ …3'
3'… GGGCG(N)6▲ …5'
SmuI
Изошизомер
5'… CCCGC(N)4▼ …3'
3'… GGGCG(N)6▲ …5'
FauND I
5'… CA▼TATG …3'
3'… GTAT▲AC …5'
NdeI
Изошизомер
5'… CA▼TATG …3'
3'… GTAT▲AC …5'
Fbl I
5'… GT▼mKAC …3'
3'… CAKm▲TG …5'
AccI
XmiI
Изошизомер
5'… GT▼mKAC …3'
3'… CAKm▲TG …5'
BstF5 I
5'… GGATGNN▼ …3'
3'… CCTAC▲NN …5'
Fok I
Неошизомер
5'… GGATG(N)9▼ …3'
3'… CCTAC(N)13▲ …5'
BseGI
Неошизомер
5'… GGATGNN▼ …3'
3'… CCTAC▲NN …5'
FriO I
5'… GRGCY▼C …3'
3'… C▲YCGRG …5'
BanII
Eco24I
EcoT38I
HgiJII
Изошизомер
5'… GRGCY▼C …3'
3'… C▲YCGRG …5'
Fsp4H I
5'… GC▼NGC …3'
3'… CGN▲CG …5'
Fnu4HI
ItaI
SatI
Изошизомер
5'… GC▼NGC …3'
3'… CGN▲CG …5'
Hga I
5'… GACGC(N)5▼ …3'
3'… CTGCG(N)10▲ …5'
CseI
Изошизомер
5'… GACGC(N)5▼ …3'
3'… CTGCG(N)10▲ …5'
Hind II
5'… GTY▼RAC …3'
3'… CAR▲YTG …5'
HincII
Изошизомер
5'… GTY▼RAC …3'
3'… CAR▲YTG …5'
Hpa I
5'… GTT▼AAC …3'
3'… CAA▲TTG …5'
KspAI
Изошизомер
5'… GTT▼AAC …3'
3'… CAA▲TTG …5'
Hpa II
Msp I
5'… C▼CGG …3'
3'… GGC▲C …5'
BsiSI
HapII
Изошизомер
5'… C▼CGG …3'
3'… GGC▲C …5'
HpySE526 I
5'… A▼CGT …3'
3'… TGC▲A …5'
MaeII
Изошизомер
5'… A▼CGT …3'
3'… TGC▲A …5'
Ksp22 I
5'… T▼GATCA …3'
3'… ACTAG▲T …5'
BclI
FbaI
Изошизомер
5'… T▼GATCA …3'
3'… ACTAG▲T …5'
Mab I
5'… A▼CCWGGT …3'
3'… TGGWCC▲A …5'
SexAI
Изошизомер
5'… A▼CCWGGT …3'
3'… TGGWCC▲A …5'
Mfe I
5'… C▼AATTG …3'
3'… GTTAA▲C …5'
MunI
Изошизомер
5'… C▼AATTG …3'
3'… GTTAA▲C …5'
Mhl I
5'… GDGCH▼C …3'
3'… C▲HCGDG …5'
Bsp1286I
SduI
Изошизомер
5'… GDGCH▼C …3'
3'… C▲HCGDG …5'
Mox20 I
5'… TGG▼CCA …3'
3'… ACC▲GGT …5'
BalI
MlsI
MluNI
MscI
Msp20I
Изошизомер
5'… TGG▼CCA …3'
3'… ACC▲GGT …5'
MroN I
5'… G▼CCGGC …3'
3'… CGGCC▲G …5'
NgoMIV
Изошизомер
5'… G▼CCGGC …3'
3'… CGGCC▲G …5'
NaeI
Неошизомер
5'… GCC▼GGC …3'
3'… CGG▲CCG …5'
PdiI
Неошизомер
5'… GCC▼GGC …3'
3'… CGG▲CCG …5'
MroX I
5'… GAANN▼NNTTC …3'
3'… CTTNN▲NNAAG …5'
Asp700I
PdmI
XmnI
Изошизомер
5'… GAANN▼NNTTC …3'
3'… CTTNN▲NNAAG …5'
MspA1 I
5'… CmG▼CKG …3'
3'… GKC▲GmC …5'
NspBII
Изошизомер
5'… CmG▼CKG …3'
3'… GKC▲GmC …5'
Nru I
5'… TCG▼CGA …3'
3'… AGC▲GCT …5'
Bsp68I
Изошизомер
5'… TCG▼CGA …3'
3'… AGC▲GCT …5'
PalA I
5'… GG▼CGCGCC …3'
3'… CCGCGC▲GG …5'
AscI
AsoI
SgsI
Изошизомер
5'… GG▼CGCGCC …3'
3'… CCGCGC▲GG …5'
Pce I
5'… AGG▼CCT …3'
3'… TCC▲GGA …5'
AatI
Eco147I
SseBI
StuI
Изошизомер
5'… AGG▼CCT …3'
3'… TCC▲GGA …5'
Pci I
5'… A▼CATGT …3'
3'… TGTAC▲A …5'
BspLU11I
PscI
Изошизомер
5'… A▼CATGT …3'
3'… TGTAC▲A …5'
PciS I
5'… GCTCTTCN▼ …3'
3'… CGAGAAG(N)4▲ …5'
LguI
SapI
Изошизомер
5'… GCTCTTCN▼ …3'
3'… CGAGAAG(N)4▲ …5'
Pct I
5'… GAATGCN▼ …3'
3'… CTTAC▲GN …5'
BsaMI
BsmI
Mva1269I
Изошизомер
5'… GAATGCN▼ …3'
3'… CTTAC▲GN …5'
Ple19 I
5'… CGAT▼CG …3'
3'… GC▲TAGC …5'
MvrI
PvuI
Изошизомер
5'… CGAT▼CG …3'
3'… GC▲TAGC …5'
Pps I
5'… GAGTC(N)4▼ …3'
3'… CTCAG(N)5▲ …5'
PleI
Изошизомер
5'… GAGTC(N)4▼ …3'
3'… CTCAG(N)5▲ …5'
MlyI
Неошизомер
5'… GAGTC(N)5▼ …3'
3'… CTCAG(N)5▲ …5'
SchI
Неошизомер
5'… GAGTC(N)5▼ …3'
3'… CTCAG(N)5▲ …5'
Pse31 I
5'… GGTCTC(N)1▼ …3'
3'… CCAGAG(N)5▲ …5'
Eco31I
Изошизомер
5'… GGTCTC(N)1▼ …3'
3'… CCAGAG(N)5▲ …5'
PspC I
5'… CAC▼GTG …3'
3'… GTG▲CAC …5'
AcvI
BbrPI
Eco72I
PmaCI
PmlI
Изошизомер
5'… CAC▼GTG …3'
3'… GTG▲CAC …5'
PspE I
5'… G▼GTNACC …3'
3'… CCANTG▲G …5'
BstEII
BstPI
Eco91I
EcoO65I
Изошизомер
5'… G▼GTNACC …3'
3'… CCANTG▲G …5'
PspL I
5'… C▼GTACG …3'
3'… GCATG▲C …5'
BsiWI
Pfl23II
SplI
SunI
Изошизомер
5'… C▼GTACG …3'
3'… GCATG▲C …5'
PspN4 I
5'… GGN▼NCC …3'
3'… CCN▲NGG …5'
BspLI
NlaIV
Изошизомер
5'… GGN▼NCC …3'
3'… CCN▲NGG …5'
PspPP I
5'… RG▼GWCCY …3'
3'… YCCWG▲GR …5'
PpuMI
PpuXI
Psp5II
Изошизомер
5'… RG▼GWCCY …3'
3'… YCCWG▲GR …5'
Pst I
5'… CTGCA▼G …3'
3'… G▲ACGTC …5'
BspMAI
Изошизомер
5'… CTGCA▼G …3'
3'… G▲ACGTC …5'
PstN I
5'… CAGNNN▼CTG …3'
3'… GTC▲NNNGAC …5'
AlwNI
Изошизомер
5'… CAGNNN▼CTG …3'
3'… GTC▲NNNGAC …5'
Rig I
5'… GGCCGG▼CC …3'
3'… CC▲GGCCGG …5'
FseI
Изошизомер
5'… GGCCGG▼CC …3'
3'… CC▲GGCCGG …5'
Rsa I
5'… GT▼AC …3'
3'… CA▲TG …5'
AfaI
Изошизомер
5'… GT▼AC …3'
3'… CA▲TG …5'
Csp6I
Неошизомер
5'… G▼TAC …3'
3'… CAT▲G …5'
Rsr2 I
5'… CG▼GWCCG …3'
3'… GCCWG▲GC …5'
CpoI
CspI
RsrII
Изошизомер
5'… CG▼GWCCG …3'
3'… GCCWG▲GC …5'
Sbf I
5'… CCTGCA▼GG …3'
3'… GG▲ACGTCC …5'
SdaI
Sse8387I
Изошизомер
5'… CCTGCA▼GG …3'
3'… GG▲ACGTCC …5'
SfaN I
5'… GCATC(N)5▼ …3'
3'… CGTAG(N)9▲ …5'
LweI
Изошизомер
5'… GCATC(N)5▼ …3'
3'… CGTAG(N)9▲ …5'
Sfr274 I
5'… C▼TCGAG …3'
3'… GAGCT▲C …5'
BssHI
PaeR7I
SlaI
StrI
TliI
XhoI
Изошизомер
5'… C▼TCGAG …3'
3'… GAGCT▲C …5'
Sfr303 I
5'… CCGC▼GG …3'
3'… GG▲CGCC …5'
Cfr42I
KspI
SacII
SgrBI
SstII
Изошизомер
5'… CCGC▼GG …3'
3'… GG▲CGCC …5'
Sma I
5'… CCC▼GGG …3'
3'… GGG▲CCC …5'
Cfr9I
XmaCI
Xma I
Неошизомер
5'… C▼CCGGG …3'
3'… GGGCC▲C …5'
Smi I
5'… ATTT▼AAAT …3'
3'… TAAA▲TTTA …5'
SwaI
Изошизомер
5'… ATTT▼AAAT …3'
3'… TAAA▲TTTA …5'
SmiM I
5'… CAYNN▼NNRTG …3'
3'… GTRNN▲NNYAC …5'
MslI
Изошизомер
5'… CAYNN▼NNRTG …3'
3'… GTRNN▲NNYAC …5'
Sph I
5'… GCATG▼C …3'
3'… C▲GTACG …5'
BbuI
PaeI
SpaHI
Изошизомер
5'… GCATG▼C …3'
3'… C▲GTACG …5'
Sse9 I
5'… ▼AATT …3'
3'… TTAA▲ …5'
TasI
Tsp509I
TspEI
Изошизомер
5'… ▼AATT …3'
3'… TTAA▲ …5'
SspM I
5'… C▼TAG …3'
3'… GAT▲C …5'
MaeI
Изошизомер
5'… C▼TAG …3'
3'… GAT▲C …5'
Tru9 I
5'… T▼TAA …3'
3'… AAT▲T …5'
MseI
Tru1I
Изошизомер
5'… T▼TAA …3'
3'… AAT▲T …5'
TseF I
5'… ▼GTSAC …3'
3'… CASTG▲ …5'
Tsp45I
Изошизомер
5'… ▼GTSAC …3'
3'… CASTG▲ …5'
Tth111 I
5'… GACN▼NNGTC …3'
3'… CTGNN▲NCAG …5'
AspI
PflFI
PsyI
TelI
Изошизомер
5'… GACN▼NNGTC …3'
3'… CTGNN▲NCAG …5'
Vne I
5'… G▼TGCAC …3'
3'… CACGT▲G …5'
Alw44I
ApaLI
Изошизомер
5'… G▼TGCAC …3'
3'… CACGT▲G …5'
Vsp I
5'… AT▼TAAT …3'
3'… TAAT▲TA …5'
AseI
PshBI
Изошизомер
5'… AT▼TAAT …3'
3'… TAAT▲TA …5'
Zrm I
5'… AGT▼ACT …3'
3'… TCA▲TGA …5'
AssI
ScaI
Изошизомер
5'… AGT▼ACT …3'
3'… TCA▲TGA …5'
Zsp2 I
5'… ATGCA▼T …3'
3'… T▲ACGTA …5'
EcoT22I
Mph1103I
NsiI
Изошизомер
5'… ATGCA▼T …3'
3'… T▲ACGTA …5'
BfrBI
Неошизомер
5'… ATGCA▼T …3'
3'… T▲ACGTA …5'

Активность в буферах

Gla I

Название фермента Gla I
Прототип GlaI
Артикул SE-E493
Вариант Turbo Отсутствует
Высококонцентрированная версия Отсутствует
Тип рестриктазы Тип IIMiФерменты типа IIM требуют модифицированный, обычно метилированный, сайт узнавания для разрезания., Тип IIPiФерменты типа IIP — классические рестриктазы типа II с палиндромными сайтами узнавания и симметричными сайтами разрезания.
Сайт узнавания
5'… R(5mC)▼GY …3'
3'… YG▲(5mC)R …5'
Источник Из штамма E.coli, несущего клонированный ген Gla I из Glacial ice bacterium Gl29
Оптимальный буфер SE-буфер Y (33 mM Tris-ацетат (pH 7.9 при 25°C); 10 mM магний-ацетат; 66 mM калий-ацетат; 1 mM DTT.)
Оптимальная температура 30 °C
Температура инактивации 65 °C
Активность в буферах
BGOWYROSE
75752525100100
Определение единицы активности За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для полного гидролиза 1 мкг плазмиды pHspAI2/GsaI по единственному сайту 5`-G(5mC)G(5mC)-3`/3`-(5mC)G(5mC)G-5` за 1 час при 30°С в 50 мкл реакционной смеси. При этом происходит исчезновение исходной линейной формы плазмиды pHspAI2/GsaI и образование двух основных (3,419 и 699 п.н.) фрагментов ДНК (см. рисунок ниже, дор. 3-5). Появление дополнительных продуктов гидролиза (см. рисунок ниже, дор. 6) является результатом последующего расщепления ДНК по сайтам 5`-GCGC-3`/3`-CGCG-5`, имеющим три и два 5-метилцитозина. Определение активности GlaI В каждом случае проводилась инкубация фермента с 1 мкг ДНК pHspAI2/GsaI в 50 мкл реакционной смеси (см. Единица активности). После инкубации аликвота реакционной смеси 15 мкл наносилась на гель. Дорожки: 2 - Контрольная ДНК pHspAI2/GsaI, 3 - 0.5 мкл GlaI (разб. 1/100), 4 - 1 мкл GlaI (разб. 1/100), 5 - 2 мкл GlaI (разб. 1/100), 6 - 1 мкл неразбавленного фермента GlaI, 1 и 7- 1 Kb SE ДНК-маркеры. Продукты разделены в 1%-ном агарозном геле в буфере TAE. Продукты разделены в 1%-ном агарозном геле в буфере TAE. В присутствии 20% DMSO активность фермента значительно возрастает по всем сайтам без потери специфичности
Определение активности GlaI
В каждом случае проводилась инкубация фермента с 1 мкг ДНК pHspAI2/GsaI в 50 мкл реакционной смеси (см. Единица активности). После инкубации аликвота реакционной смеси 15 мкл наносилась на гель.

Дорожки:
2 - Контрольная ДНК pHspAI2/GsaI,
3 - 0.5 мкл GlaI (разб. 1/100),
4 - 1 мкл GlaI (разб. 1/100),
5 - 2 мкл GlaI (разб. 1/100),
6 - 1 мкл неразбавленного фермента GlaI,
1 и 7 - 1 Kb SE ДНК-маркеры.

Продукты разделены в 1%-ном агарозном геле в буфере TAE.

В присутствии 20% DMSO активность фермента значительно возрастает по всем сайтам без потери специфичности
Gla I
Субстрат для определения активности Субстрат pHspAI2/GsaI представляет собой ДНК плазмиды pHspAI2, [modal_dna seq="phspai2.txt" title="Быстрый просмотр"] линеаризованной эндонуклеазой рестрикции GsaI. Плазмида pHspAI2 содержит фрагмент геномной ДНК бактериального штамма Haemophilus species A1, включающий ген ДНК-метилтрансферазы M.HspAI, и единственный канонический сайт узнавания GlaI 5`-G(5mC)G(5mC)-3`/3`-(5mC)G(5mC)G-5` [2].
Условия хранения 10 mM Tris-HCl (pH 7.6); 250 mM NaCl; 0.1 mM EDTA; 7 mM 2-меркаптоэтанол; 0,1% Triton X-100, 50 мкг/мл BSA, 50% глицерин. Хранить при -20°С.
Лигирование
Неспецифический гидролиз Не наблюдается неспецифического гидролиза при инкубации 100 ед фермента Gla I с 1 мкг ДНК фага лямбда в течение 16 часов при 30°С в 50 мкл реакционной смеси.
Чувствительность к метилированию Фермент расщепляет только С5-метилированную ДНК. Не расщепляет ДНК, содержащую N4-метилцитозин [1].
С ферментом поставляется 10 Х SE-буфер Y, плазмида pHspAI2/GsaI.
Примечания
Литература
  3. Сторонняя публикация Qiaomin Wu, Yang Yu, Mengqi Chen, Jinyan Long, Xiaolan Yang A label-free fluorescence sensing strategy based on GlaI-assisted EXPAR for rapid and accurate quantification of human methyltranferase activity // Talanta, 269, 125456 (2024)
  4. Сторонняя публикация Xu, G., Yang, H., Qiu, J. et al. Sequence terminus dependent PCR for site-specific mutation and modification detection. // Nature Communications 14, 1169 (2023)
  6. Сторонняя публикация Zhou S, Sun H, Huo D, Wang X, Qi N, Peng L, Yang M, Lu P, Hou C. A novel methyl-dependent DNA endonuclease GlaI coupling with double cascaded strand displacement amplification and CRISPR/Cas12a for ultra-sensitive detection of DNA methylation. // Analytica Chimica Acta, Volume 1212, 15 June 2022
  7. Сторонняя публикация Dong N, Wang W, Qin Y, Wang Y, Shan H. Sensitive lateral flow assay for bisulfite-free DNA methylation detection based on the restriction endonuclease GlaI and rolling circle amplification // Analytica Chimica Acta, Volume 1227, 22 September 2022
  9. А.Г. Акишев, Н.А. Нетесова, М.А. Абдурашитов, И.В. Вихлянов, М.К. Никитин, А.Б. Карпов, С.Х. Дегтярев Оценка риска возникновения рака молочной железы и рака желудка путем определения вариантов полиморфизма 5mC/T в интроне гена KIF26B в положении хр1: 245618129 // Эпигенетическая ДНК диагностика, DOI: 10.26213/SE.2019.78.40307 (2021).
  12. Б.С. Малышев, Н.А. Нетесова, Н.А. Сметанникова, М.А. Абдурашитов, А.Г. Акишев, Е.В. Дубинин, А.З. Азанов, И.В. Вихлянов, М.К. Никитин, А.Б. Карпов, С.Х. Дегтярев GlaD-ПЦР-анализ сайтов метилирования ДНК в регуляторных областях генов-онкосупрессоров при раке желудка // Acta Naturae, 2020, том 12, № 3(46): 124-133 (2020).
  13. Сторонняя публикация Petrova, D. V., Naumenko, M. B., Khantakova, D. V., Grin, I. R. & Zharkov, D. O. Relative Efficiency of Recognition of 5-Methylcytosine and 5-Hydroxymethylcytosine by Methyl-Dependent DNA Endonuclease GlaI // Russian Journal of Bioorganic Chemistry T. 45, № 6, стр. 625-629. (2019)
  14. В.А. Чернухин, В.С. Дедков, Д.А. Гончар, М.А. Абдурашитов, А.Г. Акишев, Т.Н. Наякшина, Е.Н. Ломаковская, С.Х. Дегтярев Сравнение субстратной специфичности рекомбинантной сайт-специфической метилзависимой ДНК-эндонуклеазы GlaI и нативного фермента, выделенного из штамма Glacial ice bacterium // ДНК-узнающие ферменты , DOI: 10.26213/SE.2019.81.28075 (2019).
  15. А.Г. Акишев, Н.А. Нетесова, М.А. Абдурашитов, И.В. Вихлянов, М.К. Никитин, А.Б. Карпов, С.Х. Дегтярев GlaI-ПЦР анализ метилирования сайта ACGC в хp11: 65647266 в препаратах ДНК клеток крови в норме и на ранних стадиях рака молочной железы // Эпигенетическая ДНК диагностика, DOI: 10.26213/SE.2019.66.12.001 (2019).
  18. Сторонняя публикация Susan M Mitchell, Keith N Rand, Zheng-Zhou Xu, Thu Ho, Glenn S Brown, Jason P Ross, Peter L Molloy Helper-Dependent Chain Reaction (HDCR) for Selective Amplification of Methylated DNA Sequences // Methods Mol Biol (2018)
  19. Сторонняя публикация Yueying Sun, Yuanyuan Sun, Weimin Tian, Chenghui Liu, * Kejian Gao and Zhengping L A novel restriction endonuclease GlaI for rapid and highly sensitive detection of DNA methylation coupled with isothermal exponential amplification reaction // Chemical Science, 9, pp.1344-1351 (2018)
  24. А.А. Евдокимов, Н.А. Нетесова, Н.А. Сметанникова, М.А. Абдурашитов, А.Г. Акишев, Е.С. Давидович, В.В. Кузнецов, Ю.Д. Ермолаев, А.Б. Карпов, А.Э. Сазонов, Р.М. Тахауов, С.Х. Дегтярев Применение метода GLAD-ПЦР анализа для выявления сайтов метилирования в регуляторных областях генов-онкосупрессоров ELMO1 и ESR1 при колоректальном раке // Вопросы онкологии, №1, стр. 116-120. (2016)
  30. М.А. Абдурашитов, А.Н. Куксова, А.Г. Акишев, Е.В. Землянская, С.Х. Дегтярев MteI-ПЦР-анализ-новый метод определения статуса метилирования GC-богатых регуляторных участков генов-онкосупрессоров человека. // Вестник биотехнологии и физико-химической биологии имени Ю. А. Овчинникова, Т. 9 , № 3 ,с. 15-23 (2013).
  31. Сторонняя публикация Keith N. Rand, Graeme P. Young, Thu Ho and Peter L. Molloy Sensitive and selective amplification of methylated DNA sequences using helper-dependent chain reaction in combination with a methylationdependent restriction enzymes. // Nucleic Acids Research, pp. 1-10 (2012).
  32. Сторонняя публикация F. Syeda, R.L. Fagan, M. Wean, G.V. Awakumov, J.R. Walker, S. Xue, S. Dhe-Paganon, & C. Brenner The RFTS Domain is a DNA-competitive Inhibitor of Dnmt1 // , JBC, v. 286, pp. 15344-15351 (2011).
  34. Сторонняя публикация Kravets AP, Mousseau TA, Litvinchuk AV, Ostermiller Sh, Vengen GS, Grodzinski DM Changes in wheat DNA methylation pattern after chronic seed gamma-irradiation. // Tsitol Genet. 2010 Sep-Oct;44(5):18-22. Russian.
  37. Д.А. Гончар, А.Г. Акишев, С.Х. Дегтярев. Способ определения гиперметилированных CpG островков в области генов-супрессоров опухолевого роста в ДНК человека. // Патент на изобретение RU 2413773 С1 (2009).
  41. Ю.Э. Томилова, В.А. Чернухин, С.Х. Дегтярев Зависимость активности сайт-специфической эндонуклеазы GlaI от количества и положения метилированных цитозинов в узнаваемой последовательности 5′-GCGC-3′. // Вестник биотехнологии и физико-химической биологии имени Ю.А.Овчинникова, т.2, №1 (2006) с. 30-39.
  42. В.А. Чернухин, Т.Н. Наякшина, Н.В. Мезенцева, Ю.Э. Томилова, С.Х. Дегтярев, В.С. Дедков Штамм бактерий Glacial ice bacterium I - продуцент эндонуклеазы рестрикции Gla I // Патент на изобретение RU 2287012 С1 (2005).

Чувствительность к метилированию

Блокирование активности рестриктаз при полном или частичном перекрывании их сайтов узнавания метилированием

Рестриктаза Сайт узнавания Прототип Блокирование рестриктазы при полном или частичном перекрывании сайта узнавания метилированием
сопряжённой ДНК-метилазой dam
Gm6ATC		 dcm
Cm5CWGG		 M.SssI
m5CG
Aat II
5'… GACGT▼C …3'
3'… C▲TGCAG …5'
 AatII G(m6A)CGTC      
Abs I
5'… CC▼TCGAGG …3'
3'… GGAGCT▲CC …5'
 AbsI        
Acc16 I
5'… TGC▼GCA …3'
3'… ACG▲CGT …5'
 MstI        
Acc36 I
5'… ACCTGC(N)4▼ …3'
3'… TGGACG(N)8▲ …5'
 BspMI        
Acc65 I
5'… G▼GTACC …3'
3'… CCATG▲G …5'
 KpnI     +  
AccB1 I
5'… G▼GYRCC …3'
3'… CCRYG▲G …5'
 HgiCI        
AccB7 I
5'… CCANNNN▼NTGG …3'
3'… GGTN▲NNNNACC …5'
 PflMI     +  
AccBS I
5'… GAG▼CGG …3'
3'… CTC▲GCC …5'
 BsrBI        
Acl I
5'… AA▼CGTT …3'
3'… TTGC▲AA …5'
 AclI       +
AclW I
5'… GGATC(N)4▼ …3'
3'… CCTAG(N)5▲ …5'
 BinI   +    
Aco I
5'… Y▼GGCCR …3'
3'… RCCGG▲Y …5'
 CfrI     +  
Acs I
5'… R▼AATTY …3'
3'… YTTAA▲R …5'
 ApoI        
Acu I
5'… CTGAAG(N)16▼ …3'
3'… GACTTC(N)14▲ …5'
 Eco57I        
Afe I
5'… AGC▼GCT …3'
3'… TCG▲CGA …5'
 Eco47III        
Ags I
5'… TTS▼AA …3'
3'… AA▲STT …5'
 AgsI TTSA(m6A)      
Ahl I
5'… A▼CTAGT …3'
3'… TGATC▲A …5'
 SpeI        
Ajn I
5'… ▼CCWGG …3'
3'… GGWCC▲ …5'
 EcoRII (m5C)CWGG   —  
Ale I
5'… CACNN▼NNGTG …3'
3'… GTGNN▲NNCAC …5'
 OliI        
Alu I
5'… AG▼CT …3'
3'… TC▲GA …5'
 AluI AG(m5C)T      
AluB I
5'… AG▼CT …3'
3'… TC▲GA …5'
 AluI (m6A)GCT      
Ama87 I
5'… C▼YCGRG …3'
3'… GRGCY▲C …5'
 AvaI        
Aox I
5'… ▼RG(5mC)Y …3'
3'… Y(5mC)GR▲ …5'
 AoxI        
Apa I
5'… GGGCC▼C …3'
3'… C▲CCGGG …5'
 ApaI     +  
Ars I
5'… ▼(N)8GACNNNNNNTTYG(N)11▼ …3'
3'… ▲(N)13CTGNNNNNNAARC(N)6▲ …5'
 ArsI        
AsiG I
5'… A▼CCGGT …3'
3'… TGGCC▲A …5'
 AgeI        
AsiS I
5'… GCGAT▼CGC …3'
3'… CGC▲TAGCG …5'
 #Н/Д   —   +
AspA2 I
5'… C▼CTAGG …3'
3'… GGATC▲C …5'
 AvrII        
AspLE I
5'… GCG▼C …3'
3'… C▲GCG …5'
 HhaI       +
AspS9 I
5'… G▼GNCC …3'
3'… CCNG▲G …5'
 Sau96I     +  
AsuC2 I
5'… CC▼SGG …3'
3'… GGS▲CC …5'
 CauII        
AsuHP I
5'… GGTGA(N)8▼ …3'
3'… CCACT(N)7▲ …5'
 HphI   +    
AsuNH I
5'… G▼CTAGC …3'
3'… CGATC▲G …5'
 NheI        
BamH I
5'… G▼GATCC …3'
3'… CCTAG▲G …5'
 BamHI GGAT(m4C)C —    
Bar I
5'… ▼(N)7GAAGNNNNNNTAC(N)12▼ …3'
3'… ▲(N)12CTTCNNNNNNATG(N)7▲ …5'
 BarI        
Bbv12 I
5'… GWGCW▼C …3'
3'… C▲WCGWG …5'
 HgiAI        
Bgl I
5'… GCCNNNN▼NGGC …3'
3'… CGGN▲NNNNCCG …5'
 BglI     —  
Bgl II
5'… A▼GATCT …3'
3'… TCTAG▲A …5'
 BglII   —    
Bls I Неверный формат сайта узнавания BlsI        
Bme18 I
5'… G▼GWCC …3'
3'… CCWG▲G …5'
 AvaII     +  
Bmo I
5'… GG▼GWCCC …3'
3'… CCCWG▲GG …5'
 SanDI        
Bmt I
5'… GCTAG▼C …3'
3'… C▲GATCG …5'
 NheI        
Bmu I
5'… ACTGGG(N)5▼ …3'
3'… TGACCC(N)4▲ …5'
 BfiI        
Bpm I
5'… CTGGAG(N)16▼ …3'
3'… GACCTC(N)14▲ …5'
 GsuI        
Bpu10 I
5'… CC▼TNAGC …3'
3'… GGANT▲CG …5'
 Bpu10I        
Bpu14 I
5'… TT▼CGAA …3'
3'… AAGC▲TT …5'
 AsuII        
Bsa29 I
5'… AT▼CGAT …3'
3'… TAGC▲TA …5'
 ClaI   +    
Bsc4 I
5'… CCNNNNN▼NNGG …3'
3'… GGNN▲NNNNNCC …5'
 BsiYI        
Bse1 I
5'… ACTGGN▼ …3'
3'… TGAC▲CN …5'
 BsrI        
Bse118 I
5'… R▼CCGGY …3'
3'… YGGCC▲R …5'
 Cfr10I        
Bse21 I
5'… CC▼TNAGG …3'
3'… GGANT▲CC …5'
 SauI        
Bse3D I
5'… GCAATGNN▼ …3'
3'… CGTTAC▲NN …5'
 BsrDI        
Bse8 I
5'… GATNN▼NNATC …3'
3'… CTANN▲NNTAG …5'
 BsaBI        
BseP I
5'… G▼CGCGC …3'
3'… CGCGC▲G …5'
 BsePI        
BseX3 I
5'… C▼GGCCG …3'
3'… GCCGG▲C …5'
 XmaIII        
BslF I
5'… GGGAC(N)10▼ …3'
3'… CCCTG(N)14▲ …5'
 FinI        
Bso31 I
5'… GGTCTCN▼ …3'
3'… CCAGAG(N)5▲ …5'
 Eco31I        
Bsp13 I
5'… T▼CCGGA …3'
3'… AGGCC▲T …5'
 BspMII   +    
Bsp1720 I
5'… GC▼TNAGC …3'
3'… CGANT▲CG …5'
 EspI        
Bsp19 I
5'… C▼CATGG …3'
3'… GGTAC▲C …5'
 NcoI (m4C)CATGG(m5C)CATGG/GGTAC(m5C)      
BspAC I
5'… C▼CGC …3'
3'… GGC▲G …5'
 AciI       +
BspFN I
5'… CG▼CG …3'
3'… GC▲GC …5'
 FnuDII       +
BssEC I
5'… C▼CNNGG …3'
3'… GGNNC▲C …5'
 SecI (m4C)CNNGG      
BssNA I
5'… GTA▼TAC …3'
3'… CAT▲ATG …5'
 SnaI        
BssT1 I
5'… C▼CWWGG …3'
3'… GGWWC▲C …5'
 StyI        
Bst2B I
5'… C▼TCGTG …3'
3'… GAGCA▲C …5'
 BsiI        
Bst2U I
5'… CC▼WGG …3'
3'… GGW▲CC …5'
 BstNI     —  
Bst4C I
5'… ACN▼GT …3'
3'… TG▲NCA …5'
 Tsp4CI        
Bst6 I
5'… CTCTTCN▼ …3'
3'… GAGAAG(N)4▲ …5'
 Ksp632I        
BstAC I
5'… GR▼CGYC …3'
3'… CYGC▲RG …5'
 AcyI        
BstAF I
5'… C▼TTAAG …3'
3'… GAATT▲C …5'
 AflII        
BstAP I
5'… GCANNNN▼NTGC …3'
3'… CGTN▲NNNNACG …5'
 (ApaBI)        
BstAU I
5'… T▼GTACA …3'
3'… ACATG▲T …5'
 Bsp1407I        
BstBA I
5'… YAC▼GTR …3'
3'… RTG▲CAY …5'
 BsaAI       +
BstC8 I
5'… GCN▼NGC …3'
3'… CGN▲NCG …5'
 Cac8I G(m5C)NNGC      
BstDE I
5'… C▼TNAG …3'
3'… GANT▲C …5'
 DdeI        
BstDS I
5'… C▼CRYGG …3'
3'… GGYRC▲C …5'
 DsaI        
BstEN I
5'… CCTNN▼NNNAGG …3'
3'… GGANNN▲NNTCC …5'
 EcoNI     —  
BstF5 I
5'… GGATGNN▼ …3'
3'… CCTAC▲NN …5'
 (FokI)        
BstFN I
5'… CG▼CG …3'
3'… GC▲GC …5'
 FnuDII       +
BstH2 I
5'… RGCGC▼Y …3'
3'… Y▲CGCGR …5'
 HaeII        
BstHH I
5'… GCG▼C …3'
3'… C▲GCG …5'
 HhaI       +
BstKT I
5'… GAT▼C …3'
3'… C▲TAG …5'
 MboI   +    
BstMA I
5'… GTCTCN▼ …3'
3'… CAGAG(N)5▲ …5'
 BsmAI        
BstMB I
5'… ▼GATC …3'
3'… CTAG▲ …5'
 MboI   +    
BstMC I
5'… CGRY▼CG …3'
3'… GC▲YRGC …5'
 McrI        
BstMW I
5'… GCNNNNN▼NNGC …3'
3'… CGNN▲NNNNNCG …5'
 MwoI G(m5C)NNNNNNNGC      
BstNS I
5'… RCATG▼Y …3'
3'… Y▲GTACR …5'
 NspI        
BstPA I
5'… GACNN▼NNGTC …3'
3'… CTGNN▲NNCAG …5'
 PshAI        
BstSC I
5'… ▼CCNGG …3'
3'… GGNCC▲ …5'
 ScrFI     +  
BstSF I
5'… C▼TRYAG …3'
3'… GAYRT▲C …5'
 SfeI        
BstSL I
5'… GKGCm▼C …3'
3'… C▲mCGKG …5'
 BseSI GKG(m5C)MC   —  
BstSN I
5'… TAC▼GTA …3'
3'… ATG▲CAT …5'
 SnaBI        
BstV1 I
5'… GCAGC(N)8▼ …3'
3'… CGTCG(N)12▲ …5'
 BbvI        
BstV2 I
5'… GAAGAC(N)2▼ …3'
3'… CTTCTG(N)6▲ …5'
 BbvII        
BstX I
5'… CCANNNNN▼NTGG …3'
3'… GGTN▲NNNNNACC …5'
 BstXI        
BstX2 I
5'… R▼GATCY …3'
3'… YCTAG▲R …5'
 XhoII   —    
Bsu I
5'… GTATCC(N)6▼ …3'
3'… CATAGG(N)5▲ …5'
 BciVI        
BsuR I
5'… GG▼CC …3'
3'… CC▲GG …5'
 HaeIII        
Btr I
5'… CAC▼GTC …3'
3'… GTG▲CAG …5'
 BtrI        
Cci I
5'… T▼CATGA …3'
3'… AGTAC▲T …5'
 BspHI        
CciN I
5'… GC▼GGCCGC …3'
3'… CGCCGG▲CG …5'
 NotI       +
Dra I
5'… TTT▼AAA …3'
3'… AAA▲TTT …5'
 AhaIII        
Dra III
5'… CACNNN▼GTG …3'
3'… GTG▲NNNCAC …5'
 DraIII        
Dri I
5'… GACNNN▼NNGTC …3'
3'… CTGNN▲NNNCAG …5'
 Eam1105I        
DseD I
5'… GACNNNN▼NNGTC …3'
3'… CTGNN▲NNNNCAG …5'
 DrdI        
EcoICR I
5'… GAG▼CTC …3'
3'… CTC▲GAG …5'
 SacI        
EcoR I
5'… G▼AATTC …3'
3'… CTTAA▲G …5'
 EcoRI GA(m6A)TTC      
EcoR V
5'… GAT▼ATC …3'
3'… CTA▲TAG …5'
 EcoRV        
Ege I
5'… GGC▼GCC …3'
3'… CCG▲CGG …5'
 NarI        
Emi I
5'… CTCTTC(N)1▼ …3'
3'… GAGAAG(N)4▲ …5'
 Ksp632I        
Erh I
5'… C▼CWWGG …3'
3'… GGWWC▲C …5'
 StyI        
Fae I
5'… CATG▼ …3'
3'… ▲GTAC …5'
 NlaIII C(m6A)TG      
Fai I
5'… YA▼TR …3'
3'… RT▲AY …5'
 FaiI        
Fal I
5'… ▼(N)8AAGNNNNNCTT(N)13▼ …3'
3'… ▲(N)13TTCNNNNNGAA(N)8▲ …5'
 FalI        
Fat I
5'… ▼CATG …3'
3'… GTAC▲ …5'
 NlaIII (m5C)ATG      
Fau I
5'… CCCGC(N)4▼ …3'
3'… GGGCG(N)6▲ …5'
 FauI       +
FauND I
5'… CA▼TATG …3'
3'… GTAT▲AC …5'
 NdeI        
Fbl I
5'… GT▼mKAC …3'
3'… CAKm▲TG …5'
 AccI        
Fok I
5'… GGATG(N)9▼ …3'
3'… CCTAC(N)13▲ …5'
 FokI        
FriO I
5'… GRGCY▼C …3'
3'… C▲YCGRG …5'
 BanII        
Fsp4H I
5'… GC▼NGC …3'
3'… CGN▲CG …5'
 Fnu4HI G(m5C)NGC      
Gla I
5'… R(5mC)▼GY …3'
3'… YG▲(5mC)R …5'
 GlaI        
Glu I
5'… G(5mC)▼NG(5mC) …3'
3'… (5mC)GN▲(5mC)G …5'
 GluI        
Gsa I
5'… CCCAG▼C …3'
3'… G▲GGTCG …5'
 BseYI        
Hae III
5'… GG▼CC …3'
3'… CC▲GG …5'
 HaeIII GG(m5C)C      
Hga I
5'… GACGC(N)5▼ …3'
3'… CTGCG(N)10▲ …5'
 HgaI       +
Hind II
5'… GTY▼RAC …3'
3'… CAR▲YTG …5'
 HindII        
Hind III
5'… A▼AGCTT …3'
3'… TTCGA▲A …5'
 HindIII        
Hinf I
5'… G▼ANTC …3'
3'… CTNA▲G …5'
 HinfI        
Hpa I
5'… GTT▼AAC …3'
3'… CAA▲TTG …5'
 HpaI       +
Hpa II
5'… C▼CGG …3'
3'… GGC▲C …5'
 HpaII C(m5C)GG
а так же MspI-метилированием:(m5C)CGG		     +
HpySE526 I
5'… A▼CGT …3'
3'… TGC▲A …5'
 MaeII        
HspA I
5'… G▼CGC …3'
3'… CGC▲G …5'
 HhaI       +
Kpn I
5'… GGTAC▼C …3'
3'… C▲CATGG …5'
 KpnI     —  
Kro I
5'… G▼C(5mC)GGC …3'
3'… CGG(5mC)C▲G …5'
 KroI        
KroN I
5'… GCC▼GGC …3'
3'… CGG▲CCG …5'
 NaeI       +
Ksp22 I
5'… T▼GATCA …3'
3'… ACTAG▲T …5'
 BclI   +    
Kzo9 I
5'… ▼GATC …3'
3'… CTAG▲ …5'
 MboI   —   + GAT(m5C)G
Lmn I
5'… GCTCCN▼ …3'
3'… CGAG▲GN …5'
 LmnI        
Mab I
5'… A▼CCWGGT …3'
3'… TGGWCC▲A …5'
 SexAI     —  
Mal I
5'… G(mA)▼TC …3'
3'… CT▲(mA)G …5'
 DpnI        
Mbo II
5'… GAAGA(N)8▼ …3'
3'… CTTCT(N)7▲ …5'
 MboII   +    
Mfe I
5'… C▼AATTG …3'
3'… GTTAA▲C …5'
 MfeI        
Mhl I
5'… GDGCH▼C …3'
3'… C▲HCGDG …5'
 SduI        
Mlu I
5'… A▼CGCGT …3'
3'… TGCGC▲A …5'
 MluI        
Mly113 I
5'… GG▼CGCC …3'
3'… CCGC▲GG …5'
 NarI        
Mnl I
5'… CCTC(N)7▼ …3'
3'… GGAG(N)6▲ …5'
 MnlI       +CCT(m5C)G
Mox20 I
5'… TGG▼CCA …3'
3'… ACC▲GGT …5'
 BalI     +  
MroN I
5'… G▼CCGGC …3'
3'… CGGCC▲G …5'
 (NaeI)        
MroX I
5'… GAANN▼NNTTC …3'
3'… CTTNN▲NNAAG …5'
 XmnI        
Msp I
5'… C▼CGG …3'
3'… GGC▲C …5'
 HpaII (m5C)CGG     —
MspA1 I
5'… CmG▼CKG …3'
3'… GKC▲GmC …5'
 NspBII        
MspR9 I
5'… CC▼NGG …3'
3'… GGN▲CC …5'
 ScrFI     +  
Mte I
5'… G(5mC)G(5mC)▼NG(5mC)G(5mC) …3'
3'… (5mC)G(5mC)GN▲(5mC)G(5mC)G …5'
 Mte        
Nru I
5'… TCG▼CGA …3'
3'… AGC▲GCT …5'
 NruI   +    
PalA I
5'… GG▼CGCGCC …3'
3'… CCGCGC▲GG …5'
 AscI       +
Pce I
5'… AGG▼CCT …3'
3'… TCC▲GGA …5'
 StuI        
Pci I
5'… A▼CATGT …3'
3'… TGTAC▲A …5'
 BspLU11I (m6A)CATGT      
PciS I
5'… GCTCTTCN▼ …3'
3'… CGAGAAG(N)4▲ …5'
 SapI        
Pcs I
5'… (5mC)GNNNNN▼NN(5mC)G …3'
3'… G(5mC)NN▲NNNNNG(5mC) …5'
 PcsI        
Pct I
5'… GAATGCN▼ …3'
3'… CTTAC▲GN …5'
 BsmI        
Pec I
5'… TTA▼TAA …3'
3'… AAT▲ATT …5'
 PsiI        
Pkr I
5'… G(5mC)N▼G(5mC) …3'
3'… (5mC)G▲N(5mC)G …5'
 PkrI        
Ple19 I
5'… CGAT▼CG …3'
3'… GC▲TAGC …5'
 PvuI   —    
Pps I
5'… GAGTC(N)4▼ …3'
3'… CTCAG(N)5▲ …5'
 PleI        
Pse31 I
5'… GGTCTC(N)1▼ …3'
3'… CCAGAG(N)5▲ …5'
 Eco31I        
Psi I
5'… TTA▼TAA …3'
3'… AAT▲ATT …5'
 PsiI        
Psp124B I
5'… GAGCT▼C …3'
3'… C▲TCGAG …5'
 SacI        
Psp6 I
5'… ▼CCWGG …3'
3'… GGWCC▲ …5'
 EcoRII   +    
PspC I
5'… CAC▼GTG …3'
3'… GTG▲CAC …5'
 PmaCI        
PspE I
5'… G▼GTNACC …3'
3'… CCANTG▲G …5'
 BstEII        
PspL I
5'… C▼GTACG …3'
3'… GCATG▲C …5'
 SplI        
PspN4 I
5'… GGN▼NCC …3'
3'… CCN▲NGG …5'
 NlaIV GGNN(m5C)C      
PspOM I
5'… G▼GGCCC …3'
3'… CCCGG▲G …5'
 (ApaI)        
PspPP I
5'… RG▼GWCCY …3'
3'… YCCWG▲GR …5'
 PpuMI     +  
PspX I
5'… VC▼TCGAGB …3'
3'… BGAGCT▲CV …5'
 PspXI        
Psr I
5'… ▼(N)7GAACNNNNNNTAC(N)12▼ …3'
3'… ▲(N)12CTTGNNNNNNATG(N)7▲ …5'
 PsrI        
Pst I
5'… CTGCA▼G …3'
3'… G▲ACGTC …5'
 PstI        
PstN I
5'… CAGNNN▼CTG …3'
3'… GTC▲NNNGAC …5'
 AlwNI        
Pvu II
5'… CAG▼CTG …3'
3'… GTC▲GAC …5'
 PvuII        
Rga I
5'… GCGAT▼CGC …3'
3'… CGC▲TAGCG …5'
 SgfI   —    
Rig I
5'… GGCCGG▼CC …3'
3'… CC▲GGCCGG …5'
 FseI GG(m5C)CGGCC     +
Rsa I
5'… GT▼AC …3'
3'… CA▲TG …5'
 RsaI        
RsaN I
5'… G▼TAC …3'
3'… CAT▲G …5'
 RsaI        
Rsr2 I
5'… CG▼GWCCG …3'
3'… GCCWG▲GC …5'
 RsrII        
Sal I
5'… G▼TCGAC …3'
3'… CAGCT▲G …5'
 SalI        
Sbf I
5'… CCTGCA▼GG …3'
3'… GG▲ACGTCC …5'
 Sse8387I        
Set I
5'… ASST▼ …3'
3'… ▲TSSA …5'
 SetI        
SfaN I
5'… GCATC(N)5▼ …3'
3'… CGTAG(N)9▲ …5'
 SfaNI        
Sfi I
5'… GGCCNNNN▼NGGCC …3'
3'… CCGGN▲NNNNCCGG …5'
 SfiI     +GGC(m5C)WGGNNGGCC  
Sfr274 I
5'… C▼TCGAG …3'
3'… GAGCT▲C …5'
 XhoI CTCG(m6A)G      
Sfr303 I
5'… CCGC▼GG …3'
3'… GG▲CGCC …5'
 SacII        
Sma I
5'… CCC▼GGG …3'
3'… GGG▲CCC …5'
 SmaI        
Smi I
5'… ATTT▼AAAT …3'
3'… TAAA▲TTTA …5'
 SwaI        
SmiM I
5'… CAYNN▼NNRTG …3'
3'… GTRNN▲NNYAC …5'
 MslI        
Sph I
5'… GCATG▼C …3'
3'… C▲GTACG …5'
 SphI        
Sse9 I
5'… ▼AATT …3'
3'… TTAA▲ …5'
 Tsp509I A(m6A)TT      
Ssp I
5'… AAT▼ATT …3'
3'… TTA▲TAA …5'
 SspI A(m6A)TATT      
SspM I
5'… C▼TAG …3'
3'… GAT▲C …5'
 BfaI        
Taq I
5'… T▼CGA …3'
3'… AGC▲T …5'
 TaqI        
Tru9 I
5'… T▼TAA …3'
3'… AAT▲T …5'
 MseI TTA(m6A)      
TseF I
5'… ▼GTSAC …3'
3'… CASTG▲ …5'
 Tsp45I        
Tth111 I
5'… GACN▼NNGTC …3'
3'… CTGNN▲NCAG …5'
 Tth111I        
Vne I
5'… G▼TGCAC …3'
3'… CACGT▲G …5'
 ApaLI        
Vsp I
5'… AT▼TAAT …3'
3'… TAAT▲TA …5'
 VspI ATTA(m6A)T      
Xba I
5'… T▼CTAGA …3'
3'… AGATC▲T …5'
 XbaI   +    
Xma I
5'… C▼CCGGG …3'
3'… GGGCC▲C …5'
 XmaI        
Zra I
5'… GAC▼GTC …3'
3'… CTG▲CAG …5'
 (AatII)        
Zrm I
5'… AGT▼ACT …3'
3'… TCA▲TGA …5'
 ScaI        
Zsp2 I
5'… ATGCA▼T …3'
3'… T▲ACGTA …5'
 NsiI        
+ — блокирование активности; — — отсутствие блокирования по данным исходной таблицы; пустая ячейка — данных нет.
// Код для некролога